本文關(guān)鍵詞：太白山典型植被土壤微生物多樣性及放線菌資源研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：秦嶺是我國南北地理和氣候的分界線,巨大的高山落差形成其獨有的垂直氣候帶,植被帶及土壤類型亦相應(yīng)變化,蘊含著豐富的微生物資源。本文以秦嶺主峰太白山不同海拔典型純林植被土壤為研究材料,通過設(shè)計不同分離培養(yǎng)基,初步探究太白山不同植被土壤放線菌分離方法;并進一步以分離得到的放線菌為研究材料,通過構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,探討太白山地區(qū)放線菌資源的多樣性;同時利用高通量測序技術(shù)對太白山原核微生物多樣性進行研究。主要研究結(jié)果如下:1.南坡pH含量為5.68-6.41,北坡pH含量為5.07-6.58,北坡變幅比南坡大,北坡最低pH為5.07;有機質(zhì)含量極差較大,最大為77.8 g/kg,最小為11.7 g/kg;南坡供試土壤全氮含量最高為5.35 g/kg,北坡僅為2.81 g/kg,南坡土壤全氮含量高于北坡;硝銨態(tài)氮含量南北坡差異不大;速效磷含量南坡最高值為7.15 mg/kg,北坡最高值為4.05mg/kg,南坡土壤速效磷含量高于北坡;速效鉀含量南北坡基本持平。整體而言,太白山南北坡土壤養(yǎng)分大體呈現(xiàn)中海拔林地含量相對較高,如巴山冷杉,低海拔林地與高海拔林地含量相對較低,如銳齒櫟和高山草甸,即自低海拔至高海拔不同林地類型土壤養(yǎng)分整體呈現(xiàn)先升高后降低的趨勢。2.分離放線菌效果最好的是改良甘油-天門冬酰胺培養(yǎng)基,該培養(yǎng)基在南北坡分離數(shù)量及種類上均占優(yōu),數(shù)量最高可達258×104 cfu/g土,種類最多為35種;改良高氏培養(yǎng)基在南坡的分離效果整體優(yōu)于北坡,更適用于分離南坡不同林地的土壤放線菌;R2A培養(yǎng)基在分離中海拔及高海拔林地的放線菌優(yōu)勢更明顯;海藻糖-脯氨酸培養(yǎng)基在分離放線菌數(shù)量及種類都最少,數(shù)量最高為7.0×104 cfu/g土,種類最多僅有4種。中海拔林地類型,如北坡的紅皮樺、牛皮樺,南坡的牛皮樺,分離的放線菌數(shù)量均顯著高于其它林地類型,最高海拔的高山草甸分離的放線菌數(shù)量最少。3.通過對太白山區(qū)土樣中分離的427株放線菌進行16S rDNA序列測定、結(jié)果比對去重和進一步分析,確定427株菌為89個種,分屬23個屬,顯示太白山土壤蘊含大量的放線菌資源。其中優(yōu)勢種群是鏈霉菌屬(Streptomyces),占供試菌株的88.06%,而在鏈霉菌屬(Streptomyces)中,S.enissocaesilis、S.cirratus和S.nojiriensis為優(yōu)勢種;除鏈霉菌屬(Streptomyces)外,余下的22個屬中,諾卡氏菌屬(Nocardia)為優(yōu)勢菌屬,分布較為廣泛,北里孢菌屬(Kitasatospora)、短桿菌屬(Renibacterium)和節(jié)桿菌屬(Arthorobacter)豐度相對較好。4.太白山南北坡土壤放線菌種屬差異較大。鑒定的23個屬中,南北坡共有的放線菌屬11個,北坡特有放線菌屬7個,分別是為厄氏菌屬(Overskovia)、不動桿菌屬(Acinetobacter)、葡萄球菌(Staphylococcus)、短芽孢桿菌屬(Brevibacillus)、黃桿菌屬(Flavobacterium)、韓國生工菌屬(Kribbella)和假單胞菌屬(Pseudomonas);南坡特有的放線菌屬5個,分別是放線菌共生放線桿菌(Aggregatibacter)、噬甲基菌屬(Methylophilus)、假黃色單胞菌屬(Micromonospora)、新鞘氨醇桿菌屬(Novosphingobium)和小單孢菌屬(Pseudoxanthomonas)。對不同植被多樣性進行分析發(fā)現(xiàn),每種植被土壤均存在其特有菌屬,可見不同植被土壤放線菌種類存在差異。5.高通量測序的覆蓋率指數(shù)(Good’s coverage)顯示相似度為0.97的條件下,土壤OTUs涵蓋了土壤中98.1-99.4%的細菌,覆蓋指數(shù)較高,說明本次測序結(jié)果可以準確地反映土壤中微生物多樣性的真實情況。群落結(jié)構(gòu)分析表明,在門水平,含量相對豐富的是變形菌門(Proteobacteria)、酸桿菌門(Acidobacteria)、放線菌門(Actinobacteria)、綠彎菌門(Chloroflexi)、硝化螺旋菌門(Nitrospirae)、擬桿菌(Bacteroidetes)、芽單胞菌門(Gemmatimonadetes)、厚壁菌門(Firmicutes)、疣微菌門(Verrucomicrobia)、纖維桿菌門(Fibrobacteres)、Candidates-division-TM7、浮霉菌門(Planctomycetes)、Candidates-division-WS3。其中,Proteobacteria(變形菌門)在所有樣品中的豐度均最高。Actinobacteria(放線菌門)在不同土樣的豐度存在一定差異,北坡遼東櫟和南北坡太白紅杉相對豐度較高,均高于20%;最高海拔高山草甸的豐度一般。且放線菌門(Actinobacteria)的相對豐度呈現(xiàn)先降低后升高的趨勢,這與分離得到可培養(yǎng)放線菌的分布規(guī)律一致。
【關(guān)鍵詞】：太白山 放線菌 16S rDNA 高通量測序 種群多樣性 生態(tài)分布
【學(xué)位授予單位】：西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：S154.3
【目錄】：

