利用白云巖喀斯特土壤微生物16S rRNA V4及ITS1區(qū)的高通量測(cè)序數(shù)據(jù),分析土壤微生物群落結(jié)構(gòu)特征。基于PICRUSt算法預(yù)測(cè)土壤微生物群落功能基因組,應(yīng)用皮爾遜相關(guān)系數(shù)解析土壤性質(zhì)與土壤微生物群落多樣性及代謝通路的相關(guān)性。結(jié)果顯示:白云巖喀斯特土壤微生物主要分布于15個(gè)菌門(mén),其中以變形菌門(mén)(Proteobacteria)、酸桿菌門(mén)(Acidobacteria)、放線菌門(mén)(Actinobacteria)、子囊菌門(mén)(Ascomycota)、擔(dān)子菌門(mén)(Basidiomycota)和接合菌門(mén)(Zygomycota)為最主要的優(yōu)勢(shì)菌門(mén)。基于PICRUSt功能基因預(yù)測(cè),共獲得6 208個(gè)同源功能基因(KEGG Orthology),富集于311條代謝通路(metabolism pathway)。其中與氨基酸代謝、碳水化合物代謝等有關(guān)的基因在種類(lèi)和數(shù)量上都占預(yù)測(cè)功能基因中的絕對(duì)優(yōu)勢(shì)。相關(guān)性分析表明:土壤微生物多樣性與土壤性質(zhì)間存在相關(guān)性,尤其以土壤微生物多樣性與Emg²⁺間相關(guān)性最為顯著。61條代謝通路與土壤交換鈣(ECa²⁺)、土壤有機(jī)碳(SOC...

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圖1稀釋曲線

本研究針對(duì)施秉白云巖喀斯特地區(qū)采集的11個(gè)土壤樣品提取宏基因組DNA;基于Illumina平臺(tái),對(duì)16SrRNAV4區(qū)及ITS1區(qū)進(jìn)行高通量測(cè)序;并對(duì)測(cè)序下機(jī)數(shù)據(jù)進(jìn)行嚴(yán)格的質(zhì)控處理,以97%的序列相似度作為分類(lèi)閾值,對(duì)OTUs聚類(lèi)。共獲取901320條16SrRNAV4....

圖2細(xì)菌分類(lèi)樹(shù)

由圖3可知:基于門(mén)的分類(lèi)水平分析,白云巖喀斯特土壤真菌群落主要包含4個(gè)菌門(mén):子囊菌門(mén)、壺菌門(mén)(Chytridiomycota)、擔(dān)子菌門(mén)和接合菌門(mén)。其豐度依次為53.2%±4.8、2.4%±0.7、18.2%±3.1、25.1%±3.5,其中以子囊菌門(mén)豐度最高,其物種組成也最為豐....

圖3真菌分類(lèi)樹(shù)

利用Manteltest分析白云巖喀斯特土壤微生物群落與土壤性質(zhì)之間的相關(guān)性。結(jié)果表明(見(jiàn)圖4):在白云巖喀斯特土壤中,土壤微生物群落與土壤性質(zhì)之間顯著相關(guān)(P=0.034,P=0.041)。進(jìn)一步利用皮爾遜相關(guān)系數(shù)分析不同門(mén)類(lèi)微生物群落與土壤性質(zhì)之間的相互關(guān)系,結(jié)果顯示(見(jiàn)圖....

圖4土壤性質(zhì)與微生物群落之間的相關(guān)性

圖3真菌分類(lèi)樹(shù)2.4土壤性質(zhì)與細(xì)菌代謝功能之間的相互作用

本文編號(hào)：3972864