防御假單胞菌（Pseudomonas protegens）是一種具備生防功能的環(huán)境微生物,其宿主種類多樣,普遍存在于土壤、植物、水體等自然環(huán)境中。防御假單胞菌SN15-2通過分泌多種類抗生素來抑制病原菌的生長,根際高效定殖能力和分泌噬鐵素的功能也是該菌發(fā)揮生防能力的重要原因。但是SN15-2在實際應(yīng)用中的瓶頸問題是抗逆境能力差,高溫條件下容易失活,且制劑貨架期短。目前對SN15-2面對逆境環(huán)境的調(diào)控機理研究較少,因此探索防御假單胞菌面對逆境時的調(diào)節(jié)機制具有重要的學(xué)術(shù)價值和現(xiàn)實意義。本研究對SN15-2進(jìn)行全基因組測序和分析,發(fā)現(xiàn)該菌含有6433個蛋白編碼基因（占全基因組的88.31%）,208種非編碼RNA,tRNA有71個,16條微衛(wèi)星DNA和14條CRISPR序列。防御假單胞菌SN15-2基因組的6433個蛋白編碼基因中,分別有5210、3259、5277個基因在COG、KEGG、GO數(shù)據(jù)庫中得到注釋。通過建立蛋白進(jìn)化發(fā)育樹發(fā)現(xiàn)SN15-2中的SpoT蛋白中存在多個保守的氨基酸序列,這幾個保守殘基在很大程度上影響蛋白酶的活性。SpoT蛋白與熒光假單胞菌和銅綠假單胞菌中的同源蛋白之間... 

【文章來源】：華東理工大學(xué)上海市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：78 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

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本文編號：3127048