本文關鍵詞：額濟納胡楊林生長規(guī)律及生物生產力的研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

《新疆大學》 2010年

沙雅縣胡楊林土壤可培養(yǎng)細菌的多樣性分析及一株新種的分類學鑒定

何香  

【摘要】： 1、本研究對新疆沙雅縣天然胡楊林地區(qū)土壤內可培養(yǎng)細菌的多樣性進行研究,使用常規(guī)的稀釋涂布平板法獲得了69株純培養(yǎng)物。其中40株菌是革蘭氏陽性菌,29株菌是革蘭氏陰性菌,18株菌是球菌,51株菌是桿菌。根據表型,生理生化特征,16S rRNA序列分析和系統(tǒng)發(fā)育分析結果表明,69株菌分別屬于厚壁菌門( Firmicutes )、放線菌門( Actinobacteria )、變形菌門γ亞群(Gamma-proteobacteria)和CFB細菌門(Cytophaga-Flexibacter-Bacteroides)。其中32株屬于厚壁菌門,占46.4%,包括Bacillus屬和Planococcus屬;18株屬于放線菌門,占26.1%,包括Arthrobacter屬、Kocuria屬、Leucobacter屬,Citricoccus屬和Promicromonospora屬;17株屬于變形菌門γ亞群,占24.6%,包括Pseudomonas屬和Psychrobacter屬;2株屬于CFB細菌門占2.9%,為Sphingobacterium屬,共分為10個屬31個分類學單元,優(yōu)勢菌是芽孢桿菌屬(33.3%)。辛普森(Simpson)多樣性指數D=0.7927,香農-威納(Shannon-Wiener)多樣性指數H=0.7821,香農-威納(Shannon-Wiener)均勻度指數E=0.7821,表明該地區(qū)的細菌多樣性較為豐富。其中大部分的細菌能生長在極度干旱的條件下,與胡楊林生態(tài)環(huán)境相一致。 2、對分離到的潛在新種HS39進行多相分類學的鑒定。結果:菌株HS39為革蘭氏陰性,無運動性,不產孢子,嚴格好氧的桿菌。細胞大小為1.0-1.5μm長和0.6-0.8μm寬。在LB培養(yǎng)基上培養(yǎng)2d后,形成直徑為1.0-2.0 mm,黃色,表面光滑整齊,略微凸起的圓形菌落。菌株生長溫度是10-40℃(最適30-37℃),pH范圍是5.5-9.0(最適pH 6.5-8.0),NaCl濃度范圍是0-5%(w/v()最適是0-3%)。具有氧化酶和過氧化氫酶活性,能利用碳源D-葡萄糖、N-乙�；咸烟恰-蔗糖、D-麥芽糖和水楊苷。16S rRNA序列分析顯示,菌株HS39歸類于Sphingobacterium屬,最近緣種是Sphingobacteriu mizutaii ATCC 33299T,其序列同源性是94.0%,基因組DNA的(G+C)mol%含量是40.2%。菌株HS39主要包含的脂肪酸類型是iso-C15:0,iso-C17:0 3-OH和summed feature 3(由C16:1ω6c和或C16:1ω7c組成),主要的醌型是MK-7�；诒硇吞卣骱拖到y(tǒng)發(fā)育分析,菌株HS39是Sphingobacterium屬內的一個新種,命名為Sphingobacterium shayense。作為典型菌株保藏編號是CCTCC AB 209006T和NRRL B-59203T。

【關鍵詞】：
【學位授予單位】：新疆大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2010
【分類號】：S714.3
【目錄】：