• 摘要5-7
• ABSTRACT7-11
• 第一章 文獻綜述11-19
• 1.1 放線菌資源研究的意義11
• 1.2 秦嶺地區(qū)微生物資源研究11-12
• 1.2.1 秦嶺地區(qū)概況11-12
• 1.2.2 放線菌資源12
• 1.3 放線菌的篩選12-14
• 1.3.1 樣品的預(yù)處理13
• 1.3.2 抑制劑13
• 1.3.3 培養(yǎng)基13-14
• 1.4 高通量測序技術(shù)14-17
• 1.4.1 高通量測序技術(shù)簡介14-15
• 1.4.2 高通量測序技術(shù)在細菌分類學(xué)的應(yīng)用15
• 1.4.3 高通量測序技術(shù)在宏基因組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)的應(yīng)用15-16
• 1.4.4 高通量測序技術(shù)在單細胞測序中的應(yīng)用16-17
• 1.5 論文設(shè)計思路17-19
• 1.5.1 研究目的及意義17
• 1.5.2 研究內(nèi)容17-18
• 1.5.3 技術(shù)路線18-19
• 第二章 太白山典型植被土壤養(yǎng)分特征19-26
• 2.1 材料與方法19-20
• 2.1.1 材料19-20
• 2.1.2 方法20
• 2.2 結(jié)果與分析20-24
• 2.2.1 pH21-22
• 2.2.2 有機質(zhì)22
• 2.2.3 氮素營養(yǎng)22-23
• 2.2.4 磷素營養(yǎng)23-24
• 2.2.5 鉀素營養(yǎng)24
• 2.3 小結(jié)與討論24-26
• 第三章 太白山典型植被土壤放線菌的分離及生態(tài)分布規(guī)律26-34
• 3.1 材料與方法26-27
• 3.1.1 材料26-27
• 3.1.2 方法27
• 3.2 結(jié)果與分析27-32
• 3.2.1 不同培養(yǎng)基分離放線菌數(shù)量27-28
• 3.2.2 不同培養(yǎng)基分離放線菌種類28-29
• 3.2.3 不同林地類型分離放線菌的數(shù)量及分布規(guī)律29-30
• 3.2.4 不同林地類型分離放線菌的種類及分布規(guī)律30-31
• 3.2.5 放線菌數(shù)量與土壤養(yǎng)分的相關(guān)性31-32
• 3.3 小結(jié)與討論32-34
• 第四章 太白山典型植被土壤可培養(yǎng)放線菌種群多樣性及生態(tài)分布規(guī)律34-48
• 4.1 材料與方法34-36
• 4.1.1 材料34
• 4.1.2 方法34-36
• 4.2 結(jié)果與分析36-46
• 4.2.1 16S rDNA序列分析36-42
• 4.2.2 放線菌新物種資源分析42
• 4.2.3 太白山放線菌種屬分布規(guī)律42-43
• 4.2.4 不同坡向放線菌種屬分布規(guī)律43-44
• 4.2.5 不同植被類型放線菌種屬分布規(guī)律44-46
• 4.3 小結(jié)與討論46-48
• 第五章 基于高通量測序技術(shù)的微生物多樣性及生態(tài)分布規(guī)律48-59
• 5.1 材料與方法48-49
• 5.1.1 材料48
• 5.1.2 方法48-49
• 5.2 結(jié)果與分析49-57
• 5.2.1 樣本測序結(jié)果及取樣深度驗證49-51
• 5.2.2 不同林地類型土壤細菌多樣性分析51-52
• 5.2.3 不同林地土壤細菌群落結(jié)構(gòu)分析52-54
• 5.2.4 聚類分析54-56
• 5.2.5 主成分分析56-57
• 5.3 小結(jié)與討論57-59
• 第六章 總結(jié)59-62
• 6.1 結(jié)論59-61
• 6.2 本研究的創(chuàng)新點61
• 6.3 展望61-62
• 參考文獻62-69
• 附錄69-71
• 致謝71-72
• 作者簡介72

