基于MiSeq測(cè)序分析新疆泥火山土壤細(xì)菌群落多樣性
本文關(guān)鍵詞:基于MiSeq測(cè)序分析新疆泥火山土壤細(xì)菌群落多樣性,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:【目的】以新疆烏蘇泥火山土壤為研究對(duì)象,了解泥火山細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)及其時(shí)空動(dòng)態(tài)變化。【方法】選擇泥火山4種不同生境土壤在4、7、11月份采樣,應(yīng)用Illumina Mi Seq測(cè)序技術(shù)測(cè)定泥火山土壤細(xì)菌的16S r RNA基因V3 V4變異區(qū)序列,分析烏蘇泥火山不同生境土壤細(xì)菌群落組成!窘Y(jié)果】泥火山土壤細(xì)菌在97%的相似水平下共得到OTU個(gè)數(shù)為29 005,在細(xì)菌門水平上共有38種細(xì)菌類群,Proteobacteria、Actinobacteria、Bacteroidetes為優(yōu)勢(shì)菌群,在屬水平上共有72種細(xì)菌類群,其中含量最高的是未分類細(xì)菌;多樣性分析表明生境D的豐度指數(shù)和多樣性指數(shù)最高,將泥火山細(xì)菌群落多樣性與理化因子結(jié)合分析,發(fā)現(xiàn)其多樣性隨著土壤養(yǎng)分的增加而基本降低,說明物種多樣性指數(shù)與理化因子之間呈負(fù)相關(guān)關(guān)系;OTU水平的分析表明生境A的群落組成在時(shí)空動(dòng)態(tài)上沒有顯著差異,其樣品群落組成較為相似,而生境C的物種組成差異較大!窘Y(jié)論】相比較于傳統(tǒng)方法,Mi Seq測(cè)序能夠更全面解析環(huán)境樣品中微生物多樣性,揭示了烏蘇泥火山群蘊(yùn)含著豐富的微生物資源,這將為深入研究泥火山生態(tài)系統(tǒng)奠定基礎(chǔ),為合理利用和開發(fā)泥火山微生物資源提供指導(dǎo)。
【作者單位】: 石河子大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】: 泥火山 優(yōu)勢(shì)菌群 MiSeq測(cè)序 細(xì)菌群落
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.30860001)~~
【分類號(hào)】:S154.3
【正文快照】: 泥火山是由泥漿形成的,只因它的噴發(fā)形式和噴發(fā)后形成的堆積物在外形上與火山有些相似,因此稱其泥火山[1]。新疆烏蘇具有亞洲最大的泥火山群,其特殊的環(huán)境是研究微生物資源的最佳場(chǎng)所[2]。土壤微生物是土壤的重要組成部分,土壤微生物群落的變化在一定程度上可以反映土壤質(zhì)量的
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本文編號(hào):477079
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