轉(zhuǎn)TsVP提高玉米低磷耐受性的研究及不同玉米基因型低磷響應(yīng)microRNA的差異分析
發(fā)布時(shí)間:2021-12-24 00:31
磷是植物生長(zhǎng)發(fā)育不可缺少的大量營(yíng)養(yǎng)元素之一。然而土壤有效磷濃度很低,遠(yuǎn)不能滿足植物獲取充足磷營(yíng)養(yǎng)的需求。玉米是重要的糧食、飼料和能源作物。土壤有效磷不足是限制玉米產(chǎn)量的重要因素。向土壤中大量施加磷肥能減少有效磷不足造成的產(chǎn)量損失,但是磷肥投入不僅大大增加生產(chǎn)成本,而且嚴(yán)重污染環(huán)境。因此深入研究玉米耐低磷機(jī)制,發(fā)展耐低磷玉米品種,增加玉米在低磷條件下的產(chǎn)量,地農(nóng)業(yè)、經(jīng)濟(jì)和環(huán)境都有重要的意義。轉(zhuǎn)TsVP提高玉米低磷耐受性的研究通過植物基因工程的手段將有價(jià)值的基因轉(zhuǎn)入玉米是發(fā)展耐低磷玉米品種的重要途徑。許多研究表明超表達(dá)氫離子焦磷酸酶(H+-PPase)基因能夠在多種植物中促進(jìn)植物根系生長(zhǎng)發(fā)育并能提高植物的抗逆性。在高等植物中,根系是植物吸收礦質(zhì)營(yíng)養(yǎng)的主要器官,尤其磷素在土壤中的移動(dòng)性很低,所以根系的生長(zhǎng)發(fā)育和形態(tài)結(jié)構(gòu)對(duì)捕獲吸收土壤磷素和提高植物耐低磷能力尤為重要。因此為了探索H+-PPase能否提高玉米的耐低磷能力,本工作中我們選用玉米自交系DH4866以及其轉(zhuǎn)鹽芥H+-PPase基因(TsVP)玉米為實(shí)驗(yàn)材料,比較兩者的耐低磷能力以及在低磷條件下的產(chǎn)量,以期得到耐低磷能力提高的轉(zhuǎn)基因玉米...
【文章來源】:山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:159 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
符號(hào)說明
第一部分 前言
1.1 土壤磷資源現(xiàn)狀
1.2 磷對(duì)植物生長(zhǎng)發(fā)育的作用
1.3 植物低磷響應(yīng)的生理生化機(jī)制
1.3.1 磷動(dòng)員和吸收能力的提高
1.3.1.1 外泌有機(jī)酸和質(zhì)子
1.3.1.2 酸性磷酸酶合成增加
1.3.1.3 磷吸收能力的提高
1.3.2 植物體內(nèi)磷分配的改變
1.3.3 代謝反應(yīng)的調(diào)整
1.3.4 根系形態(tài)結(jié)構(gòu)的變化
1.4 植物低磷響應(yīng)的分子機(jī)制
1.4.1 植物磷吸收相關(guān)基因及調(diào)控
1.4.2 植物體內(nèi)磷分配相關(guān)基因及調(diào)控
1.4.3 有機(jī)酸和酸性磷酸酶合成和分泌相關(guān)基因及調(diào)控
1.4.4 植物根系形態(tài)結(jié)構(gòu)的調(diào)控
1.4.5 植物低磷反應(yīng)的基因表達(dá)調(diào)控
1.4.6 植物低磷信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)機(jī)制研究進(jìn)展
1.4.6.1 以PHR1為中心的低磷信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑
1.4.6.2 與SPX結(jié)構(gòu)域基因相關(guān)的低磷信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑
1.4.6.3 低磷信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑與激素等信號(hào)途徑的關(guān)系
1.5 H~+-PPase及相關(guān)基因工程的研究進(jìn)展
1.5.1 液泡膜H~+-PPase的分子結(jié)構(gòu)與功能
1.5.1.1 H~+-PPase的分子結(jié)構(gòu)
1.5.1.2 H~+-PPase的主要功能
1.5.2 H~+-PPase與植物抗逆的研究進(jìn)展
1.6 MicroRNA研究進(jìn)展
1.6.1 miRNA的生物合成
1.6.1.1 miRNA的轉(zhuǎn)錄
1.6.1.2 miRNA加工運(yùn)輸
1.6.1.3 miRNA進(jìn)入沉默復(fù)合體
1.6.2 miRNA的作用方式
1.6.2.1 miRNA對(duì)靶基因的剪切
1.6.2.2 miRNA對(duì)靶基因的翻譯抑制作用
1.6.3 miRNA在植物體中的功能
1.6.3.1 miRNA參與花器官發(fā)育
1.6.3.2 miRNA參與葉片發(fā)育
1.6.3.3 miRNA參與植物低磷響應(yīng)過程
1.7 本研究的目的及意義
第二部分 轉(zhuǎn)TsVP提高玉米低磷耐受性的研究
2.1 材料與方法
2.1.1 植物材料
