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沙雅縣胡楊林土壤可培養(yǎng)細(xì)菌的多樣性分析及一株新種的分類學(xué)鑒定

發(fā)布時(shí)間:2016-10-18 07:48

  本文關(guān)鍵詞:額濟(jì)納胡楊林生長規(guī)律及生物生產(chǎn)力的研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


《新疆大學(xué)》 2010年

沙雅縣胡楊林土壤可培養(yǎng)細(xì)菌的多樣性分析及一株新種的分類學(xué)鑒定

何香  

【摘要】: 1、本研究對新疆沙雅縣天然胡楊林地區(qū)土壤內(nèi)可培養(yǎng)細(xì)菌的多樣性進(jìn)行研究,使用常規(guī)的稀釋涂布平板法獲得了69株純培養(yǎng)物。其中40株菌是革蘭氏陽性菌,29株菌是革蘭氏陰性菌,18株菌是球菌,51株菌是桿菌。根據(jù)表型,生理生化特征,16S rRNA序列分析和系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果表明,69株菌分別屬于厚壁菌門( Firmicutes )、放線菌門( Actinobacteria )、變形菌門γ亞群(Gamma-proteobacteria)和CFB細(xì)菌門(Cytophaga-Flexibacter-Bacteroides)。其中32株屬于厚壁菌門,占46.4%,包括Bacillus屬和Planococcus屬;18株屬于放線菌門,占26.1%,包括Arthrobacter屬、Kocuria屬、Leucobacter屬,Citricoccus屬和Promicromonospora屬;17株屬于變形菌門γ亞群,占24.6%,包括Pseudomonas屬和Psychrobacter屬;2株屬于CFB細(xì)菌門占2.9%,為Sphingobacterium屬,共分為10個(gè)屬31個(gè)分類學(xué)單元,優(yōu)勢菌是芽孢桿菌屬(33.3%)。辛普森(Simpson)多樣性指數(shù)D=0.7927,香農(nóng)-威納(Shannon-Wiener)多樣性指數(shù)H=0.7821,香農(nóng)-威納(Shannon-Wiener)均勻度指數(shù)E=0.7821,表明該地區(qū)的細(xì)菌多樣性較為豐富。其中大部分的細(xì)菌能生長在極度干旱的條件下,與胡楊林生態(tài)環(huán)境相一致。 2、對分離到的潛在新種HS39進(jìn)行多相分類學(xué)的鑒定。結(jié)果:菌株HS39為革蘭氏陰性,無運(yùn)動(dòng)性,不產(chǎn)孢子,嚴(yán)格好氧的桿菌。細(xì)胞大小為1.0-1.5μm長和0.6-0.8μm寬。在LB培養(yǎng)基上培養(yǎng)2d后,形成直徑為1.0-2.0 mm,黃色,表面光滑整齊,略微凸起的圓形菌落。菌株生長溫度是10-40℃(最適30-37℃),pH范圍是5.5-9.0(最適pH 6.5-8.0),NaCl濃度范圍是0-5%(w/v()最適是0-3%)。具有氧化酶和過氧化氫酶活性,能利用碳源D-葡萄糖、N-乙酰基葡萄糖、D-蔗糖、D-麥芽糖和水楊苷。16S rRNA序列分析顯示,菌株HS39歸類于Sphingobacterium屬,最近緣種是Sphingobacteriu mizutaii ATCC 33299T,其序列同源性是94.0%,基因組DNA的(G+C)mol%含量是40.2%。菌株HS39主要包含的脂肪酸類型是iso-C15:0,iso-C17:0 3-OH和summed feature 3(由C16:1ω6c和或C16:1ω7c組成),主要的醌型是MK-7;诒硇吞卣骱拖到y(tǒng)發(fā)育分析,菌株HS39是Sphingobacterium屬內(nèi)的一個(gè)新種,命名為Sphingobacterium shayense。作為典型菌株保藏編號是CCTCC AB 209006T和NRRL B-59203T。

【關(guān)鍵詞】:
【學(xué)位授予單位】:新疆大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2010
【分類號】:S714.3
【目錄】:

