基于自編碼先驗(yàn)信息的高欠采樣磁共振成像重建
發(fā)布時(shí)間:2021-04-04 00:54
從高度欠采樣的磁共振采樣數(shù)據(jù)重建出高質(zhì)量的圖像一直是磁共振成像(Magnetic Resonance Imaging,MRI)中的熱點(diǎn)問(wèn)題,這對(duì)于減少采集時(shí)間以減少病人等待時(shí)間非常重要。但是,隨著k空間采樣率的下降,由于不適定的問(wèn)題,我們可能會(huì)面臨多種挑戰(zhàn),例如噪聲放大,對(duì)象邊緣模糊和混疊偽像。受深度學(xué)習(xí)具有良好效果的啟發(fā),本論文研究基于深度學(xué)習(xí)的磁共振快速成像無(wú)監(jiān)督學(xué)習(xí)方法。在無(wú)監(jiān)督學(xué)習(xí)方法中,其目標(biāo)是通過(guò)網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練來(lái)學(xué)習(xí)完全采樣圖像的概率分布,然后將網(wǎng)絡(luò)學(xué)習(xí)的圖像先驗(yàn)作為顯式約束來(lái)約束圖像重建框架。我們利用網(wǎng)絡(luò)學(xué)習(xí)先驗(yàn)信息作為MRI重建的正則化項(xiàng)。去噪自編碼器(Denoising Autoencoder,DAE)由于其靈活的表示擴(kuò)展和出色的圖像恢復(fù)魯棒性而在我們的迭代重建過(guò)程中被用作有效先驗(yàn)DAEP(Denoising Autoencoding Priors)。本篇論文的主要貢獻(xiàn)如下:(1)這是首次在磁共振成像重建中引入DAEP。與最近采用基于端到端的卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的方法不同,我們使用深度學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)作為一種工具來(lái)學(xué)習(xí)常規(guī)的先驗(yàn)信息并將其合并到受約束的重建框架中。因此,一旦獲得了通過(guò)網(wǎng)絡(luò)學(xué)...
【文章來(lái)源】:南昌大學(xué)江西省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:54 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1?BDAEPRec模型的流程圖??1.4章節(jié)安排??本論文圍繞如何提取更有效的先驗(yàn)信息用于磁共振重建來(lái)展開(kāi),各個(gè)章節(jié)??-??
?第2章現(xiàn)論基礎(chǔ)???第2章理論基礎(chǔ)??要研究磁共振圖像重建,我們首先需要研究磁共振圖像的形成以及磁共振??圖像相對(duì)于自然圖像奮何區(qū)別。基于此我們?cè)诒菊卵绣沉撕舜殴舱裨、磁??振圖像的形成、k空間特性以及磁共振的采樣軌跡,為后續(xù)研究提供理論基矗??2.1核磁共振原理??磁共振成像的物理基礎(chǔ)是核磁共振現(xiàn)象。??原子是由原子核和外層的電子組成,原子核由質(zhì)子和中子組成,質(zhì)子和中??了-都有確定的閂旋炻動(dòng)量,質(zhì)子中子的組合也就構(gòu)成了原子的屬性:核自旋以??及自旋角動(dòng)量。核自旋會(huì)產(chǎn)也核磁矩/^。其大小為/^?:??/^.v?=?rps?(2.1)??其屮y為磁旋比,其值由特定的核決定,不同的原子核其值不同,對(duì)于我??們?nèi)梭w內(nèi)元素,1H的Y值最大為y?=1,?19F的y值為0.?83,?23Na的Y值為0.093、??’屮的y值為0.066。為自旋角動(dòng)量矩的標(biāo)量,由質(zhì)子中子數(shù)決定。/心不為??零的核我們稱(chēng)為磁性核。只有磁性核才會(huì)產(chǎn)也磁共振現(xiàn)象。??迅然人體內(nèi)的磁性核很多,fi.足我們?般采用1h核叩來(lái)進(jìn)彳y?成像。采相4??核的原因是4核在人體內(nèi)含量最高、Y值最大,產(chǎn)生的信號(hào)強(qiáng)度最大。??迸^??<?????後爾矩??ri旋執(zhí)道??圖2.1自旋核在靜磁場(chǎng)B〇中運(yùn)動(dòng)示章圖??雖然人器官組織內(nèi)含有大量的磁性核,但是由于原子核的磁矩在空間的取??向是隨機(jī)的,所以整個(gè)器官對(duì)外不顯示磁性。只有當(dāng)器官組織放在靜磁場(chǎng)Bu時(shí),??由于靜磁場(chǎng)會(huì)對(duì)核磁矩有個(gè)作用力。這個(gè)作用力不僅會(huì)使得原來(lái)隨機(jī)的磁矩方??向變得和外磁場(chǎng)呈現(xiàn)一定的角度并且使得磁性核圍繞Bu旋轉(zhuǎn),如圖2.丨所??7??
