本文關(guān)鍵詞：基于文獻(xiàn)挖掘的結(jié)直腸癌臨床—組學(xué)關(guān)聯(lián)分析方法研究與應(yīng)用，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：隨著醫(yī)療科技的發(fā)展,大規(guī)模生物數(shù)據(jù)庫的建設(shè)以及基因測(cè)序能力的大幅提升,產(chǎn)生了海量的生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)。在積累生物實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的同時(shí),也積累了大量的非結(jié)構(gòu)化文獻(xiàn)數(shù)據(jù)。對(duì)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行整合分析,從中提煉出更多的生物醫(yī)學(xué)信息,有助于了解疾病發(fā)生發(fā)展的機(jī)制和過程,促進(jìn)疾病的診治。傳統(tǒng)的手工分析和注釋的方法已經(jīng)難以適應(yīng)快速的文獻(xiàn)增長(zhǎng),國內(nèi)外已經(jīng)有越來越多研究者關(guān)注文獻(xiàn)挖掘方法的研究�，F(xiàn)有方法多是基于“共現(xiàn)”原則,結(jié)合自然語言處理的方法進(jìn)行語義分析和語法處理,一定程度上限制“潛在”關(guān)系挖掘和待分析文章數(shù)量。且研究對(duì)象主要集中在疾病層次,目前還沒有比較權(quán)威的針對(duì)一種特定的腫瘤疾病,綜合現(xiàn)有文獻(xiàn)數(shù)據(jù),挖掘疾病相關(guān)臨床術(shù)語與基因潛在關(guān)系的研究。因此,本論文提出一種潛在關(guān)聯(lián)分析的文獻(xiàn)挖掘方法。并針對(duì)典型腫瘤疾病結(jié)直腸癌,以促進(jìn)腫瘤精準(zhǔn)防治為目標(biāo),將方法應(yīng)用到結(jié)直腸癌臨床-組學(xué)關(guān)系挖掘中,并結(jié)合生物醫(yī)學(xué)知識(shí),對(duì)挖掘結(jié)果進(jìn)行深入探究和分析。具體工作如下：提出一種基于MeSH主題詞的文獻(xiàn)挖掘方法,能夠?qū)?fù)雜的關(guān)聯(lián)分析轉(zhuǎn)化為矢量間的數(shù)學(xué)運(yùn)算,實(shí)現(xiàn)定量分析,同時(shí)避免“共現(xiàn)”原則帶來的限制,為潛在關(guān)系挖掘提供一種新的思路;選取結(jié)直腸癌為研究對(duì)象,將本文提出方法應(yīng)用于結(jié)直腸癌臨床-組學(xué)關(guān)系挖掘。并結(jié)合組學(xué)分析工具等,對(duì)挖掘得到的結(jié)果進(jìn)行分析和解釋。提出MTA1-perineural invasion(嗜神經(jīng)性侵襲,腫瘤惡化標(biāo)志)等潛在臨床-組學(xué)關(guān)系,為結(jié)直腸癌基礎(chǔ)研究提供參考;構(gòu)建結(jié)直腸癌臨床-組學(xué)關(guān)聯(lián)知識(shí)共享平臺(tái),提供挖掘結(jié)果的查詢、下載等功能,實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)分享與方法重用。結(jié)果表明,基于MeSH主題詞的文獻(xiàn)挖掘方法為疾病臨床-組學(xué)關(guān)系挖掘提供一種新的思路,也可用于其他疾病的研究和分析中。
【關(guān)鍵詞】：結(jié)直腸癌 文獻(xiàn)挖掘 精準(zhǔn)醫(yī)療 MeSH 臨床-組學(xué)關(guān)系
【學(xué)位授予單位】：浙江大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：TP311.13;R735.34
【目錄】：

• 致謝4-5
• 摘要5-6
• Abstract6-9
• 1 緒論9-18
• 1.1 引言9-11
• 1.2 國內(nèi)外研究現(xiàn)狀11-15
• 1.2.1 基于文獻(xiàn)數(shù)據(jù)的遺傳關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)庫11
• 1.2.2 人類疾病網(wǎng)絡(luò)11-13
• 1.2.3 基于語義分析的基因-疾病關(guān)聯(lián)研究13-14
• 1.2.4 GenoMesh基因關(guān)系挖掘14-15
• 1.3 研究目標(biāo)和任務(wù)15-18
• 1.3.1 本文解決的關(guān)鍵問題15
• 1.3.2 研究目標(biāo)與任務(wù)15-16
• 1.3.3 論文內(nèi)容安排16-18
• 2 基于向量空間模型的關(guān)系挖掘方法設(shè)計(jì)與實(shí)現(xiàn)18-31
• 2.1 研究對(duì)象18-22
• 2.1.1 PubMed介紹18-19
• 2.1.2 E-Utility工具19-22
• 2.2 向量空間模型原理22-25
• 2.2.1 向量空間模型介紹22-23
• 2.2.2 特征項(xiàng)集合23-25
• 2.3 方法過程與實(shí)現(xiàn)25-28
• 2.4 方法評(píng)估28-29
• 2.5 本章小結(jié)29-31
• 3 結(jié)直腸癌臨床-組學(xué)關(guān)系挖掘及結(jié)果分析31-47
• 3.1 數(shù)據(jù)源獲取31-32
• 3.1.1 臨床數(shù)據(jù)獲取31-32
• 3.1.2 基因數(shù)據(jù)獲取32
• 3.2 基于文獻(xiàn)挖掘方法的臨床-組學(xué)關(guān)聯(lián)研究與評(píng)估32-34
• 3.2.1 基于文獻(xiàn)數(shù)據(jù)的結(jié)直腸癌臨床-組學(xué)關(guān)系挖掘32-33
• 3.2.2 方法評(píng)估過程33-34
• 3.3 挖掘結(jié)果分析34-46
• 3.3.1 組學(xué)數(shù)據(jù)分析34-39
• 3.3.2 按疾病發(fā)展過程分析39-43
• 3.3.3 結(jié)合生物醫(yī)學(xué)知識(shí)的分析43-46
• 3.4 本章小結(jié)46-47
• 4 結(jié)直腸癌臨床-組學(xué)知識(shí)共享平臺(tái)設(shè)計(jì)與實(shí)現(xiàn)47-53
• 4.1 結(jié)直腸癌臨床-組學(xué)知識(shí)共享平臺(tái)設(shè)計(jì)47-48
• 4.2 結(jié)直腸癌臨床-組學(xué)關(guān)系共享平臺(tái)實(shí)現(xiàn)48-52
• 4.2.1 首頁48-49
• 4.2.2 結(jié)直腸癌臨床-組學(xué)關(guān)系查詢與下載49-50
• 4.2.3 結(jié)直腸癌臨床-組學(xué)關(guān)系可視化50-51
• 4.2.4 結(jié)直腸癌臨床-組學(xué)關(guān)系重分析51-52
• 4.3 本章小結(jié)52-53
• 5 總結(jié)與展望53-55
• 5.1 總結(jié)53-54
• 5.2 展望54-55
• 附錄55-59
• 參考文獻(xiàn)59-62
• 作者簡(jiǎn)歷62

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本文編號(hào)：389400