一株紅球菌(Rhodococcus sp. strain p52)對石油污染物的降解研究
【摘要】 石油是重要的一次能源之一,其應(yīng)用范圍不斷拓展,在其開采、儲運(yùn)和使用過程中無法避免地會有泄油事故發(fā)生,造成上壤及水體的嚴(yán)重污染。石油類污染物具有較高的生物學(xué)毒性,進(jìn)入環(huán)境后較難降解、消除,從而對生態(tài)系統(tǒng)造成極大的危害。由于微生物能夠通過多種多樣的代謝途徑降解石油污染物,因此在石油污染物的治理中多采用生物法去除,此法見效快且成本低,在環(huán)境凈化領(lǐng)域起到關(guān)鍵的作用。本文研究了一株二苯并呋喃(Dibenzofuran, DF)降解菌Rhodococcus sp.strain p52對不同鏈長的烷烴和芳香烴的降解性能。Rhodococcus sp. strain p52以利用直鏈烷烴(正十四烷、正二十四烷和正三十二烷)、支鏈烷烴(異十九烷)和芳香烴(萘和菲)等化合物作為唯一碳源和能源進(jìn)行生長。經(jīng)48h培養(yǎng)后,85.7%的正十四烷被降解,比降解速率達(dá)到3.8mg h-1g-1;在9-11天內(nèi),79.4%的正二十四烷、66.4%的正三十二烷、63.9%的異十九烷、接近100%的萘和55.3%的菲被降解,比降解速率分別達(dá)到20.5、14.7、20.3、16和12.9mg day-1g-1.通過分析各種烴的代謝產(chǎn)物得出,Rhodococcus sp. strain p52通過單末端、雙末端和亞末端氧化的方式起始十四烷的降解;通過亞末端氧化的方式起始異十九烷的降解;通過單加氧方式起始萘的代謝,而通過單加氧和雙加氧方式起始菲的代謝。通過聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)擴(kuò)增得到編碼烷烴羥化酶的基因序列,包括CYP185家族的細(xì)胞色素P450酶的基因和兩個烷烴單加氧酶基因,將上述核酸序列測序分析后,與核酸及蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中對應(yīng)的酶進(jìn)行氨基酸序列比對分析,發(fā)現(xiàn)這些基因序列與其他已報道的革蘭氏陽性菌中相應(yīng)序列有較高的同源性,但兩個單加氧酶AlkB-1和AlkB-2的氨基酸序列之間同源性僅有62%。這些基因在上述各石油烴化合物存在時的表達(dá)狀況經(jīng)反轉(zhuǎn)錄PCR實(shí)驗(yàn)得到驗(yàn)證,上述羥化酶基因的功能也通過大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng)進(jìn)行進(jìn)一步確認(rèn)。此外,研究表明與芳香化合物降解相關(guān)的降解質(zhì)粒pDF01和pDF02具有同屬和屬間接合遷移性,經(jīng)過連續(xù)傳代培養(yǎng),質(zhì)粒pDF01和pDF02具有較好的遺傳穩(wěn)定性。上述結(jié)果表明,Rhodococcus sp. strain p52對石油污染物的生物修復(fù)具有較大的應(yīng)用潛力。
第一章前言
石油類化合物是環(huán)境中危害嚴(yán)重、污染周期長的工業(yè)污染物。在石油開釆、儲運(yùn)、加工和使用過程中不可避免地會有池漏油事故發(fā)生,對水體、土壤、大氣環(huán)境及人類的生活造成了難以估量的損失。由于石油污染多由事故性或含油廢水的大量排放引起,污染物質(zhì)總量大,超出了污染區(qū)域生態(tài)環(huán)境的自凈能力,一旦進(jìn)入環(huán)境,難徹底清除。