摘要4-6

Abstract6-11

第一章 文獻綜述11-21

1 胡楊概述11-13

1.1 胡楊特征11-12

1.2 胡楊林的生態(tài)效益12-13

2 土壤微生物群落多樣性概念13

3 土壤微生物群落多樣性的研究現狀13-14

4 土壤微生物群落多樣性分析方法14-17

4.1 傳統(tǒng)培養(yǎng)方法14

4.2 生物化學方法14-15

4.3 分子生物學方法15-17

5 微生物菌種的系統(tǒng)鑒定方法17-20

5.1 經典的鑒定指標17

5.2 儀器自動化鑒定17-18

5.3 分類鑒定中的現代方法18-20

6 研究目的與意義20-21

第二章 沙雅縣胡楊林可培養(yǎng)細菌的分離鑒定及其多樣性分析21-43

一、材料和方法21-27

1 實驗材料21-22

1.1 土壤樣品來源21

1.2 采樣位點21

1.3 生化試劑21

1.4 實驗儀器21-22

1.5 引物22

1.6 測序22

2 試驗方法22-27

2.1 培養(yǎng)基的配制22

2.2 菌株的分離與純化22

2.3 細胞的形態(tài)觀察22-23

2.4 生理生化檢測23-25

2.5 核酸鑒定25-26

2.6 16S rRNA 序列分析與系統(tǒng)進化樹的構建26

2.7 分離菌株的多樣性指數26-27

二、結果27-42

1 菌株的形態(tài)觀察27-32

2 生理生化檢測結果32-35

2.1 NaCl 濃度生長范圍32

2.2 干旱脅迫的測定32

2.3 酶學特性檢測32-35

3 16S rRNA 序列分析結果35-39

4 所分離的69 株菌的進化地位關系39-41

5 所分離69 株菌的多樣性指數41-42

三、討論42-43

第三章 從沙雅縣胡楊林分離的新記錄種Sphingobacterium shayense 的精確分類學鑒定43-65

一、實驗材料43-44

1 樣品來源43

2 模式菌株43

3 培養(yǎng)基43

4 實驗儀器43-44

5 引物44

二、實驗方法44-52

1 菌株的分離純化44

2 表型特征的分析44-49

2.1 形態(tài)學特征44-45

2.2 生長特征45

2.3 生理生化測定45-46

2.4 細胞化學組分的測定46-49

3 遺傳型特征的分析49-52

3.1 16S rRNA 的分析50

3.2 系統(tǒng)發(fā)育分析50

3.3 （G+C）mol%含量的測定50-52

三、結果52-63

1 菌株的分離純化52

2 形態(tài)學特征52-53

3 生長特征53

3.1 生長溫度范圍53

3.2 pH 生長范圍53

3.3 NaCl 濃度生長范圍53

4 生理生化測定53-56

4.1 API 50CH、API 20E 和API 32GN 及其它酶學活性的測定結果53-54

4.2 API ZYM 測定結果54-55

4.3 抗生素敏感性檢測結果55-56

5 細胞化學組分的測定56-57

5.1 脂肪酸成分分析56

5.2 醌組分分析56-57

6 遺傳型特征57-63

6.1 16S rRNA 的分析57-58

6.2 基于16S rRNA 序列分析的系統(tǒng)發(fā)育分析58-59

6.3 （G+C）mol%含量的測定59-63

四、討論63-65

第四章 結論與展望65-68

一、結論65-67

二、展望67-68

參考文獻68-72

附錄72-77

致謝77-78

在讀期間發(fā)表的期刊論文78-79

作者簡介79

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7 李智衛(wèi);海藻對不同促生菌生長的影響及應用[D];山東農業(yè)大學;2010年

8 劉娜;黃瓜不同發(fā)育期土壤微生物分子生態(tài)研究[D];河南農業(yè)大學;2004年

9 婁鑫;闊葉紅松林演替過程中土壤微生物變化研究[D];東北林業(yè)大學;2010年

10 董斌;Bt水稻種植及秸稈還田對土壤酶、呼吸活性及土壤微生物功能和結構多樣性的影響[D];浙江大學;2011年

  本文關鍵詞：額濟納胡楊林生長規(guī)律及生物生產力的研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

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本文編號：144287