【相似文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 劉愛民,黃紅英,潘繼紅,張林普;安徽師大校園內(nèi)土壤放線菌區(qū)系初步調(diào)查[J];安徽師范大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版);2000年02期

2 安德榮,慕小倩,趙文軍,劉翠娟,史遂校;土壤放線菌分離中抑制劑的應(yīng)用研究[J];西北農(nóng)業(yè)學(xué)報;2002年01期

3 蘇濤;馬宗琪;司美茹;;魯西南地區(qū)土壤放線菌的生態(tài)分布[J];山東農(nóng)業(yè)科學(xué);2006年02期

4 鄭雅楠;楊宇;呂國忠;谷祖敏;;土壤放線菌分離方法研究[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2006年06期

5 顏霞;薛泉宏;朱銘莪;;西藏土壤放線菌細胞成分及生理生化特性研究[J];西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版);2007年10期

6 司美茹;蘇濤;李桂芝;;濟寧市土壤放線菌資源調(diào)查研究[J];山東農(nóng)業(yè)科學(xué);2008年04期

7 余麗;晏愛芬;;高黎貢山土壤放線菌初步研究[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2008年26期

8 野野村·英夫;徐麗華;;選擇性分離土壤放線菌的新方法[J];國外醫(yī)藥(抗生素分冊);1989年05期

9 余純麗;四川四面山地區(qū)土壤放線菌分布特性[J];渝州大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版);1995年01期

10 徐麗華,楊宇容,姜成林;云南土壤放線菌生態(tài)分布的研究[J];微生物學(xué)報;1996年03期

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前8條

1 蔡艷;薛泉宏;陳占全;常顯波;孫小鳳;司美茹;來航線;張榮;;青藏高原東部土壤放線菌生態(tài)分布研究(摘要)[A];中國地壤學(xué)會第十次全國會員代表大會暨第五屆海峽兩岸土壤肥料學(xué)術(shù)交流研討會文集（面向農(nóng)業(yè)與環(huán)境的土壤科學(xué)專題篇）[C];2004年