  • 摘要4-6
  • Abstract6-11
  • 第一章 文獻(xiàn)綜述11-21
  • 1 胡楊概述11-13
  • 1.1 胡楊特征11-12
  • 1.2 胡楊林的生態(tài)效益12-13
  • 2 土壤微生物群落多樣性概念13
  • 3 土壤微生物群落多樣性的研究現(xiàn)狀13-14
  • 4 土壤微生物群落多樣性分析方法14-17
  • 4.1 傳統(tǒng)培養(yǎng)方法14
  • 4.2 生物化學(xué)方法14-15
  • 4.3 分子生物學(xué)方法15-17
  • 5 微生物菌種的系統(tǒng)鑒定方法17-20
  • 5.1 經(jīng)典的鑒定指標(biāo)17
  • 5.2 儀器自動(dòng)化鑒定17-18
  • 5.3 分類鑒定中的現(xiàn)代方法18-20
  • 6 研究目的與意義20-21
  • 第二章 沙雅縣胡楊林可培養(yǎng)細(xì)菌的分離鑒定及其多樣性分析21-43
  • 一、材料和方法21-27
  • 1 實(shí)驗(yàn)材料21-22
  • 1.1 土壤樣品來源21
  • 1.2 采樣位點(diǎn)21
  • 1.3 生化試劑21
  • 1.4 實(shí)驗(yàn)儀器21-22
  • 1.5 引物22
  • 1.6 測序22
  • 2 試驗(yàn)方法22-27
  • 2.1 培養(yǎng)基的配制22
  • 2.2 菌株的分離與純化22
  • 2.3 細(xì)胞的形態(tài)觀察22-23
  • 2.4 生理生化檢測23-25
  • 2.5 核酸鑒定25-26
  • 2.6 16S rRNA 序列分析與系統(tǒng)進(jìn)化樹的構(gòu)建26
  • 2.7 分離菌株的多樣性指數(shù)26-27
  • 二、結(jié)果27-42
  • 1 菌株的形態(tài)觀察27-32
  • 2 生理生化檢測結(jié)果32-35
  • 2.1 NaCl 濃度生長范圍32
  • 2.2 干旱脅迫的測定32
  • 2.3 酶學(xué)特性檢測32-35
  • 3 16S rRNA 序列分析結(jié)果35-39
  • 4 所分離的69 株菌的進(jìn)化地位關(guān)系39-41
  • 5 所分離69 株菌的多樣性指數(shù)41-42
  • 三、討論42-43
  • 第三章 從沙雅縣胡楊林分離的新記錄種Sphingobacterium shayense 的精確分類學(xué)鑒定43-65
  • 一、實(shí)驗(yàn)材料43-44
  • 1 樣品來源43
  • 2 模式菌株43
  • 3 培養(yǎng)基43
  • 4 實(shí)驗(yàn)儀器43-44
  • 5 引物44
  • 二、實(shí)驗(yàn)方法44-52
  • 1 菌株的分離純化44
  • 2 表型特征的分析44-49
  • 2.1 形態(tài)學(xué)特征44-45
  • 2.2 生長特征45
  • 2.3 生理生化測定45-46
  • 2.4 細(xì)胞化學(xué)組分的測定46-49
  • 3 遺傳型特征的分析49-52
  • 3.1 16S rRNA 的分析50
  • 3.2 系統(tǒng)發(fā)育分析50
  • 3.3 (G+C)mol%含量的測定50-52
  • 三、結(jié)果52-63
  • 1 菌株的分離純化52
  • 2 形態(tài)學(xué)特征52-53
  • 3 生長特征53
  • 3.1 生長溫度范圍53
  • 3.2 pH 生長范圍53
  • 3.3 NaCl 濃度生長范圍53
  • 4 生理生化測定53-56
  • 4.1 API 50CH、API 20E 和API 32GN 及其它酶學(xué)活性的測定結(jié)果53-54
  • 4.2 API ZYM 測定結(jié)果54-55
  • 4.3 抗生素敏感性檢測結(jié)果55-56
  • 5 細(xì)胞化學(xué)組分的測定56-57
  • 5.1 脂肪酸成分分析56
  • 5.2 醌組分分析56-57
  • 6 遺傳型特征57-63
  • 6.1 16S rRNA 的分析57-58
  • 6.2 基于16S rRNA 序列分析的系統(tǒng)發(fā)育分析58-59
  • 6.3 (G+C)mol%含量的測定59-63
  • 四、討論63-65
  • 第四章 結(jié)論與展望65-68
  • 一、結(jié)論65-67
  • 二、展望67-68
  • 參考文獻(xiàn)68-72
  • 附錄72-77
  • 致謝77-78
  • 在讀期間發(fā)表的期刊論文78-79
  • 作者簡介79
  • 下載全文 更多同類文獻(xiàn)

