疾病基因的確定是基因組學(xué)從科研走向應(yīng)用的重要步驟,目前已經(jīng)有了大量的相關(guān)研究,其中篩選潛在疾病基因是生物信息學(xué)領(lǐng)域目前的研究熱點(diǎn)。疾病基因的確定流程周期長,需要篩選出潛在疾病基因,進(jìn)行生物實(shí)驗(yàn)來確定疾病基因。傳統(tǒng)的篩選方法,例如定位克隆、全基因組關(guān)聯(lián)分析、連鎖分析等方法存在候選基因數(shù)量多,真正疾病基因少的問題。在篩選潛在疾病基因中,準(zhǔn)確且不遺漏的找出盡可能多的疾病基因是核心問題。本文研究了基因本體和生物通路兩種模式數(shù)據(jù)在篩選潛在疾病基因中的應(yīng)用,分別使用兩種數(shù)據(jù)計(jì)算基因功能相似度,以基因功能相似度為特征應(yīng)用機(jī)器學(xué)習(xí)分類模型,篩選潛在疾病基因。與傳統(tǒng)的方法相比,篩選出的潛在疾病基因數(shù)量更少,能縮短疾病基因確定的時(shí)間周期,降低疾病基因確定的成本。主要工作包括:（1）提出了一種改進(jìn)的基于基因本體識(shí)別疾病基因的方法。現(xiàn)有的方法認(rèn)為“疾病基因會(huì)在基因本體的生物過程分支上聚集”。本文認(rèn)為“疾病基因會(huì)在基因本體的所有分支上聚集”,提出了全分支聚集方法（Full Branch Aggreation,FBA）。在計(jì)算基因本體術(shù)語相似度和基因功能相似度時(shí),使用基因本體的所有分支。在自閉譜系障礙疾病基因數(shù)據(jù)... 

【文章來源】：南華大學(xué)湖南省

【文章頁數(shù)】：62 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第1章 緒論
    1.1 研究背景和意義
        1.1.1 研究背景
        1.1.2 研究意義
    1.2 國內(nèi)外研究現(xiàn)狀
        1.2.1 基于基因本體的方法
        1.2.2 基于生物通路的方法
        1.2.3 其他方法
    1.3 主要研究內(nèi)容
    1.4 本文組織結(jié)構(gòu)
第2章 相關(guān)理論
    2.1 疾病基因識(shí)別
    2.2 基因本體
    2.3 生物通路及Pathcard
第3章 基于基因本體的疾病基因識(shí)別
    3.1 引言
    3.2 技術(shù)流程
        3.2.1 技術(shù)流程
        3.2.2 數(shù)據(jù)集
    3.3 疾病基因的識(shí)別流程
        3.3.1 基因本體術(shù)語相似度計(jì)算
        3.3.2 基于基因本體的基因功能相似度
        3.3.3 基于機(jī)器學(xué)習(xí)的疾病基因分類
    3.4 實(shí)驗(yàn)和結(jié)果分析
        3.4.1 實(shí)驗(yàn)流程
        3.4.2 結(jié)果分析
    3.5 本章小結(jié)
第4章 基于基因關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò)的基因本體術(shù)語擴(kuò)展方法
    4.1 引言
    4.2 技術(shù)流程
        4.2.1 技術(shù)流程
        4.2.2 數(shù)據(jù)集
    4.3 基于生物通路的功能相似度計(jì)算
    4.4 實(shí)驗(yàn)與結(jié)果分析
        4.4.1 實(shí)驗(yàn)流程
        4.4.2 結(jié)果分析
    4.5 本章小結(jié)
第5章 總結(jié)與展望
    5.1 本文工作總結(jié)
    5.2 未來展望
參考文獻(xiàn)
作者攻讀碩士學(xué)位期間的科研成果
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]高血壓家族成員中高血壓發(fā)病危險(xiǎn)因素的研究[J]. 華琦,黃蔚,邢繡榮,馬湘濤,高敬,李梅,劉榮坤,楊崢,顧東風(fēng).  中華流行病學(xué)雜志. 2005(01)

碩士論文
[1]基于復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)可控性的致病基因識(shí)別方法研究[D]. 王婉寧.西安理工大學(xué) 2019
[2]基于蛋白互作網(wǎng)絡(luò)識(shí)別疾病相關(guān)的基因功能模塊[D]. 李晴晴.黑龍江大學(xué) 2019
[3]基于拓?fù)浼罢Z義相似性的生物網(wǎng)絡(luò)疾病模塊挖掘算法研究[D]. �；饦�.安徽大學(xué) 2019
[4]基于生物網(wǎng)絡(luò)的疾病基因的識(shí)別與分析[D]. 吳慧慧.江南大學(xué) 2018
[5]基于邏輯回歸的多數(shù)據(jù)融合鑒別致病基因[D]. 李樂.西安電子科技大學(xué) 2018
[6]基于模塊歸一化及自適應(yīng)跳轉(zhuǎn)隨機(jī)游走的疾病基因預(yù)測[D]. 袁杰.華中師范大學(xué) 2016
[7]基于時(shí)序網(wǎng)絡(luò)的蛋白質(zhì)復(fù)合物挖掘與疾病基因預(yù)測研究[D]. 趙艷麗.華中師范大學(xué) 2015
[8]基于PPI網(wǎng)絡(luò)的疾病候選基因排名方法研究[D]. 黎琦.中南大學(xué) 2014



本文編號(hào)：3206703