2.1.2 轉(zhuǎn)基因玉米T2代純合株系的分子生物學(xué)檢測(cè)
2.1.2.1 PCR檢測(cè)
2.1.2.2 半定量RT-PCR
2.1.2.3 Southern雜交檢測(cè)
2.1.3 植物材料培養(yǎng)
2.1.4 TsVP基因表達(dá)強(qiáng)度的檢測(cè)
2.1.4.1 RNA提取及反轉(zhuǎn)錄
2.1.4.2 Real time PCR反應(yīng)
2.1.5 液泡膜H-PPase活性的測(cè)定
2.1.5.1 液泡膜的分離
2.1.5.2 液泡膜H-PPase活性測(cè)定
2.1.6 植株生物量和磷含量的測(cè)定
2.1.7 磷吸收動(dòng)力學(xué)參數(shù)的測(cè)定
2.1.8 根系形態(tài)參數(shù)的測(cè)定
2.1.9 酸性磷酸酶活性測(cè)定
2.1.9.1 細(xì)胞內(nèi)酸性磷酸酶活性測(cè)定
2.1.9.2 分泌型酸性磷酸酶活性測(cè)定
2.1.10 根系有機(jī)酸分泌速率測(cè)定
2.1.11 玉米根際pH值測(cè)定
2.1.12 質(zhì)膜ATPase活性檢測(cè)
2.1.13 可溶性糖測(cè)定
2.1.14 IAA含量測(cè)定
2.1.15 生長(zhǎng)素運(yùn)輸相關(guān)基因表達(dá)測(cè)定
2.1.16 土壤培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)
2.1.17 光合作用和葉綠素?zé)晒鈪?shù)測(cè)定
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 轉(zhuǎn)TsVP玉米T2代純合株系的分子生物學(xué)檢測(cè)
2.2.2 轉(zhuǎn)基因玉米有較高的液泡膜H-PPase活性
2.2.3 低磷脅迫對(duì)玉米生長(zhǎng)的影響
2.2.4 轉(zhuǎn)基因玉米有較發(fā)達(dá)的根系系統(tǒng)
2.2.5 轉(zhuǎn)基因玉米有較高的磷吸收的速率
2.2.6 轉(zhuǎn)基因玉米積累較多的磷
2.2.7 轉(zhuǎn)基因玉米有較強(qiáng)的根際酸化能力
2.2.8 玉米酸性磷酸酶分析
2.2.9 玉米可溶性糖含量分析
2.2.10 玉米生長(zhǎng)素含量分析
2.2.11 玉米生長(zhǎng)素運(yùn)輸相關(guān)基因表達(dá)分析
2.2.12 外源施加IAA和NPA對(duì)非轉(zhuǎn)基因玉米和轉(zhuǎn)基因玉米根系的影響
2.2.13 玉米在低磷土壤中的生長(zhǎng)發(fā)育狀況
2.2.13.1 長(zhǎng)期低磷脅迫對(duì)玉米生長(zhǎng)發(fā)育的影響
2.2.13.2 低磷脅迫對(duì)玉米光合作用的影響
2.2.13.3 低磷脅迫對(duì)玉米雌雄穗發(fā)育的影響
2.2.13.4 低磷脅迫對(duì)玉米廣量的影響
2.3 討論
第三部分 不同供磷水平下耐低磷玉米自交系99038和來源親本Qi319microRNA的差異分析
3.1 材料與方法
3.1.1 植物材料和培養(yǎng)
3.1.2 植株生物量、磷含量和根系形態(tài)參數(shù)的測(cè)定
3.1.3 小RNA文庫(kù)構(gòu)建和測(cè)序
3.1.4 測(cè)序數(shù)據(jù)分析和miRNA鑒定
3.1.5 靶基因鑒定
3.1.6 覽定文庫(kù)間差異表達(dá)的miRNA
3.1.7 通過real-time PCR分析miRNA表達(dá)水平
3.1.7.1 玉米small RNA提取
3.1.7.2 Small RNA 反轉(zhuǎn)錄
3.1.7.3 Real time PCR
3.1.8 通過real-time PCR分析靶基因表達(dá)水平
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 低磷脅迫對(duì)Qi319和99038生長(zhǎng)的影響
3.2.2 玉米小RNA高通量測(cè)序數(shù)據(jù)分析
3.2.3 玉米小RNA長(zhǎng)度分布
3.2.4 玉米小RNA分類
3.2.5 玉米已知miRNA鑒定
3.2.6 玉米novel miRNA鑒定
3.2.7 玉米miRNA靶基因鑒定
3.2.8 不同供磷水平下Qi319和99038間差異表達(dá)的miRNA
3.2.9 玉米低磷響應(yīng)miRNA
3.2.10 通過real-time PCR確認(rèn)miRNA農(nóng)達(dá)水平
3.2.11 miRNA及其靶基因表達(dá)模式分析
3.3 討論
第四部分 總結(jié)和展望
參考文獻(xiàn)
附錄3-1 本工作中鑒定到的玉米已知miRNA及表達(dá)量
附錄3-2 本工作中鑒定到的玉米novel miRNA及表達(dá)量
附錄3-3 玉米novel miRNA候選靶基因
致謝
攻讀博士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文目錄
學(xué)位論文評(píng)閱及答辯情況表
