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苧麻谷氨酰胺合成酶基因的克隆和超量表達(dá)研究

發(fā)布時(shí)間:2017-10-18 14:46

  本文關(guān)鍵詞:苧麻谷氨酰胺合成酶基因的克隆和超量表達(dá)研究


  更多相關(guān)文章: 苧麻 GS基因克隆 表達(dá)模式 轉(zhuǎn)基因 超量表達(dá) 氮代謝


【摘要】:氮素是植物生長(zhǎng)發(fā)育所必需的礦質(zhì)營(yíng)養(yǎng)元素,直接影響著植物的生長(zhǎng)和發(fā)育,決定著作物產(chǎn)量的高低和品質(zhì)的優(yōu)劣。谷氨酰胺合成酶(GS)作為高等植物氮代謝途徑中氮素初始同化中的關(guān)鍵酶,是一切無(wú)機(jī)氮素進(jìn)入高等植物體內(nèi)的“門戶”,影響著植物氮素營(yíng)養(yǎng)的吸收、同化及利用效率,對(duì)作物的生長(zhǎng)發(fā)育,及產(chǎn)量、品質(zhì)等農(nóng)藝性狀具有決定性作用。高等植物中谷氨酰胺合成酶分為胞液型(GS1)和質(zhì)體型(GS2)兩類:GS2主要同化NO-3還原而來(lái)及光呼吸過(guò)程所釋放的氨;GS1主要同化從土壤吸收的和由NO-3還原而來(lái)的氨,及再同化從植物體內(nèi)各個(gè)氮循環(huán)途徑所釋放的氨。苧麻(Boehmeria nivea L.)作為古老的纖維作物,近年來(lái)因其葉片中蛋白質(zhì)及必須氨基酸含量較高、嫩莖葉營(yíng)養(yǎng)價(jià)值與苜蓿相近、營(yíng)養(yǎng)結(jié)構(gòu)合理、年生物產(chǎn)量大等,被作為植物蛋白飼料原料而大量利用;同時(shí),苧麻具有植株生長(zhǎng)速度快、對(duì)氮素需求量大等特點(diǎn)。但是,國(guó)內(nèi)外與苧麻氮代謝及生長(zhǎng)特性相關(guān)的研究幾乎為零,也沒有進(jìn)行苧麻氮代謝途徑中功能基因的發(fā)掘,相關(guān)功能的研究和利用,從而阻礙了研究者對(duì)苧麻飼用及生長(zhǎng)特性在本質(zhì)上的了解,同時(shí),也不利于苧麻中優(yōu)良功能基因的發(fā)掘和利用。因此,本文以植物氮代謝途徑中關(guān)鍵基因GS為研究對(duì)象,首次從苧麻中克隆獲得GS基因家族中的4個(gè)基因,并利用生物信息學(xué)對(duì)苧麻BnGS基因序列和結(jié)構(gòu)進(jìn)行了分析,利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù),分析了苧麻GS基因在不同組織和發(fā)育階段的表達(dá)模式,同時(shí),利用ClustalW和MEGA軟件對(duì)GS基因進(jìn)行序列比對(duì)和系統(tǒng)進(jìn)化分析;另一方面,本文利用同源重組技術(shù),構(gòu)建了苧麻BnGS1-2基因的超量植物表達(dá)載體,并利用農(nóng)桿菌侵染煙草葉片,成功獲得轉(zhuǎn)基因煙草植株,同時(shí),研究了超量表達(dá)苧麻BnGS1-2基因后,轉(zhuǎn)基因煙草植株對(duì)氮素的同化和利用效率,為了解苧麻GS基因的功能,及利用苧麻BnGS基因改良植物氮素利用效率和農(nóng)藝性狀的研究提供新的基因資源。本文主要研究結(jié)果如下: (1)首次從苧麻栽培品種“中苧1號(hào)”中克隆獲得苧麻GS基因家族中的4個(gè)基因,其中兩個(gè)屬于胞液型GS,命名為BnGS1-1和BnGS1-2;另外兩個(gè)為質(zhì)體型GS基因,命名為BnGS2-1和BnGS2-2,同時(shí)選取9株“中苧1號(hào)”自交后代,利用內(nèi)切酶TaqⅠ酶切位點(diǎn)對(duì)兩個(gè)質(zhì)體型BnGS2基因進(jìn)行TaqⅠ酶酶切鑒定,結(jié)果表明BnGS2-1和BnGS2-2為一對(duì)等位基因。 (2)利用生物信息學(xué)對(duì)苧麻GS基因序列和結(jié)構(gòu)特征進(jìn)行分析,結(jié)果表明BnGS1-1基因序列全長(zhǎng)1205bp,含一個(gè)1071bp的開放閱讀框(ORF),編碼356個(gè)氨基酸殘基多肽;BnGS1-2基因序列全長(zhǎng)1222bp,起始密碼子位于第123-125bp,終止密碼子位于1102-1104bp,編碼356個(gè)氨基酸殘基多肽;兩個(gè)BnGS2等位基因序列全長(zhǎng)1340bp,含一個(gè)1293bp的ORF區(qū),編碼430個(gè)氨基酸殘基多肽;通過(guò)序列比對(duì)發(fā)現(xiàn)BnGS2等位基因ORF區(qū)11個(gè)位點(diǎn)核苷酸存在差異,導(dǎo)致編碼的多肽在195、382兩個(gè)位點(diǎn)上的氨基酸存在替換現(xiàn)象;苧麻BnGS基因家族編碼的多肽序列含有beta-Grasp和catalytic兩個(gè)保守功能域,均屬于Gln-synt結(jié)構(gòu)域,同時(shí),BnGS2基因編碼的多肽序列含有一段信號(hào)肽;所克隆的苧麻BnGS基因家族編碼的多肽序列在56、92、249和297位點(diǎn)上的氨基酸殘基分別為天冬氨酸、半胱氨酸、組氨酸和谷氨酸,苧麻BnGS2等位基因在306和371兩個(gè)位點(diǎn)上都為半胱氨酸殘基。 (3)利用EMBOSS和MEGA軟件對(duì)苧麻BnGS基因家族進(jìn)行序列比對(duì)和系統(tǒng)進(jìn)化分析,發(fā)現(xiàn)苧麻BnGS基因在蛋白質(zhì)序列上的相似性為77.25-91.57%,在核苷酸序列上的相似性為71.15-79.37%,并且BnGS1兩個(gè)基因之內(nèi)要比BnGS1與BnGS2之間的相似性高。通過(guò)對(duì)苧麻和其它物種GS基因系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,BnGS1-2基因在進(jìn)化上起源于雙子葉植物,而BnGS1-1基因卻被聚類在單子葉植物分支上,同時(shí),苧麻BnGS1-2和BnGS2與苜蓿(Medicago sativa),大豆(Glycine max)和豌豆(Phaseolus vulgaris)等具有較近的親緣關(guān)系。 (4)利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析苧麻BnGS基因在不同部位和發(fā)育階段的表達(dá)模式,結(jié)果表明BnGS1-1、BnGS1-2和BnGS2在苧麻葉片、莖、根、韌皮部及木質(zhì)部中都有表達(dá),但在不同的部位不同的BnGS基因的表達(dá)水平卻呈現(xiàn)明顯的差異。BnGS2基因主要的表達(dá)部位為葉片,同時(shí),隨著發(fā)育階段的不同,相對(duì)表達(dá)量也呈現(xiàn)明顯的不一樣,表達(dá)量最高的時(shí)期為出苗期和纖維發(fā)育期;BnGS1-1基因在葉子、根和韌皮部中的相對(duì)表達(dá)量明顯比莖及木質(zhì)部高,但是在成熟階段葉片中BnGS1-1的mRNA水平呈顯著下降;韌皮部、木質(zhì)部和莖中的BnGS1-2基因,在纖維發(fā)育時(shí)期被大量的誘導(dǎo),表明苧麻BnGS1-2基因可能在纖維的發(fā)育過(guò)程中起著關(guān)鍵的作用。另一方面,BnGS1-1和BnGS1-2基因在苧麻整個(gè)生長(zhǎng)過(guò)程中,在根部的表達(dá)量都呈現(xiàn)較高的水平。因此,苧麻不同的BnGS基因通過(guò)在特定部位表達(dá)量水平的調(diào)節(jié),從而調(diào)控苧麻生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中對(duì)氮素營(yíng)養(yǎng)的需要。 (5)本文利用同源重組技術(shù)將苧麻BnGS1-2基因轉(zhuǎn)入pBI121植物表達(dá)載體特定位點(diǎn),構(gòu)建了能超量表達(dá)BnGS1-2基因的植物表達(dá)載體。