?第2章理論基礎(chǔ)???是相互獨(dú)立的。并且由他們的形成機(jī)理可得知,對(duì)f?同組織器官T2<?71。值??得一提的是,橫向弛豫時(shí)間不受靜磁場(chǎng)Bo的影響。??2.2磁共振圖像的形成??2.2.1磁共振成像的流程圖??磁共振成像的流程圖如2.2所示。??;:;??綱職?一—?麵鎖???;;;;n零糞曾f?:::;??圖2.2磁共振成像的流程圖??圖像編碼模塊包括RF發(fā)射/接收裝置、梯度磁場(chǎng)模塊,編碼模塊會(huì)產(chǎn)生編碼??后的圖像數(shù)據(jù)(K空間數(shù)據(jù)),圖像重建模塊就是將k空間數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)為圖像空間的??過(guò)程々??編碼模塊描述的是磁共振成像儀的編碼過(guò)程,即從物體信號(hào)到k空間信號(hào)的??變換過(guò)程。數(shù)學(xué)上矢量化公式如下:??Ep=m?(2.3)??其中e是編碼矩陣,p足耑耍m述物體的m兮,m是測(cè)丨it的伯兮。磁共振??重建就是已知E、m求P的過(guò)程。當(dāng)編碼矩陣是離散傅里葉變換(Discrete??Fourier?Transl'omi,DFT)時(shí),我們可以通過(guò)采用快速傅里葉變換(Fast?Fourier??Transform,?FFT)來(lái)獲得磁共振圖像。??2.2.2磁共振信號(hào)的空間定位??由2.1.1章竹可知,我們可以通過(guò)放置作xy而的線圈產(chǎn)生的電流來(lái)反映出病??人器官的信9強(qiáng)度。似是我們只能獲得整體器官的信號(hào)強(qiáng)度,無(wú)法獲得各個(gè)體??素的信號(hào)強(qiáng)度。為了獲得各個(gè)體素的信號(hào)強(qiáng)度,我們除了要施加靜磁場(chǎng)B(,以及??射頻脈沖以外,還需要施加三個(gè)相]I垂直且磁場(chǎng)強(qiáng)度隨空間位置線性變化的梯??度磁場(chǎng)Gx,Gy,Gz。為I"方便描述,我們■要對(duì)磁場(chǎng)進(jìn)行空間坐標(biāo)標(biāo)注,其-中??Z軸的方向和靜磁場(chǎng)的方向一樣,X軸Y軸的方向由右手法則確定,如圖
【參考文獻(xiàn)】:
碩士論文
[1]基于復(fù)數(shù)卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的靜態(tài)磁共振成像研究[D]. 程慧濤.中國(guó)科學(xué)院大學(xué)(中國(guó)科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院) 2019
[2]基于迭代網(wǎng)絡(luò)的快速磁共振成像[D]. 劉沂玲.南昌大學(xué) 2019
[3]基于卷積稀疏編碼和多視角特征先驗(yàn)信息的圖像恢復(fù)[D]. 熊嬌嬌.南昌大學(xué) 2018
本文編號(hào):3117419
【文章來(lái)源】:南昌大學(xué)江西省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:54 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1?BDAEPRec模型的流程圖??1.4章節(jié)安排??本論文圍繞如何提取更有效的先驗(yàn)信息用于磁共振重建來(lái)展開(kāi),各個(gè)章節(jié)??-??