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    10 孫劭靖;路福平;姜楠;李麗;徐健勇;曹慕琛;宋詼;;一株產(chǎn)耐熱普魯蘭酶菌株Anoxybacillus sp. LM14-2分離鑒定及酶學(xué)性質(zhì)研究[J];生物技術(shù)通報(bào);2011年09期

    中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

    1 楊子山;;Bt棉花對土壤微生物的安全性評價(jià)進(jìn)展[A];中國棉花學(xué)會2011年年會論文匯編[C];2011年

    2 鄭雪芳;劉波;藍(lán)江林;朱育菁;車建美;蘇明星;;植物疫苗植物疫苗無致病力青枯雷爾氏菌脅迫對煙草根系土壤微生物脂肪酸生態(tài)學(xué)特性的影響[A];第三屆全國微生物資源學(xué)術(shù)暨國家微生物資源平臺運(yùn)行服務(wù)研討會會議論文摘要集[C];2011年

    3 宗美娟;張明才;宋百敏;王仁卿;;黃河三角洲檉柳群落土壤微生物多樣性[A];生物多樣性保護(hù)與區(qū)域可持續(xù)發(fā)展——第四屆全國生物多樣性保護(hù)與持續(xù)利用研討會論文集[C];2000年

    4 黃可輝;黃振;沈荔花;郭瓊霞;;兩種一枝黃花屬植物對土壤微生物的影響比較[A];中國第三屆植物化感作用學(xué)術(shù)研討會、第八屆全國雜草科學(xué)大會、聯(lián)合國糧農(nóng)組織——中國“水稻化感作用論壇”論文摘要集[C];2007年

    5 查軒;黃少燕;;亞熱帶不同人工林地土壤微生物分布特征研究[A];生態(tài)學(xué)與全面·協(xié)調(diào)·可持續(xù)發(fā)展——中國生態(tài)學(xué)會第七屆全國會員代表大會論文摘要薈萃[C];2004年

    6 黃進(jìn)勇;周偉;;農(nóng)田土壤微生物多樣性的影響因素及效應(yīng)[A];生態(tài)學(xué)與全面·協(xié)調(diào)·可持續(xù)發(fā)展——中國生態(tài)學(xué)會第七屆全國會員代表大會論文摘要薈萃[C];2004年

    7 鄭世學(xué);喻子牛;姚俊;;微量熱技術(shù)在土壤微生物代謝活動(dòng)研究中的應(yīng)用[A];中國微生物學(xué)會《第二屆全國農(nóng)業(yè)微生物研究及產(chǎn)業(yè)化研討會》和《第十一屆全國殺蟲微生物學(xué)術(shù)研討會》暨《湖北省暨武漢市微生物學(xué)會和內(nèi)蒙古微生物學(xué)會2008年會》論文摘要[C];2008年

    8 彭仁;邱業(yè)先;汪金蓮;;土壤微生物脲酶研究[A];中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)會第八屆會員代表大會暨全國學(xué)術(shù)會議論文摘要集[C];2001年

    9 劉曉;宋世威;徐鳳杰;王加強(qiáng);陳日遠(yuǎn);孫玉行;李康仁;;“美亞”微生物土壤改良劑在葉菜生產(chǎn)上的應(yīng)用研究—對土壤微生物特性的影響[A];科技與創(chuàng)新——廣東園藝科技論文集(廣東省園藝學(xué)會第九次會員大會暨學(xué)術(shù)研討會論文集)[C];2010年

    10 楊倩;王先之;沈禹穎;南志標(biāo);;黃土高原保護(hù)性耕作下麥田土壤微生物群落功能多樣性特征[A];第八屆博士生學(xué)術(shù)年會論文摘要集[C];2010年

    中國重要報(bào)紙全文數(shù)據(jù)庫 前10條

    1 本報(bào)通訊員 劉懷勝;[N];昌吉日報(bào);2008年

    2 通訊員 甘立新;[N];阿克蘇日報(bào);2008年

    3 通訊員 鄭煜坤 本報(bào)記者 周海霞;[N];巴音郭楞日報(bào);2009年

    4 北京綠維創(chuàng)景規(guī)劃設(shè)計(jì)院森林旅游與養(yǎng)生地產(chǎn)中心 夏家勇 帥曉艷 林峰;[N];中國旅游報(bào);2009年

