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生物醫(yī)學實體網(wǎng)絡中隱含關系挖掘方法研究與應用

發(fā)布時間:2021-04-26 21:51
  近些年,隨著人工智能技術的發(fā)展,不斷涌現(xiàn)的高新技術在各行各業(yè)掀起了層層巨浪,生物信息學領域也在浪潮的推動下日益繁榮。毋庸置疑,處于大數(shù)據(jù)時代,數(shù)據(jù)在生物醫(yī)學領域中占據(jù)著重要的地位。隨著大規(guī)模高通量信息技術的發(fā)展以及當代科研素質的不斷提升,高質量科研成果層出不窮。除此之外,國內外各種科研團隊集中大量精力從文獻中抽取生物醫(yī)學實體關系,并逐漸形成了生物醫(yī)學數(shù)據(jù)庫。但是,目前仍存在兩個顯著的問題亟待解決。首先是由于科研數(shù)據(jù)數(shù)量龐大,各個組織命名規(guī)范不盡相同,致使相同的內容可能被賦予不同的名稱,這對于之后的提取關鍵信息、進行數(shù)據(jù)集成會造成極大的困擾。其次是生物醫(yī)學研究是一個多學科相互聯(lián)系、相互補充的綜合性課題,該課題囊括多個方向的內容,每個方向都在具體實踐或者科研論文方面取得了優(yōu)異的成績,但各個方向幾乎是割裂的,形成了“知識分裂”的現(xiàn)象。因此,為了解決上述提出的問題,本文旨在建立一套完備的數(shù)據(jù)整合標準,將分散的數(shù)據(jù)集融合在一起,之后構造完整的、高效的方法,挖掘出數(shù)據(jù)中所隱含的信息,其實質就是將割裂的多個方向的研究融合成一個體系,進行隱含知識發(fā)現(xiàn),彌補目前生物醫(yī)學研究領域的一個空白,為科研提供嶄新... 

【文章來源】:吉林大學吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:64 頁

【學位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
abstract
第1章 緒論
    1.1 研究背景與意義
    1.2 國內外研究現(xiàn)狀
    1.3 本文主要工作
    1.4 本文組織結構
第2章 相關技術介紹
    2.1 信息網(wǎng)絡相關知識介紹
    2.2 網(wǎng)絡表示學習相關知識介紹
        2.2.1 基礎知識
        2.2.2 代表性模型
    2.3 編碼器-解碼器相關知識介紹
        2.3.1 Seq2Seq模型
        2.3.2 自編碼器
        2.3.3 自編碼器的變種形式
    2.4 生成對抗網(wǎng)絡相關知識介紹
    2.5 有監(jiān)督的分類算法相關知識介紹
    2.6 本章小結
第3章 基于網(wǎng)絡嵌入模型的隱含關系挖掘方法
    3.1 網(wǎng)絡嵌入模型的構建
        3.1.1 基于SDNE和變分自編碼器的網(wǎng)絡嵌入模型
        3.1.2 基于生成對抗網(wǎng)絡的圖表示學習模型
        3.1.3 特征融合
    3.2 樣本選擇策略
    3.3 分類算法的選擇
    3.4 本章小結
第4章 實驗與應用
    4.1 實驗環(huán)境
    4.2 評價指標
    4.3 在benchmark數(shù)據(jù)集上的實驗與分析
        4.3.1 數(shù)據(jù)集介紹
        4.3.2 實驗設計與實驗分析
    4.4 在生物醫(yī)學實體網(wǎng)絡上的實驗結果分析與應用
        4.4.1 數(shù)據(jù)預處理
        4.4.2 實驗設計與實驗分析
        4.4.3 在PubMed中的實際應用
    4.5 本章小結
第5章 總結與展望
參考文獻
作者簡介及在學期間所取得的科研成果
致謝


【參考文獻】:
期刊論文
[1]BERST: An Engine and Tool for Exploring Biomedical Entities and Relationships[J]. BAI Tian,GE Yan,YANG Changqing,LIU Xiaohua,GONG Leiguang,WANG Ye,HUANG Lan.  Chinese Journal of Electronics. 2019(04)
[2]精準醫(yī)學可改變醫(yī)療健康基本概念[J]. 陳潤生.  中國戰(zhàn)略新興產(chǎn)業(yè). 2017(Z1)
[3]復雜網(wǎng)絡鏈路預測[J]. 呂琳媛.  電子科技大學學報. 2010(05)

博士論文
[1]藥物互作數(shù)據(jù)的挖掘與預測研究[D]. 胡姍姍.安徽大學 2019

碩士論文
[1]基于深度協(xié)同過濾模型的致病基因預測方法研究[D]. 賀語盈.廈門大學 2018
[2]基于核心—附件的蛋白質復合物識別算法研究[D]. 梁靜.陜西師范大學 2018



本文編號:3162176

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