?第2章現(xiàn)論基礎(chǔ)???第2章理論基礎(chǔ)??要研究磁共振圖像重建,我們首先需要研究磁共振圖像的形成以及磁共振??圖像相對(duì)于自然圖像奮何區(qū)別。基于此我們?cè)诒菊卵绣沉撕舜殴舱裨、磁??振圖像的形成、k空間特性以及磁共振的采樣軌跡,為后續(xù)研究提供理論基矗??2.1核磁共振原理??磁共振成像的物理基礎(chǔ)是核磁共振現(xiàn)象。??原子是由原子核和外層的電子組成,原子核由質(zhì)子和中子組成,質(zhì)子和中??了-都有確定的閂旋炻動(dòng)量,質(zhì)子中子的組合也就構(gòu)成了原子的屬性:核自旋以??及自旋角動(dòng)量。核自旋會(huì)產(chǎn)也核磁矩/^。其大小為/^?:??/^.v?=?rps?(2.1)??其屮y為磁旋比,其值由特定的核決定,不同的原子核其值不同,對(duì)于我??們?nèi)梭w內(nèi)元素,1H的Y值最大為y?=1,?19F的y值為0.?83,?23Na的Y值為0.093、??’屮的y值為0.066。為自旋角動(dòng)量矩的標(biāo)量,由質(zhì)子中子數(shù)決定。/心不為??零的核我們稱(chēng)為磁性核。只有磁性核才會(huì)產(chǎn)也磁共振現(xiàn)象。??迅然人體內(nèi)的磁性核很多,fi.足我們?般采用1h核叩來(lái)進(jìn)彳y?成像。采相4??核的原因是4核在人體內(nèi)含量最高、Y值最大,產(chǎn)生的信號(hào)強(qiáng)度最大。??迸^??<?????後爾矩??ri旋執(zhí)道??圖2.1自旋核在靜磁場(chǎng)B〇中運(yùn)動(dòng)示章圖??雖然人器官組織內(nèi)含有大量的磁性核,但是由于原子核的磁矩在空間的取??向是隨機(jī)的,所以整個(gè)器官對(duì)外不顯示磁性。只有當(dāng)器官組織放在靜磁場(chǎng)Bu時(shí),??由于靜磁場(chǎng)會(huì)對(duì)核磁矩有個(gè)作用力。這個(gè)作用力不僅會(huì)使得原來(lái)隨機(jī)的磁矩方??向變得和外磁場(chǎng)呈現(xiàn)一定的角度并且使得磁性核圍繞Bu旋轉(zhuǎn),如圖2.丨所??7??
?第2章理論基礎(chǔ)???是相互獨(dú)立的。并且由他們的形成機(jī)理可得知,對(duì)f?同組織器官T2<?71。值??得一提的是,橫向弛豫時(shí)間不受靜磁場(chǎng)Bo的影響。??2.2磁共振圖像的形成??2.2.1磁共振成像的流程圖??磁共振成像的流程圖如2.2所示。??;:;??綱職?一—?麵鎖???;;;;n零糞曾f?:::;??圖2.2磁共振成像的流程圖??圖像編碼模塊包括RF發(fā)射/接收裝置、梯度磁場(chǎng)模塊,編碼模塊會(huì)產(chǎn)生編碼??后的圖像數(shù)據(jù)(K空間數(shù)據(jù)),圖像重建模塊就是將k空間數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)為圖像空間的??過(guò)程々??編碼模塊描述的是磁共振成像儀的編碼過(guò)程,即從物體信號(hào)到k空間信號(hào)的??變換過(guò)程。數(shù)學(xué)上矢量化公式如下:??Ep=m?(2.3)??其中e是編碼矩陣,p足耑耍m述物體的m兮,m是測(cè)丨it的伯兮。磁共振??重建就是已知E、m求P的過(guò)程。當(dāng)編碼矩陣是離散傅里葉變換(Discrete??Fourier?Transl'omi,DFT)時(shí),我們可以通過(guò)采用快速傅里葉變換(Fast?Fourier??Transform,?FFT)來(lái)獲得磁共振圖像。??2.2.2磁共振信號(hào)的空間定位??由2.1.1章竹可知,我們可以通過(guò)放置作xy而的線圈產(chǎn)生的電流來(lái)反映出病??人器官的信9強(qiáng)度。似是我們只能獲得整體器官的信號(hào)強(qiáng)度,無(wú)法獲得各個(gè)體??素的信號(hào)強(qiáng)度。為了獲得各個(gè)體素的信號(hào)強(qiáng)度,我們除了要施加靜磁場(chǎng)B(,以及??射頻脈沖以外,還需要施加三個(gè)相]I垂直且磁場(chǎng)強(qiáng)度隨空間位置線性變化的梯??度磁場(chǎng)Gx,Gy,Gz。為I"方便描述,我們■要對(duì)磁場(chǎng)進(jìn)行空間坐標(biāo)標(biāo)注,其-中??Z軸的方向和靜磁場(chǎng)的方向一樣,X軸Y軸的方向由右手法則確定,如圖
【參考文獻(xiàn)】:
碩士論文
[1]基于復(fù)數(shù)卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的靜態(tài)磁共振成像研究[D]. 程慧濤.中國(guó)科學(xué)院大學(xué)(中國(guó)科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院) 2019
[2]基于迭代網(wǎng)絡(luò)的快速磁共振成像[D]. 劉沂玲.南昌大學(xué) 2019
[3]基于卷積稀疏編碼和多視角特征先驗(yàn)信息的圖像恢復(fù)[D]. 熊嬌嬌.南昌大學(xué) 2018
本文編號(hào):3117419
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