石油污染物具有較強(qiáng)的生物學(xué)毒性,可致癌、致畸、致突變,其中芳香烴類化合物對人和動物的毒性較大,尤其是以雙環(huán)和三環(huán)為代表的多環(huán)芳烴毒性更大,已確認(rèn)其具有較強(qiáng)的致癌作用,可以通過呼吸、皮膚接觸、飲食攝入等方式進(jìn)入人或動物體內(nèi),能溶解細(xì)胞膜,干擾酶系統(tǒng),影響肝、腎等器官的正常功能,甚至引發(fā)癌變⑴。其中某些化合物還能夠通過生物富集作用累積,為其他生物的生存和人類的健康埋下隱患。近些年來,隨著工業(yè)、農(nóng)業(yè)及釆礦業(yè)的不斷發(fā)展以及新技術(shù)、新材料的不斷開發(fā)引進(jìn),使得大量化學(xué)污染物,特別是人工合成化合物進(jìn)入環(huán)境,使環(huán)境中的污染物變得更加復(fù)雜。由于這些化合物本身結(jié)構(gòu)復(fù)雜,使其治理難度加大,在短時間內(nèi)不能被有效清除,致使在環(huán)境中的存留時間可長達(dá)數(shù)年至數(shù)十年,對生態(tài)系統(tǒng)造成極大危害,嚴(yán)重地影響著人類的健康。因此必須尋求處理時間更快、處理效率更高的方法進(jìn)行治理。石油污染的修復(fù)技術(shù)主要包括物理修復(fù)、化學(xué)修復(fù)、物理化學(xué)修復(fù)和生物修復(fù)。
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第二章Rhodococcu sp.strain p52對直鏈燒經(jīng)的降解
2.1材料與方法
菌株活化及培養(yǎng):取出保存于-70度冰箱中的菌株甘油保藏管一支,劃線接種于平板上,于30度溫箱中培養(yǎng)20h后,挑取紅球菌p52單菌落接種于10Ml LB液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)20h。按1%接種量分別接種到兩個含300ml液體培養(yǎng)基的錐形瓶中,恒溫震蕩培養(yǎng),最后將其中一份菌體置于105度烘箱中供干直至質(zhì)量不再發(fā)生變化,計算出細(xì)胞干重;將另—份菌體重新懸浮于中用于CFMM降解實(shí)驗(yàn)。
2.2結(jié)果與討論
在只含菌液不含底物的對照組中,細(xì)胞的生長量基本無增加。在以各直鏈烷輕(正十四燒、正二十四燒和正三十二燒)為唯一碳源及能源的無機(jī)鹽培養(yǎng)基中,Rhodococcu sp.strain p52菌體的生長伴隨著對各直鏈焼烴的消耗,由于實(shí)驗(yàn)中所用的烴類都不溶于水,在各烴的降解初期,細(xì)胞與底物之間的接觸受限,妨礙了底物的代謝速度,使得菌體生長速度緩慢。盡管如此,與無菌對照組相比,實(shí)驗(yàn)組對中長鏈直鏈燒烴的降解仍非常明顯,尤其是對正十四燒的降解,經(jīng)48h培養(yǎng)后,正十四焼的濃度由177.5mg/l下降到25.3mg/l,Rhodococcu sp.strain p52對難降解的長鏈燒烴(正二十四燒和正三十二燒)也表現(xiàn)出了較好的降解能力,培養(yǎng)11d后對它們的降解率分別達(dá)到了79.4%和66.4%。
第三章Rhodococcu sp.strain p52對支鏈燒烴的降解............21
3.1材料與方法...........21
3.2結(jié)果與討論...............22
3.3小結(jié)......................25
第四章Rhodococcu sp.strain p52對芳香烴的降解..................27
4.1材料與方法................27
4.2結(jié)果與討論.....................28
4.3小結(jié)............30
第五章石油烴降解基因的擴(kuò)增及其轉(zhuǎn)錄活性分析..............31
