為研究崇明西紅花栽培地根際土壤和球莖中微生物多樣性,采用Illumina MiSeq高通量測序技術(shù)對其微生物群落組成進行了比對分析。結(jié)果表明,西紅花根際土壤和球莖中細菌和真菌在門類水平上菌群類別差異不顯著,但在豐富度和多樣性方面根際土壤明顯高于球莖;在屬和種水平上差異顯著;在種水平上,根際土壤或球莖均有各自特有的細菌或真菌,且具有較高的相對豐度。西紅花致病真菌瓶霉（Phialophora）和背芽突霉（Cadophora）在崇明西紅花球莖大量存在。因此,推測西紅花病害發(fā)生,除與土壤菌群相關(guān)外,與其內(nèi)生細菌和真菌也緊密相關(guān)。本研究結(jié)果初步分析了崇明栽培地西紅花根際土壤和球莖中微生物多樣性及群落結(jié)構(gòu)組成,為進一步篩選合適的崇明西紅花栽培地土壤和種球殺菌劑提供了理論依據(jù)。 

【文章來源】：核農(nóng)學(xué)報. 2020,34(11)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

西紅花根際土壤和球莖中細菌

通過Ⅰ-Sanger 生信云平臺分析根際土壤和球莖中細菌和真菌在種水平上的差異表達。由圖3可知,西紅花根際土壤中細菌相對豐度顯著高于球莖,在球莖中相對豐度極低,甚至未檢出;而藍細菌(Cyanobacteria)、鏈霉菌(Streptomyces)、芽孢桿菌(Bacillus)和糖多孢菌(Saccharopolyspora)在球莖中的相對豐度顯著高于根際土壤,其中球莖和根際土壤的Cyanobacteria相對豐度分別為13.74%和0.16%,Streptomyces分別為8.26%和0.06%;球莖中芽孢桿菌、糖多孢菌的相對豐度分別是根標土壤的11.73和291.91倍。由圖4可知,根際土壤和球莖中真菌在種水平上的差異表達與細菌規(guī)律相似,除了未分類的真菌,根際土壤中相對豐度較高的真菌在球莖中相對豐度基本低于0.001%,而球莖中相對豐度較高的真菌在根際土壤中的相對豐度基本低于0.013%。在球莖中大量檢測到Penicillium、Penicillium_roseopurpureum、Penicillium_steckii、Exobasidium_sp和Cadophora,相對豐度分別為7.86%、7.07%、6.64%和6.20%和5.65%,而根際土壤中基本均為0.01%左右。此外,Cadophora僅在西紅花球莖中檢出。圖3 西紅花根際土壤和球莖中細菌群落在種水平上的組成差異

西紅花根際土壤和球莖中細菌群落在種水平上的組成差異

【參考文獻】：
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