發(fā)布時(shí)間：2022-01-07 08:42

　　【背景】南極地區(qū)環(huán)境苛刻植被稀少,無(wú)冰區(qū)面積約占其總面積的0.4%,但是土壤中存在著豐富的微生物群落,對(duì)于極地微生物資源仍需要進(jìn)一步挖掘�！灸康摹揩@得南極恩克斯堡島土壤中可培養(yǎng)細(xì)菌多樣性信息�！痉椒ā繉�(duì)來(lái)源于南極恩克斯堡島的5個(gè)土壤樣品采用直接涂布、微好氧富集和有氧富集后涂布3種方法進(jìn)行細(xì)菌分離培養(yǎng)�！窘Y(jié)果】共獲得144株可培養(yǎng)細(xì)菌,分布于5門(mén)30個(gè)屬。這些菌株來(lái)自變形菌門(mén)（Proteobacteria,38.9%）、放線菌門(mén)（Actinobacteria,34.0%）、厚壁菌門(mén)（Firmicutes,22.2%）、異常球菌-棲熱菌門(mén)（Deinococcus-Thermus,3.5%）、擬桿菌門(mén)（Bacteroidetes,1.4%）等。不同土壤樣品中可培養(yǎng)細(xì)菌多樣性存在差異。企鵝糞土中Bacillus是主要屬類(lèi);Pseudomonas、Streptomyces在植被覆蓋區(qū)土壤中是優(yōu)勢(shì)菌屬;Psychrobacter在湖水邊土壤中是優(yōu)勢(shì)屬類(lèi),Flavobacterium、Chryseobacterium僅從該樣品中分離得到;放線菌門(mén)類(lèi)在干燥土壤樣中占優(yōu)勢(shì),Pseudarthrobact... 

【文章來(lái)源】：微生物學(xué)通報(bào). 2020,47(06)北大核心CSCD

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【部分圖文】：

3種培養(yǎng)方法在R2A培養(yǎng)基上得到細(xì)菌在屬水平數(shù)目韋恩圖

5份土壤樣品中共分離得到144株可培養(yǎng)細(xì)菌，對(duì)分離菌株16S rRNA基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增、測(cè)序和序列比對(duì)，發(fā)現(xiàn)這些菌株來(lái)自5個(gè)門(mén)，分布在30個(gè)屬52個(gè)種(表2)。如圖1顯示，最多的是變形菌門(mén)56株，達(dá)到總分離株的38.9%；其次是放線菌門(mén)49株，占比34.0%；厚壁菌門(mén)32株，占總數(shù)的22.2%；異常球菌-棲熱菌門(mén)5株，占總數(shù)的3.5%；擬桿菌門(mén)最少，僅有2株，占總數(shù)的1.4%。將16S rRNA基因測(cè)序結(jié)果在EzTaxon數(shù)據(jù)庫(kù)中比對(duì)獲得參考序列，應(yīng)用MEGA 6.0軟件繪制系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)，得到進(jìn)化樹(shù)如圖2所示。從系統(tǒng)發(fā)育分析的結(jié)果可以看出，放線菌門(mén)中最多的是鏈霉菌屬(Streptomyces)14株，其次是節(jié)桿菌屬(Arthrobacter)7株，最少的類(lèi)谷氨酸桿菌屬(Paeniglutamicibacter)、庫(kù)克菌屬(Kocuria)和韓國(guó)生工屬(Kribbella)各1株。變形菌門(mén)中分別有α、β和γ三個(gè)亞門(mén)，α變形菌亞門(mén)最多的是Aureimonas，有7株；β變形菌類(lèi)只有貪噬菌屬(Variovorax)；γ變形菌亞門(mén)中最多的是嗜冷桿菌屬(Psychrobacter)(22株)，其次是假單胞菌屬(Pseudomonas)(15株)。對(duì)144株菌株測(cè)序時(shí)發(fā)現(xiàn)，有2株菌(1株屬于變形菌門(mén)，1株屬于放線菌門(mén))的16S rRNA基因序列相似度均小于97%，可以認(rèn)為是潛在新種[21]。這兩株潛在新種的菌株鑒定工作正在進(jìn)行中。2.2 不同培養(yǎng)方法在同種平板獲得可培養(yǎng)細(xì)菌的多樣性

為了使可培養(yǎng)細(xì)菌的多樣性增加，本實(shí)驗(yàn)用了3種方法，分別是直接涂布培養(yǎng)、微好氧富集和有氧富集在不同時(shí)間段涂布培養(yǎng)。3種方式在R2A平板上分離到的可培養(yǎng)細(xì)菌的種類(lèi)有區(qū)別。直接涂布法分離得到11個(gè)屬，獨(dú)有7個(gè)屬；有氧富集分離得到9個(gè)屬，獨(dú)有5個(gè)屬；微好氧富集獨(dú)有2個(gè)屬，分別是Paeniglutamicibacter和Acinetobacter。上述結(jié)果說(shuō)明在R2A平板上，有氧富集和無(wú)氧富集均獲得特有屬，有氧富集涂布與直接涂布法共有的屬4個(gè)，包括Staphylococcus、Rhodococcus、Pseudarthrobacte和Arthrobacter，微好氧富集獲得可培養(yǎng)細(xì)菌種類(lèi)少(圖3)。圖3 3種培養(yǎng)方法在R2A培養(yǎng)基上得到細(xì)菌在屬水平數(shù)目韋恩圖

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]北極苔原土壤中可培養(yǎng)細(xì)菌的分離及其抗菌活性測(cè)定[J]. 賀瑞含,杜宗軍,俞勇,李會(huì)榮.  微生物學(xué)報(bào). 2019(06)
[2]南極菲爾德斯半島可培養(yǎng)土壤微生物多樣性及理化性質(zhì)鑒定[J]. 劉春影,叢柏林,王能飛,王波,尹曉斐,劉峰.  海洋學(xué)報(bào). 2016(06)
[3]從環(huán)境中分離培養(yǎng)微生物:培養(yǎng)基營(yíng)養(yǎng)水平至關(guān)重要[J]. 周楠,姜成英,劉雙江.  微生物學(xué)通報(bào). 2016(05)
[4]南極北維多利亞地難言島侵入巖LA-ICP-MS鋯石U-Pb年齡及其地質(zhì)意義[J]. 王偉,胡健民,陳虹,于根旺,趙越,劉曉春.  地質(zhì)通報(bào). 2014(12)
[5]南海南沙海域沉積物中可培養(yǎng)微生物及其多樣性分析[J]. 孫風(fēng)芹,汪保江,李光玉,劉秀片,杜雅萍,賴其良,邵宗澤.  微生物學(xué)報(bào). 2008(12)



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