5.1材料與方法............31
5.2結(jié)果與討論...........34
5.3小結(jié).......................37
第七章降解質(zhì)粒PdF01和PdF02的接合遷移性和穩(wěn)定性分析
7.1材料與方法
主要試劑
抗生素:氯霉素,鏈霉素,卡那霉素,土霉素,四環(huán)素,金霉素,紅霉素,慶大霉素,強(qiáng)力霉素,購自上海生工生物。本章Rhodococcu sp.strain p52以為供體菌,以與紅球菌親緣關(guān)系較近的同屬或不同屬微生物為受體菌,采用濾膜接合法進(jìn)行接合實(shí)驗(yàn)。通過接合實(shí)驗(yàn)研究降解質(zhì)粒從供體菌向不同受體菌中遷移的能力及其遷移的宿主范圍。通過連續(xù)傳代培養(yǎng),考察質(zhì)粒的遺傳穩(wěn)定性。
7.2結(jié)果與討論
Rhodococcu sp.strain p52對所有測試抗生素的抗性均不明顯,紫紅紅球菌、地桿菌、大地兩面神菌對鏈霉素有明顯抗性,紅串紅球菌、蠟樣芽孢桿菌對卡那霉素有明顯抗性,銅綠假單胞菌對氯霉素有抗性,枯草芽孢桿菌對強(qiáng)力霄素有抗性,腫大地桿菌、金色節(jié)桿菌對所有測試抗生素的抗性均不明顯。質(zhì)粒不穩(wěn)定的類型包括質(zhì)粒分離不穩(wěn)定和質(zhì)粒結(jié)構(gòu)不穩(wěn)定。質(zhì)粒分離不穩(wěn)定性是指由于在細(xì)胞分裂過程中發(fā)生的質(zhì)粒的不平均分配而造成的質(zhì)粒丟象現(xiàn)象;質(zhì)粒結(jié)構(gòu)不穩(wěn)定性是指由轉(zhuǎn)位作用和重組作用所引起的質(zhì)粒的重排和缺失。因此,質(zhì)粒的穩(wěn)定遺傳需要兩個必要條件:一是平均每個世代每個質(zhì)粒至少發(fā)生一次復(fù)制;二是細(xì)胞分裂時,復(fù)制產(chǎn)生的質(zhì)粒拷貝必須平均分配到兩個子細(xì)胞中去。由于時間的限制本章的研究主要涉及質(zhì)粒分離不穩(wěn)定性,尚有待于進(jìn)一步針對質(zhì)粒結(jié)構(gòu)不穩(wěn)定性開展研究。
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第八章結(jié)論與建議
本研究以一株二苯并咲喃降解菌Rhodococcu sp.strain p52為研究對象,研究了其對不同鏈長的燒烴和芳香烴的降解性能;克隆分析了Rhodococcu sp.strain p52中與石油化合物降解相關(guān)的經(jīng)化酶基因序列并通過逆轉(zhuǎn)錄驗(yàn)證了每種單加氧酶在不同降解底物存在時的表達(dá)活性。通過構(gòu)建輕化酶基因的大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng),驗(yàn)證了各降解基因產(chǎn)物轉(zhuǎn)化烴的功能。為進(jìn)一步認(rèn)識各石油化合物的降解特征,收集各化合物的主要代謝產(chǎn)物,歸納了燒烴和芳香烴可能的降解途徑。考察了Rhodococcu sp.strain p52中降解質(zhì)粒在同屬菌株或?qū)匍g接合遷移性及其遺傳穩(wěn)定性。得到的主要結(jié)論如下:通過對各烴代謝產(chǎn)物及代謝途徑分析推測Rhodococcu sp.strain p52通過單末端、雙末端和亞末端氧化的方式起始十四燒的降解;通過亞末端氧化的方式起始異十九燒的降解;通過單加氧方式起始萘的代謝,通過單加氧和雙加氧方式起始菲的代謝。
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本文編號:10946
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