在農(nóng)桿菌(Agrobacterium tumefaciens)LBA4404的介導(dǎo)下,通過(guò)葉盤法將構(gòu)建的超量表達(dá)載體轉(zhuǎn)入煙草中。通過(guò)Kana篩選和基因組DNA PCR驗(yàn)證,獲得轉(zhuǎn)基因煙草植株。利用Q-PCR對(duì)轉(zhuǎn)基因植株T1進(jìn)行分析,結(jié)果顯示BnGS1-2在轉(zhuǎn)基因植株中檢測(cè)到表達(dá),轉(zhuǎn)基因煙草中GS酶活性是野生型的1-2倍。超量表達(dá)BnGS1-2基因能顯著增加轉(zhuǎn)基因煙草植株的株高、鮮重和葉面積,因此,超量表達(dá)BnGS1-2基因能促進(jìn)煙草植株的生長(zhǎng);另一方面,轉(zhuǎn)基因植株體內(nèi)水溶性蛋白與野生型煙草相比呈現(xiàn)極顯著性升高,增長(zhǎng)率達(dá)92.02%,總氮含量有所提高,但并沒有達(dá)到顯著性水平,,同時(shí),轉(zhuǎn)基因植株體內(nèi)游離NH+4含量顯著下降,而游離NO-3含量與野生型相一致,因此,超量表達(dá)BnGS1-2基因,能夠促進(jìn)轉(zhuǎn)基因煙草植株對(duì)氮素的吸收和利用,提高氮代謝效率,從而能夠保證植株快速生長(zhǎng)對(duì)氮素營(yíng)養(yǎng)的需求。總之,本研究為苧麻GS基因功能的研究和應(yīng)用提供一個(gè)理論和物質(zhì)基礎(chǔ)。
【關(guān)鍵詞】:苧麻 GS基因克隆 表達(dá)模式 轉(zhuǎn)基因 超量表達(dá) 氮代謝
【學(xué)位授予單位】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號(hào)】:S563.1
【目錄】:
  • 博士學(xué)位論文評(píng)閱人、答辯委員會(huì)簽名表3-6
  • 摘要6-8
  • Abstract8-17
  • 附圖索引17-18
  • 附表索引18-19
  • 英文縮略表19-20
  • 第一章 緒論20-32
  • 1.1 植物體內(nèi)氮的營(yíng)養(yǎng)特征20-22
  • 1.1.1 氮的生物學(xué)功能20
  • 1.1.2 植物對(duì)氮的吸收和利用20-22
  • 1.2 植物谷氨酰胺合成酶研究現(xiàn)狀22-24
  • 1.2.1 谷氨酰胺合成酶的類型22
  • 1.2.2 谷氨酰胺合成酶的功能22-24
  • 1.3 植物對(duì)氮素的利用效率24-27
  • 1.3.1 硝酸的還原24-25
  • 1.3.2 氨的同化25-26
  • 1.3.3 氨基基團(tuán)的相互轉(zhuǎn)化26-27
  • 1.4 實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 技術(shù)27-29
  • 1.4.1 基本原理和過(guò)程27
  • 1.4.2 主要類型27-28
  • 1.4.3 熒光定量的方法28
  • 1.4.4 內(nèi)參基因的選擇28-29
  • 1.5 苧麻概論29-30
  • 1.5.1 苧麻基本概論29
  • 1.5.2 苧麻飼用特性29-30
  • 1.5.3 苧麻生長(zhǎng)特點(diǎn)30
  • 1.5.4 苧麻育種目標(biāo)30
  • 1.6 研究目的和意義30-32
  • 第二章 苧麻谷氨酰胺合成酶(GS)基因家族的克隆、序列和系統(tǒng)進(jìn)化分析32-47
  • 2.1 材料和方法32-37
  • 2.1.1 試驗(yàn)材料32
  • 2.1.2 儀器和試劑32
  • 2.1.3 RNA 提取和 cDNA 合成32-33
  • 2.1.4 GS 基因家族 PCR 擴(kuò)增33-34
  • 2.1.5 目的片段回收34-35
  • 2.1.6 目的片段與載體連接35
  • 2.1.7 目的片段轉(zhuǎn)化35
  • 2.1.8 目的片段序列測(cè)定35-36