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]擬南芥漆酶基因AtLAC4參與生長(zhǎng)及非生物脅迫響應(yīng)[J]. 張盛春,鞠常亮,王小菁. 植物學(xué)報(bào). 2012(04)
[2]陸地棉耐鹽相關(guān)基因(GhVP)的克隆及分析[J]. 宋麗艷,葉武威,趙云雷,王俊娟,樊保香,王德龍. 棉花學(xué)報(bào). 2010(03)
[3]Identification of MicroRNAs in Wild Soybean (Glycine soja)[J]. Rui Chen, Zheng Hu and Hui Zhang (The National Key Facilities for Crop Genetic Resources and Improvement, Institute of Crop Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China). Journal of Integrative Plant Biology. 2009(12)
[4]Regulation of OsSPX1 and OsSPX3 on Expression of OsSPX Domain Genes and Pi-starvation Signaling in Rice[J]. Zhiye Wang,Han Hu,Hongjie Huang,Ke Duan,Zhongchang Wu and Ping Wu(State Key Laboratory of Plant Physiology and Biochemistry,College of Life Sciences,Zhejiang University,Hangzhou 310058,China). Journal of Integrative Plant Biology. 2009(07)
[5]植物根系形態(tài)對(duì)低磷脅迫應(yīng)答的研究進(jìn)展[J]. 趙華,徐芳森,石磊,王運(yùn)華. 植物學(xué)通報(bào). 2006(04)
[6]作物耐低磷適應(yīng)機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 潘相文,唐才賢,王光華,韓曉增,金劍,李艷華,王國(guó)棟. 吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2005(04)
[7]Molecular evolution of the rice miR395 gene family[J]. Sreelatha GUDDETI,Chuck H. LESEBERG,Mitrick A. JOHNS. Cell Research. 2005(08)
[8]植物磷營(yíng)養(yǎng)高效的分子生物學(xué)研究進(jìn)展[J]. 周志高,汪金舫,周健民. 植物學(xué)通報(bào). 2005(01)
[9]植物根構(gòu)型特性與磷吸收效率[J]. 嚴(yán)小龍,廖紅,戈振揚(yáng),羅錫文. 植物學(xué)通報(bào). 2000(06)
[10]低磷脅迫下菜豆根構(gòu)型性狀的QTL定位[J]. 廖紅,嚴(yán)小龍. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2000(01)
本文編號(hào):3549483
【文章來源】:山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:159 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
符號(hào)說明
第一部分 前言
1.1 土壤磷資源現(xiàn)狀
1.2 磷對(duì)植物生長(zhǎng)發(fā)育的作用
1.3 植物低磷響應(yīng)的生理生化機(jī)制
1.3.1 磷動(dòng)員和吸收能力的提高
1.3.1.1 外泌有機(jī)酸和質(zhì)子
1.3.1.2 酸性磷酸酶合成增加
1.3.1.3 磷吸收能力的提高
1.3.2 植物體內(nèi)磷分配的改變
1.3.3 代謝反應(yīng)的調(diào)整
1.3.4 根系形態(tài)結(jié)構(gòu)的變化
1.4 植物低磷響應(yīng)的分子機(jī)制
1.4.1 植物磷吸收相關(guān)基因及調(diào)控
1.4.2 植物體內(nèi)磷分配相關(guān)基因及調(diào)控
1.4.3 有機(jī)酸和酸性磷酸酶合成和分泌相關(guān)基因及調(diào)控
1.4.4 植物根系形態(tài)結(jié)構(gòu)的調(diào)控
1.4.5 植物低磷反應(yīng)的基因表達(dá)調(diào)控
1.4.6 植物低磷信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)機(jī)制研究進(jìn)展
1.4.6.1 以PHR1為中心的低磷信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑
1.4.6.2 與SPX結(jié)構(gòu)域基因相關(guān)的低磷信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑
1.4.6.3 低磷信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑與激素等信號(hào)途徑的關(guān)系
1.5 H~+-PPase及相關(guān)基因工程的研究進(jìn)展
1.5.1 液泡膜H~+-PPase的分子結(jié)構(gòu)與功能
1.5.1.1 H~+-PPase的分子結(jié)構(gòu)
1.5.1.2 H~+-PPase的主要功能
1.5.2 H~+-PPase與植物抗逆的研究進(jìn)展
1.6 MicroRNA研究進(jìn)展
1.6.1 miRNA的生物合成
1.6.1.1 miRNA的轉(zhuǎn)錄
1.6.1.2 miRNA加工運(yùn)輸
1.6.1.3 miRNA進(jìn)入沉默復(fù)合體
1.6.2 miRNA的作用方式
1.6.2.1 miRNA對(duì)靶基因的剪切
1.6.2.2 miRNA對(duì)靶基因的翻譯抑制作用
1.6.3 miRNA在植物體中的功能
1.6.3.1 miRNA參與花器官發(fā)育
1.6.3.2 miRNA參與葉片發(fā)育
1.6.3.3 miRNA參與植物低磷響應(yīng)過程
1.7 本研究的目的及意義
第二部分 轉(zhuǎn)TsVP提高玉米低磷耐受性的研究
2.1 材料與方法
2.1.1 植物材料
2.1.2 轉(zhuǎn)基因玉米T2代純合株系的分子生物學(xué)檢測(cè)
2.1.2.1 PCR檢測(cè)
2.1.2.2 半定量RT-PCR
2.1.2.3 Southern雜交檢測(cè)
2.1.3 植物材料培養(yǎng)
2.1.4 TsVP基因表達(dá)強(qiáng)度的檢測(cè)
2.1.4.1 RNA提取及反轉(zhuǎn)錄
2.1.4.2 Real time PCR反應(yīng)
2.1.5 液泡膜H-PPase活性的測(cè)定
2.1.5.1 液泡膜的分離
2.1.5.2 液泡膜H-PPase活性測(cè)定
2.1.6 植株生物量和磷含量的測(cè)定
2.1.7 磷吸收動(dòng)力學(xué)參數(shù)的測(cè)定
2.1.8 根系形態(tài)參數(shù)的測(cè)定
2.1.9 酸性磷酸酶活性測(cè)定
2.1.9.1 細(xì)胞內(nèi)酸性磷酸酶活性測(cè)定
2.1.9.2 分泌型酸性磷酸酶活性測(cè)定
2.1.10 根系有機(jī)酸分泌速率測(cè)定
2.1.11 玉米根際pH值測(cè)定
2.1.12 質(zhì)膜ATPase活性檢測(cè)
2.1.13 可溶性糖測(cè)定
2.1.14 IAA含量測(cè)定
2.1.15 生長(zhǎng)素運(yùn)輸相關(guān)基因表達(dá)測(cè)定
2.1.16 土壤培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)
2.1.17 光合作用和葉綠素?zé)晒鈪?shù)測(cè)定
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 轉(zhuǎn)TsVP玉米T2代純合株系的分子生物學(xué)檢測(cè)
2.2.2 轉(zhuǎn)基因玉米有較高的液泡膜H-PPase活性
2.2.3 低磷脅迫對(duì)玉米生長(zhǎng)的影響
2.2.4 轉(zhuǎn)基因玉米有較發(fā)達(dá)的根系系統(tǒng)
2.2.5 轉(zhuǎn)基因玉米有較高的磷吸收的速率
2.2.6 轉(zhuǎn)基因玉米積累較多的磷
2.2.7 轉(zhuǎn)基因玉米有較強(qiáng)的根際酸化能力
2.2.8 玉米酸性磷酸酶分析
2.2.9 玉米可溶性糖含量分析
2.2.10 玉米生長(zhǎng)素含量分析
2.2.11 玉米生長(zhǎng)素運(yùn)輸相關(guān)基因表達(dá)分析
2.2.12 外源施加IAA和NPA對(duì)非轉(zhuǎn)基因玉米和轉(zhuǎn)基因玉米根系的影響
2.2.13 玉米在低磷土壤中的生長(zhǎng)發(fā)育狀況
2.2.13.1 長(zhǎng)期低磷脅迫對(duì)玉米生長(zhǎng)發(fā)育的影響
2.2.13.2 低磷脅迫對(duì)玉米光合作用的影響
2.2.13.3 低磷脅迫對(duì)玉米雌雄穗發(fā)育的影響
2.2.13.4 低磷脅迫對(duì)玉米廣量的影響
2.3 討論
第三部分 不同供磷水平下耐低磷玉米自交系99038和來源親本Qi319microRNA的差異分析
3.1 材料與方法
3.1.1 植物材料和培養(yǎng)
3.1.2 植株生物量、磷含量和根系形態(tài)參數(shù)的測(cè)定
3.1.3 小RNA文庫(kù)構(gòu)建和測(cè)序
3.1.4 測(cè)序數(shù)據(jù)分析和miRNA鑒定
3.1.5 靶基因鑒定
3.1.6 覽定文庫(kù)間差異表達(dá)的miRNA