2 關(guān)統(tǒng)偉;張利莉;;塔里木盆地荒漠鹽堿生境土壤放線菌的初步研究[A];2006中國微生物學(xué)會第九次全國會員代表大會暨學(xué)術(shù)年會論文摘要集[C];2006年

3 張雪芳;王海龍;鄭計梅;張建麗;;西雙版納土壤放線菌分離與活性鑒定[A];第四屆全國微生物資源學(xué)術(shù)暨國家微生物資源平臺運行服務(wù)研討會論文集[C];2012年

4 韓秀芳;鄭計梅;魏雪新;張建麗;;海南土壤放線菌分離與多相分類[A];第五屆全國微生物資源學(xué)術(shù)暨國家微生物資源平臺運行服務(wù)研討會論文摘要集[C];2013年

5 高艷紅;郝慧;張利莉;;塔里木盆地北緣土壤放線菌及其拮抗奶牛乳房炎病原菌的分離篩選研究[A];中國微生物學(xué)會《第二屆全國農(nóng)業(yè)微生物研究及產(chǎn)業(yè)化研討會》和《第十一屆全國殺蟲微生物學(xué)術(shù)研討會》暨《湖北省暨武漢市微生物學(xué)會和內(nèi)蒙古微生物學(xué)會2008年會》論文摘要[C];2008年

6 彭珧;楊靜玉;吳春福;張怡軒;;一株鑒定為Streptomyces capillispiralis的土壤放線菌抑制A549細胞增殖活性的考察及其機制的初步研究[A];2008年中國微生物學(xué)會學(xué)術(shù)年會論文摘要集[C];2008年

7 宋飛;張建麗;張娟;;新疆天山土壤放線菌分離菌株的DNA指紋圖譜分析及拮抗活性研究[A];2008年中國微生物學(xué)會學(xué)術(shù)年會論文摘要集[C];2008年

8 牛曉慶;余鳳玉;朱輝;唐慶華;宋薇薇;;椰子林土壤放線菌的分離及其拮抗椰子瀉血病菌的篩選[A];植�？萍紕�(chuàng)新與病蟲防控專業(yè)化——中國植物保護學(xué)會2011年學(xué)術(shù)年會論文集[C];2011年

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 阮昌應(yīng);紅樹林土壤放線菌新種的發(fā)現(xiàn)及活性代謝產(chǎn)物研究[D];陜西理工學(xué)院;2015年

2 張文迪;連云港海岸帶土壤可培養(yǎng)放線菌多樣性及其生物學(xué)功能初步研究[D];江蘇師范大學(xué);2014年

3 安曉英;纈草內(nèi)生及根際土壤放線菌的分離鑒定及次級代謝產(chǎn)物生物合成基因的克隆[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2015年

4 王雪嘯;土壤放線菌SPRIC-1次級代謝產(chǎn)物農(nóng)用活性化合物的分離提取和結(jié)構(gòu)鑒定[D];華東理工大學(xué);2016年

5 王鶴;太白山典型植被土壤微生物多樣性及放線菌資源研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2016年

6 羅紅麗;西藏地區(qū)土壤放線菌種群多樣性及戈登氏菌的多相分類研究[D];西南大學(xué);2006年

7 盛婷;土壤放線菌Ⅲ-172次級代謝產(chǎn)物的分離、純化及結(jié)構(gòu)鑒定[D];上海師范大學(xué);2015年

8 蔡艷;青海高原（東部）土壤放線菌資源及應(yīng)用研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2002年

9 饒麗娟;塔里木盆地土壤放線菌分布及抗動物病原菌菌株篩選的研究[D];吉林大學(xué);2005年

10 司美茹;青海高原（西部）土壤放線菌資源及應(yīng)用研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2003年

  本文關(guān)鍵詞：太白山典型植被土壤微生物多樣性及放線菌資源研究，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

本文編號：401719