探討適合紅樹林土壤環(huán)境DNA的提取及純化方法,篩選出可以提取到高質(zhì)量且物種覆蓋度廣的環(huán)境DNA的方法。本研究通過多種方法提取和純化紅樹林土壤環(huán)境DNA,并進(jìn)行物種覆蓋度(細(xì)菌、真菌、底棲無脊椎動(dòng)物、植物、線蟲)的比較評(píng)估。用6種方法提取紅樹林潮間帶林下土壤環(huán)境DNA,并使用2種方法對(duì)DNA進(jìn)行純化;用不同物種類群的通用引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,評(píng)估各種方法提取和純化的環(huán)境DNA的物種覆蓋度。結(jié)果顯示,不同方法提取DNA的效率有一定的差異,但2種方法純化前后DNA的質(zhì)量并沒有顯著差異;5種試劑盒方法提取的DNA均可以有效擴(kuò)增出細(xì)菌和無脊椎動(dòng)物的DNA;DNeasy PowerSoil試劑盒提取的DNA擴(kuò)增植物引物結(jié)果最佳;來自不同區(qū)域紅樹林土壤的DNA在擴(kuò)增真菌對(duì)應(yīng)引物時(shí)差異較大;2種試劑盒直接提取的DNA可以有效擴(kuò)增出線蟲的DNA。本研究為今后基于環(huán)境DNA技術(shù)研究紅樹林生物多樣性工作的順利開展提供科學(xué)依據(jù),奠定了一定的基礎(chǔ)。

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【文章目錄】：
0 引言
1 材料與方法
    1.1 樣品采集
    1.2 土壤粒徑測(cè)定
    1.3 土壤環(huán)境DNA提取
        1.3.1 SDS-GITC-PEG法提取
        1.3.2 試劑盒法提取
    1.4 DNA純化
    1.5 PCR擴(kuò)增
    1.6 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 土壤粒徑分析
    2.2 土壤環(huán)境DNA提取和純化
    2.3 PCR擴(kuò)增結(jié)果
3 討論
4 結(jié)論



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