3.1.7 通過real-time PCR分析miRNA表達(dá)水平
3.1.7.1 玉米small RNA提取
3.1.7.2 Small RNA 反轉(zhuǎn)錄
3.1.7.3 Real time PCR
3.1.8 通過real-time PCR分析靶基因表達(dá)水平
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 低磷脅迫對(duì)Qi319和99038生長(zhǎng)的影響
3.2.2 玉米小RNA高通量測(cè)序數(shù)據(jù)分析
3.2.3 玉米小RNA長(zhǎng)度分布
3.2.4 玉米小RNA分類
3.2.5 玉米已知miRNA鑒定
3.2.6 玉米novel miRNA鑒定
3.2.7 玉米miRNA靶基因鑒定
3.2.8 不同供磷水平下Qi319和99038間差異表達(dá)的miRNA
3.2.9 玉米低磷響應(yīng)miRNA
3.2.10 通過real-time PCR確認(rèn)miRNA農(nóng)達(dá)水平
3.2.11 miRNA及其靶基因表達(dá)模式分析
3.3 討論
第四部分 總結(jié)和展望
參考文獻(xiàn)
附錄3-1 本工作中鑒定到的玉米已知miRNA及表達(dá)量
附錄3-2 本工作中鑒定到的玉米novel miRNA及表達(dá)量
附錄3-3 玉米novel miRNA候選靶基因
致謝
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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]擬南芥漆酶基因AtLAC4參與生長(zhǎng)及非生物脅迫響應(yīng)[J]. 張盛春,鞠常亮,王小菁. 植物學(xué)報(bào). 2012(04)
[2]陸地棉耐鹽相關(guān)基因(GhVP)的克隆及分析[J]. 宋麗艷,葉武威,趙云雷,王俊娟,樊保香,王德龍. 棉花學(xué)報(bào). 2010(03)
[3]Identification of MicroRNAs in Wild Soybean (Glycine soja)[J]. Rui Chen, Zheng Hu and Hui Zhang (The National Key Facilities for Crop Genetic Resources and Improvement, Institute of Crop Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China). Journal of Integrative Plant Biology. 2009(12)
[4]Regulation of OsSPX1 and OsSPX3 on Expression of OsSPX Domain Genes and Pi-starvation Signaling in Rice[J]. Zhiye Wang,Han Hu,Hongjie Huang,Ke Duan,Zhongchang Wu and Ping Wu(State Key Laboratory of Plant Physiology and Biochemistry,College of Life Sciences,Zhejiang University,Hangzhou 310058,China). Journal of Integrative Plant Biology. 2009(07)
[5]植物根系形態(tài)對(duì)低磷脅迫應(yīng)答的研究進(jìn)展[J]. 趙華,徐芳森,石磊,王運(yùn)華. 植物學(xué)通報(bào). 2006(04)
[6]作物耐低磷適應(yīng)機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 潘相文,唐才賢,王光華,韓曉增,金劍,李艷華,王國(guó)棟. 吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2005(04)
[7]Molecular evolution of the rice miR395 gene family[J]. Sreelatha GUDDETI,Chuck H. LESEBERG,Mitrick A. JOHNS. Cell Research. 2005(08)
[8]植物磷營(yíng)養(yǎng)高效的分子生物學(xué)研究進(jìn)展[J]. 周志高,汪金舫,周健民. 植物學(xué)通報(bào). 2005(01)
[9]植物根構(gòu)型特性與磷吸收效率[J]. 嚴(yán)小龍,廖紅,戈振揚(yáng),羅錫文. 植物學(xué)通報(bào). 2000(06)
[10]低磷脅迫下菜豆根構(gòu)型性狀的QTL定位[J]. 廖紅,嚴(yán)小龍. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2000(01)
本文編號(hào):3549483
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