    5 本報(bào)記者 李婧儒 付寧;[N];巴音郭楞日報(bào);2010年

    6 記者 付超;[N];新疆科技報(bào)(漢);2010年

    7 本報(bào)記者 趙劍塵;[N];烏魯木齊晚報(bào);2010年

    8 首席記者 周海霞 特約記者 李寶珍;[N];巴音郭楞日報(bào);2010年

    9 本報(bào)記者 許景;[N];亞洲中心時(shí)報(bào)(漢);2011年

    10 王富強(qiáng)、特約記者汪光寶;[N];人民武警報(bào);2011年

    中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

    1 喬海莉;塔里木天然胡楊林微生物與昆蟲多樣性及光肩星天牛的入侵風(fēng)險(xiǎn)[D];北京林業(yè)大學(xué);2007年

    2 李啟森;黑河下游綠洲胡楊發(fā)育與水土等環(huán)境變化的對應(yīng)[D];蘭州大學(xué);2009年

    3 丁明全;鹽脅迫下胡楊表達(dá)譜微陣列分析及差異表達(dá)基因的功能解析[D];北京林業(yè)大學(xué);2011年

    4 趙陽;黑河下游不同地下水位胡楊葉形態(tài)學(xué)生理學(xué)響應(yīng)[D];蘭州大學(xué);2012年

    5 薩如拉;額濟(jì)納天然胡楊林生態(tài)用水機(jī)理研究[D];內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué);2010年

    6 姜海燕;大興安嶺興安落葉松林土壤微生物與土壤酶活性研究[D];內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué);2010年

    7 霍穎異;近海細(xì)菌多相分類和基因組研究以及深海沉積物宏基因組分析[D];浙江大學(xué);2012年

    8 焦志華;再生水灌溉對植物生長及土壤微生物生態(tài)系統(tǒng)的影響研究[D];中國礦業(yè)大學(xué)(北京);2010年

    9 王爽;大慶鹽堿土可培養(yǎng)嗜鹽細(xì)菌與古菌多樣性及多相分類研究[D];哈爾濱工業(yè)大學(xué);2011年

    10 周博如;阿特拉津降解菌的分離、鑒定及特性研究[D];東北林業(yè)大學(xué);2011年

    中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

    1 何香;沙雅縣胡楊林土壤可培養(yǎng)細(xì)菌的多樣性分析及一株新種的分類學(xué)鑒定[D];新疆大學(xué);2010年

    2 陳明;新疆典型荒漠植被立地土壤酶活性及微生物數(shù)量研究[D];新疆農(nóng)業(yè)大學(xué);2008年

    3 阿不都外力·阿不都熱依木;西昆侖山兩個(gè)樣點(diǎn)可培養(yǎng)細(xì)菌多樣性分析[D];新疆大學(xué);2010年

    4 宋培勇;貴州不同生境土壤中微生物結(jié)構(gòu)的差異[D];西南師范大學(xué);2004年

    5 徐微;松嫩羊草草地放牧梯度上土壤微生物和根系分泌物的初步研究[D];東北師范大學(xué);2005年

    6 胡競輝;梨園間作芳香植物對土壤微生物、土壤酶活性與土壤養(yǎng)分的影響[D];北京農(nóng)學(xué)院;2010年

    7 李智衛(wèi);海藻對不同促生菌生長的影響及應(yīng)用[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2010年

    8 劉娜;黃瓜不同發(fā)育期土壤微生物分子生態(tài)研究[D];河南農(nóng)業(yè)大學(xué);2004年

    9 婁鑫;闊葉紅松林演替過程中土壤微生物變化研究[D];東北林業(yè)大學(xué);2010年

    10 董斌;Bt水稻種植及秸稈還田對土壤酶、呼吸活性及土壤微生物功能和結(jié)構(gòu)多樣性的影響[D];浙江大學(xué);2011年


      本文關(guān)鍵詞:額濟(jì)納胡楊林生長規(guī)律及生物生產(chǎn)力的研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

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    本文編號:144287

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