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島嶼隔離對(duì)桔小實(shí)蠅種群遺傳多樣性的影響

發(fā)布時(shí)間:2017-07-19 05:17

  本文關(guān)鍵詞:島嶼隔離對(duì)桔小實(shí)蠅種群遺傳多樣性的影響


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【摘要】:地理阻隔是限制物種擴(kuò)散和影響遺傳多樣性的一個(gè)重要因素,島嶼作為天然屏障的隔離作用對(duì)有翅昆蟲遺傳多樣性的影響具有重要意義。本研究利用采自廣州、珠海、湛江、臺(tái)山、云浮,廣西北海、南寧、鐘山,云南蒙自、福建漳州、河南鄭州、四川寧南12個(gè)大陸桔小實(shí)蠅種群和外伶仃島、東澳島、荷包島、硇洲島、潿洲島、上川島6個(gè)離島種群,通過(guò)形態(tài)遺傳標(biāo)記、線粒體DNA細(xì)胞色素氧化酶第Ⅰ亞基基因(mt DNA COⅠ)序列及8個(gè)微衛(wèi)星DNA位點(diǎn)分子遺傳標(biāo)記分析,研究了桔小實(shí)蠅島嶼種群與大陸種群的遺傳結(jié)構(gòu)及遺傳分化,以探索島嶼隔離對(duì)桔小實(shí)蠅遺傳結(jié)構(gòu)、遺傳差異的影響。主要研究結(jié)果如下:1)形態(tài)標(biāo)記種群間遺傳差異結(jié)果顯示:桔小實(shí)蠅島嶼種群的翅面積、橫脈長(zhǎng)度明顯小于大陸種群,翅脈角沒(méi)有顯著差異。三個(gè)橫脈長(zhǎng)度與翅面積的大小成顯著正相關(guān),緯度對(duì)桔小實(shí)蠅種群個(gè)體大小無(wú)顯著影響。2)線粒體COⅠ分子標(biāo)記結(jié)果表明:從所測(cè)的337條桔小實(shí)蠅COⅠ序列中共觀測(cè)到163個(gè)單倍型,其中共享單倍型38個(gè),單倍型網(wǎng)絡(luò)圖總體呈現(xiàn)星狀分布,表明桔小實(shí)蠅經(jīng)歷過(guò)種群擴(kuò)張過(guò)程。18個(gè)桔小實(shí)蠅種群總體表現(xiàn)出較高水平的核苷酸多樣性(0.00706)和高水平的單倍型多樣性(0.9674±0.0055)。F-統(tǒng)計(jì)法度量種群間遺傳分化程度結(jié)果顯示島嶼種群與內(nèi)陸種群遺傳分化較弱,引起種群總體變異的主要因素是種群內(nèi)的個(gè)體間變異。3)微衛(wèi)星分子標(biāo)記研究顯示:應(yīng)用8對(duì)微衛(wèi)星引物共檢測(cè)到122個(gè)等位基因4個(gè)大陸種群、6個(gè)島嶼種群的平均表觀雜合度HO、預(yù)期雜合度HE、Nei's預(yù)期雜合度、多態(tài)位點(diǎn)百分率相同,分別為0.3321、0.7008、0.6833和100%。大陸種群的平均觀測(cè)等位基因數(shù)NA、有效等位基因數(shù)NE、Shannon’s為6.344、3.6838、1.4271,6個(gè)島嶼種群的平均觀測(cè)等位基因數(shù)NA、有效等位基因數(shù)NE、Shannon’s為3.8755、1.4587、0.3321,且經(jīng)過(guò)T檢驗(yàn)均無(wú)顯著差異。6個(gè)島嶼桔小實(shí)蠅種群和4個(gè)大陸桔小實(shí)蠅種群具有比較豐富的遺傳多樣性。經(jīng)過(guò)AMOVA分子方差分析顯示,變異主要來(lái)自個(gè)體間,而種群間的遺傳變異很低。各種群間的地理距離與遺傳距離無(wú)顯著相關(guān)性。
【關(guān)鍵詞】:桔小實(shí)蠅 形態(tài)標(biāo)記 微衛(wèi)星標(biāo)記 線粒體基因 遺傳多樣性 島嶼
【學(xué)位授予單位】:華南農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:S433
【目錄】:
  • 摘要3-4
  • Abstract4-8
  • 1 前言8-14
  • 1.1 遺傳多樣性的研究方法8-11
  • 1.1.1 形態(tài)遺傳標(biāo)記8-9
  • 1.1.2 分子遺傳標(biāo)記9-10
  • 1.1.3 海域隔離對(duì)遺傳多樣性的影響10-11
  • 1.2 桔小實(shí)蠅種群遺傳多樣性研究進(jìn)展及地理隔離的影響11-13
  • 1.3 本研究的目的及意義13-14
  • 2 材料和方法14-24
  • 2.1 試驗(yàn)材料14
  • 2.2 島嶼采樣點(diǎn)生境信息14-15
  • 2.3 主要試劑和設(shè)備15-16
  • 2.3.1 主要藥品及試劑15-16
  • 2.3.2 瓊脂糖電泳所用的有關(guān)試劑16
  • 2.3.3 主要儀器設(shè)備16
  • 2.4 試驗(yàn)方法16-24
  • 2.4.1 形態(tài)研究方法16-17
  • 2.4.2 桔小實(shí)蠅基因組提取17-18
  • 2.4.3 mt DNA試驗(yàn)方法18-20
  • 2.4.4 微衛(wèi)星試驗(yàn)方法20-24
  • 3 結(jié)果與分析24-50
  • 3.1 形態(tài)遺傳分析24-27
  • 3.1.1 形態(tài)差異顯著性分析24-26
  • 3.1.2 相關(guān)性分析26-27
  • 3.2 線粒體DNA遺傳分析27-40
  • 3.2.1 COⅠ 基因的確定27-28
  • 3.2.2 COⅠ 序列特征及片段多樣性分析結(jié)果28-30
  • 3.2.3 種群遺傳多樣性分析30-34
  • 3.2.4 種群歷史動(dòng)態(tài)分析34-37
  • 3.2.5 單倍型聚類分析37-38
  • 3.2.6 種群系統(tǒng)發(fā)育樹38-39
  • 3.2.7 個(gè)體大小與核苷酸多樣性相關(guān)性分析39-40
  • 3.3 微衛(wèi)星DNA遺傳分析40-50
  • 3.3.1 等位基因頻率40-43
  • 3.3.2 桔小實(shí)蠅地理種群的遺傳多樣性43-44
  • 3.3.3 各種群的遺傳分化44-45
  • 3.3.4 種群遺傳聚類分析45-47
  • 3.3.5 遺傳變異來(lái)源分析47-48
  • 3.3.6 種群動(dòng)態(tài)48
  • 3.3.7 地理距離隔離檢驗(yàn)48-50
  • 4 結(jié)論50
  • 5 討論50-53
  • 5.1 遺傳多樣性50-51
  • 5.2 遺傳分化51-53
  • 5.2.1 形態(tài)遺傳分化51
  • 5.2.2 分子遺傳分化51-53
  • 致謝53-54
  • 參考文獻(xiàn)54-59

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

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本文編號(hào):561382

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