絕對(duì)定量分析不同條銹病抗性小麥品種根際細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)
發(fā)布時(shí)間:2021-11-02 02:11
【目的】分析不同條銹病抗性小麥品種根際細(xì)菌群落的結(jié)構(gòu)和功能差異,為開發(fā)防治小麥條銹病的環(huán)境友好方案提供理論基礎(chǔ)和創(chuàng)新思路!痉椒ā恳酝坏貕K中對(duì)條銹病具有不同抗性的4個(gè)小麥品種(抗病品種貴農(nóng)19和華麥1223,感病品種002和I19)為研究材料,采集不同抗性小麥品種根際土壤樣品,采用絕對(duì)定量擴(kuò)增子分析技術(shù),研究抗病和感病小麥品種根際細(xì)菌的群落結(jié)構(gòu)和功能!窘Y(jié)果】同一地塊的4個(gè)小麥品種條銹病病情指數(shù)具有明顯差異。4個(gè)小麥品種根際土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)絕對(duì)定量分析表明,感病與抗病小麥品種的根際細(xì)菌群落分別聚類成獨(dú)立的兩類。感病小麥品種根際細(xì)菌群落豐度和多樣性顯著高于抗病小麥品種根際細(xì)菌群落(P<0.05)。坐標(biāo)分析(PCoA)表明,所有小麥品種根際細(xì)菌群落按照抗病性不同分為兩組;細(xì)菌群落功能分析表明,抗病小麥品種根際細(xì)菌群落具有更多的氨基酸和抗生素分泌功能!窘Y(jié)論】條銹病抗性對(duì)小麥根際細(xì)菌群落的影響超過(guò)小麥不同品種間遺傳變異的影響。通過(guò)分析和挖掘不同條銹病抗性小麥品種的根際細(xì)菌群落,可開發(fā)出環(huán)境友好的小麥條銹病生物防治菌劑。
【文章來(lái)源】:南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2020,51(05)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【部分圖文】:
不同條銹病抗性小麥品種的根際細(xì)菌群落物種組成的聚類圖
微生物的相對(duì)豐度只表征一個(gè)樣本中微生物類群的相對(duì)比例。與相對(duì)定量分析相比,絕對(duì)定量分析確定了每個(gè)微生物類群的絕對(duì)量,有利于不同樣本間的比較。條銹病感病和抗病小麥品種根際土壤樣本細(xì)菌群落相對(duì)和絕對(duì)定量聚類結(jié)果見圖2。相對(duì)定量分析數(shù)據(jù)顯示,小麥各品種間聚類較雜亂,感病小麥品種與抗病小麥品種未聚類在一起;絕對(duì)定量分析數(shù)據(jù)顯示,感病小麥品種與抗病小麥品種分成獨(dú)立的兩類。條銹病感病和抗病小麥品種根際土壤樣本細(xì)菌群落相對(duì)定量和絕對(duì)定量比較見圖3。與感病小麥品種(S)相比,抗病小麥品種(R)根際土壤中細(xì)菌的總豐度相對(duì)較小。絕對(duì)定量分析顯示,與抗病小麥品種相比,感病小麥品種根際的變形菌門(Proteobacteria)和擬桿菌門(Bacteroidetes)均顯著升高(P<0.05,下同);相對(duì)定量分析顯示,感病小麥根際放線菌門(Actinobacteria)含量低于抗病小麥,但絕對(duì)定量分析顯示,兩種小麥的根際細(xì)菌群落中Actinobacteria的絕對(duì)量無(wú)顯著差異(P>0.05,下同)。綜上所述,因絕對(duì)定量分析數(shù)據(jù)能更準(zhǔn)確地反映真實(shí)情況,使用絕對(duì)定量測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行后續(xù)分析。
根據(jù)PCoA(在Weighted UniFrac上計(jì)算,圖5-A)和平均連鎖分層聚類(UPGMA,在Bray-Curtis上計(jì)算,圖5-B),感病小麥品種與抗病小麥品種根際細(xì)菌群落在PCo1(67.98%)水平上明顯分開。感病和抗病小麥品種內(nèi)部,細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的差異不明顯,說(shuō)明條銹病抗性的差異對(duì)小麥植株根際細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)具有顯著影響,且其影響大于小麥不同品種間基因型差異的影響。圖4 不同條銹病抗性小麥品種根際細(xì)菌群落的α多樣性指數(shù)
本文編號(hào):3471139
【文章來(lái)源】:南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2020,51(05)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【部分圖文】:
不同條銹病抗性小麥品種的根際細(xì)菌群落物種組成的聚類圖
微生物的相對(duì)豐度只表征一個(gè)樣本中微生物類群的相對(duì)比例。與相對(duì)定量分析相比,絕對(duì)定量分析確定了每個(gè)微生物類群的絕對(duì)量,有利于不同樣本間的比較。條銹病感病和抗病小麥品種根際土壤樣本細(xì)菌群落相對(duì)和絕對(duì)定量聚類結(jié)果見圖2。相對(duì)定量分析數(shù)據(jù)顯示,小麥各品種間聚類較雜亂,感病小麥品種與抗病小麥品種未聚類在一起;絕對(duì)定量分析數(shù)據(jù)顯示,感病小麥品種與抗病小麥品種分成獨(dú)立的兩類。條銹病感病和抗病小麥品種根際土壤樣本細(xì)菌群落相對(duì)定量和絕對(duì)定量比較見圖3。與感病小麥品種(S)相比,抗病小麥品種(R)根際土壤中細(xì)菌的總豐度相對(duì)較小。絕對(duì)定量分析顯示,與抗病小麥品種相比,感病小麥品種根際的變形菌門(Proteobacteria)和擬桿菌門(Bacteroidetes)均顯著升高(P<0.05,下同);相對(duì)定量分析顯示,感病小麥根際放線菌門(Actinobacteria)含量低于抗病小麥,但絕對(duì)定量分析顯示,兩種小麥的根際細(xì)菌群落中Actinobacteria的絕對(duì)量無(wú)顯著差異(P>0.05,下同)。綜上所述,因絕對(duì)定量分析數(shù)據(jù)能更準(zhǔn)確地反映真實(shí)情況,使用絕對(duì)定量測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行后續(xù)分析。
根據(jù)PCoA(在Weighted UniFrac上計(jì)算,圖5-A)和平均連鎖分層聚類(UPGMA,在Bray-Curtis上計(jì)算,圖5-B),感病小麥品種與抗病小麥品種根際細(xì)菌群落在PCo1(67.98%)水平上明顯分開。感病和抗病小麥品種內(nèi)部,細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的差異不明顯,說(shuō)明條銹病抗性的差異對(duì)小麥植株根際細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)具有顯著影響,且其影響大于小麥不同品種間基因型差異的影響。圖4 不同條銹病抗性小麥品種根際細(xì)菌群落的α多樣性指數(shù)
本文編號(hào):3471139
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