蛋白質乙酰化調控Bacillus nematocida B16殺線蟲初探
發(fā)布時間:2021-04-05 07:01
植物寄生線蟲每年導致巨大的全球農作物經(jīng)濟損失,是限制農業(yè)生產的第二大因子,而線蟲生物防治因為其綠色安全的特性逐漸成為線蟲防治研究的熱點。殺線蟲芽孢桿菌B16(Bacillus nematocida)對線蟲例如松木線蟲具有良好的殺蟲活性。文獻報道蛋白質賴氨酸乙;揎椪{控細胞各方面的生理活動,那么蛋白質乙酰化是否調控B16與線蟲之間的相互作用呢?通過TMT(串聯(lián)質量標簽)標記的LC-MS/MS技術,我們對B16的乙;鞍捉M進行了測序,并對乙;嚢彼嵛稽c的乙;胶偷鞍踪|表達水平進行了定量分析。1.總共在349個蛋白質中鑒定到了529乙;稽c,使用多種生物信息方法對乙;鞍踪|進行分析,包括COG功能分類、GO富集分析、KEGG pathway分析、乙酰化肽段二級結構分析和motif分析。通過這些分析發(fā)現(xiàn),在這些蛋白質中22個參與了B16吸引線蟲物質的合成,另外,Sec A(K42)和Sec Y(K373)參與了殺線蟲蛋白酶的分泌。2.定量分析了殺線蟲的過程中線蟲對B16蛋白質表達水平的影響。對鑒定到的1980個蛋白中的1592個蛋白質進行了相對定量分析,發(fā)現(xiàn)13個蛋白質的表達水平...
【文章來源】:云南大學云南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:117 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
B16蛋白關聯(lián)樣本檢測注:每一泳道上樣30μg,M:蛋白marker;1、2道.B16的蛋白(B16);3、4道.線蟲處理B16的蛋白(B16C)
MS數(shù)據(jù)的QC驗證
賴氨酸上乙;植迹ˋ),與枯草芽孢桿菌乙;嚢彼嵛稽c比較(B,C)
本文編號:3119365
【文章來源】:云南大學云南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:117 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
B16蛋白關聯(lián)樣本檢測注:每一泳道上樣30μg,M:蛋白marker;1、2道.B16的蛋白(B16);3、4道.線蟲處理B16的蛋白(B16C)
MS數(shù)據(jù)的QC驗證
賴氨酸上乙;植迹ˋ),與枯草芽孢桿菌乙;嚢彼嵛稽c比較(B,C)
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