  • 2.1.9 BnGS2 等位基因的鑒定36
  • 2.1.10 BnGS 基因家族序列分析36
  • 2.1.11 BnGS 基因家族進(jìn)化分析36-37
  • 2.2 試驗(yàn)結(jié)果37-45
  • 2.2.1 苧麻 RNA 的提取37
  • 2.2.2 苧麻 GS 基因家族克隆37-38
  • 2.2.3 BnGS2 等位基因鑒定38-39
  • 2.2.4 BnGS2 等位基因序列比對(duì)39-40
  • 2.2.5 BnGS 基因家族序列分析40-43
  • 2.2.6 BnGS 基因系統(tǒng)進(jìn)化分析43-45
  • 2.3 討論45-47
  • 2.3.1 BnGS 基因家族序列特征45
  • 2.3.2 BnGS 基因系統(tǒng)進(jìn)化45
  • 2.3.3 苧麻和豆科 GS 基因的關(guān)系45-46
  • 2.3.4 BnGS2 等位基因的應(yīng)用46-47
  • 第三章 苧麻 GS 基因家族在不同部位和發(fā)育階段的表達(dá)分析47-63
  • 3.1 材料和方法47-52
  • 3.1.1 試驗(yàn)材料47
  • 3.1.2 儀器和試劑47
  • 3.1.3 樣品采集47
  • 3.1.4 苧麻 RNA 提取47
  • 3.1.5 cDNA 合成47-48
  • 3.1.6 BnGS 基因 Q-PCR 引物篩選48-49
  • 3.1.7 BnGS 基因 PCR 擴(kuò)增49-50
  • 3.1.8 BnGS 基因表達(dá)模式分析50
  • 3.1.9 BnGS 和內(nèi)參基因標(biāo)準(zhǔn)曲線制備50-52
  • 3.1.10 數(shù)據(jù)分析52
  • 3.2 試驗(yàn)結(jié)果52-60
  • 3.2.1 不同部位 RNA 的提取52-53
  • 3.2.2 BnGS 基因 Q-PCR 引物篩選53
  • 3.2.3 BnGS 基因 PCR 擴(kuò)增53-54
  • 3.2.4 內(nèi)參基因 PCR 擴(kuò)增54-55
  • 3.2.5 BnGS 和內(nèi)參基因標(biāo)準(zhǔn)曲線55-57
  • 3.2.6 BnGS 和內(nèi)參基因熔解曲線57-59
  • 3.2.7 BnGS 基因不同部位和發(fā)育階段表達(dá)模式59-60
  • 3.3 討論60-63
  • 3.3.1 熒光定量 PCR 的優(yōu)點(diǎn)60-61
  • 3.3.2 熒光定量 PCR 對(duì)引物的要求61
  • 3.3.3 BnGS 基因家族的表達(dá)模式及功能分析61-63
  • 第四章 苧麻 BnGS1-2 基因超量表達(dá)載體的構(gòu)建和轉(zhuǎn)基因煙草植株的獲取63-82
  • 4.1 材料和方法63-71
  • 4.1.1 試驗(yàn)材料63
  • 4.1.2 儀器和試劑63
  • 4.1.3 試劑的配制63-64
  • 4.1.4 培養(yǎng)基的配制64-65
  • 4.1.5 RNA 提取和 cDNA 合成65
  • 4.1.6 pBI121 載體提取65-66
  • 4.1.7 pBI121 載體線性化66
  • 4.1.8 BnGS1-2 基因 PCR 擴(kuò)增66
  • 4.1.9 擴(kuò)增產(chǎn)物純化66
  • 4.1.10 BnGS1-2 基因與載體重組連接66-67
  • 4.1.11 重組載體的轉(zhuǎn)化67
  • 4.1.12 超量表達(dá)載體的提取67
  • 4.1.13 超量表達(dá)載體的檢測(cè)67
  • 4.1.14 農(nóng)桿菌感受態(tài)細(xì)胞的制備67-68
  • 4.1.15 超量表達(dá)載體轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌68
  • 4.1.16 煙草苗的培養(yǎng)68
  • 4.1.17 農(nóng)桿菌介導(dǎo)煙草遺傳轉(zhuǎn)化68-69
  • 4.1.18 轉(zhuǎn)基因植株 PCR 檢測(cè)69-70
  • 4.1.19 煙草 RNA 的提取70-71
  • 4.1.20 轉(zhuǎn)基因植株 Q-PCR 檢測(cè)71
  • 4.2 試驗(yàn)結(jié)果71-80
  • 4.2.1 RNA 的提取71-72
  • 4.2.2 pBI121 載體的提取72
  • 4.2.3 BnGS1-2 基因 PCR 擴(kuò)增72-73
  • 4.2.4 超量表達(dá)載體的構(gòu)建73-76
  • 4.2.5 超量表達(dá)載體轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌76
  • 4.2.6 煙草葉片轉(zhuǎn)化植株再生76-77
  • 4.2.7 煙草 DNA 的提取77-78
  • 4.2.8 抗性植株 PCR 檢測(cè)78-79
  • 4.2.9 轉(zhuǎn)基因植株 Q-PCR 檢測(cè)79-80
  • 4.3 討論80-82
  • 4.3.1 GS 基因超量表達(dá)載體構(gòu)建的應(yīng)用80
  • 4.3.2 BnGS 基因超量表達(dá)載體的應(yīng)用80-81
  • 4.3.3 同源重組技術(shù)的優(yōu)點(diǎn)81
  • 4.3.4 轉(zhuǎn)基因煙草植株的應(yīng)用81-82
  • 第五章 超量表達(dá) BnGS1-2 基因?qū)D(zhuǎn)基因煙草氮代謝的影響82-93
  • 5.1 材料和方法82-86
  • 5.1.1 試驗(yàn)材料82
  • 5.1.2 儀器和試劑82
  • 5.1.3 試劑的配制82-83
  • 5.1.4 株高、鮮重及葉片數(shù)測(cè)定83
  • 5.1.5 水溶性蛋白含量的測(cè)定83
  • 5.1.6 游離 NH_4~+含量的測(cè)定83
  • 5.1.7 游離 NO_3~-含量測(cè)定83-84
  • 5.1.8 總氮含量的測(cè)定84
  • 5.1.9 葉綠素含量的測(cè)定84
  • 5.1.10 GS 活性的測(cè)定84
  • 5.1.11 牛血清白蛋白標(biāo)準(zhǔn)曲線的制備84-85
  • 5.1.12 游離 NH_4~+標(biāo)準(zhǔn)曲線的制備85
  • 5.1.13 游離 NO_3~-標(biāo)準(zhǔn)曲線的制備85-86
  • 5.1.14 數(shù)據(jù)分析86
  • 5.2 試驗(yàn)結(jié)果86-91
  • 5.2.1 株高、鮮重及葉片數(shù)86-87
  • 5.2.2 游離 NO_3~-的含量87
  • 5.2.3 游離 NH_4~+的含量87-88
  • 5.2.4 總氮含量88-89
  • 5.2.5 水溶性蛋白含量89
  • 5.2.6 葉綠素含量89-90
  • 5.2.7 GS 酶活性90
  • 5.2.8 游離 NH_4~+、NO_3~-和 BAS 標(biāo)準(zhǔn)曲線90-91
  • 5.3 討論91-93
  • 5.3.1 BnGS 基因功能分析91-92
  • 5.3.2 超量表達(dá) BnGS1-2 基因煙草生長(zhǎng)特性92
  • 5.3.3 超量表達(dá) BnGS1-2 基因煙草代謝特征92-93
  • 第六章 結(jié)論93-96
  • 6.1 主要研究結(jié)果93-94
  • 6.2 主要?jiǎng)?chuàng)新點(diǎn)94
  • 6.3 今后研究的方向和目標(biāo)94-96
  • 參考文獻(xiàn)96-106
  • 致謝106-107
  • 作者簡(jiǎn)歷107-108

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):1055521

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