發(fā)布時(shí)間：2021-01-24 00:33

　　為明確褐土中脲酶編碼基因的表達(dá)豐度,通過(guò)土壤RNA提取和宏轉(zhuǎn)錄組測(cè)序法,篩選RNA水平上表達(dá)較高的脲酶基因,共篩選到122個(gè)脲酶結(jié)構(gòu)基因（93個(gè)ureC、16個(gè)ureB和13個(gè)ureA）和脲酶輔助基因115個(gè)（29個(gè)ureD、12個(gè)ureE、36個(gè)ureF、29個(gè)ureG、5個(gè)ureH和4個(gè)ureJ）。其中ureB、ureA、ureG、ureH和ureJ所有轉(zhuǎn)錄本TPM值都小于2,而ureC、ureD、ureE和ureF豐度最高的轉(zhuǎn)錄本TPM值分別為3.17、5.37、2.01和2.71。細(xì)菌來(lái)源的芽孢桿菌屬Bacillus、芽孢八疊球菌屬Sporosarcina、節(jié)桿菌屬Arthrobacter、鏈霉屬Streptomyces和類(lèi)芽孢桿菌屬Paenibacillus等在褐土脲酶活性的發(fā)揮中貢獻(xiàn)度較大。 

【文章來(lái)源】：煙草科技. 2020,53(11)北大核心

【文章頁(yè)數(shù)】：8 頁(yè)

【部分圖文】：

序列匹配的菌株數(shù)量分布

土壤RNA轉(zhuǎn)錄本的微生物來(lái)源

如圖4所示，ure C、ure B、ure A、ure D、ure E、ure F、ure G、ure H和ure J等脲酶基因中，編碼α亞基的ure C基因數(shù)量最多，表達(dá)值TPM在0～1之間的有66個(gè)，1～2之間的有21個(gè)，大于2的有6個(gè)，最高的DN897996＿c0＿g1為3.16。編碼β亞基的ure B基因有16個(gè)，表達(dá)值TPM在0～1之間的有12個(gè)，1～2之間的有4個(gè)。編碼γ亞基的ure A基因有13個(gè)，表達(dá)值TPM在0～1之間的有9個(gè)，1～2之間的有4個(gè)。另外ure D、ure E和ure F的表達(dá)值最高的分別為5.31、2.00和2.71，其中ure D表達(dá)值TPM超過(guò)2的有3個(gè)轉(zhuǎn)錄本，分別為DN911511＿c0＿g1(2.03）、DN893873＿c0＿g1(3.31）和DN907166＿c3＿g2(5.31）。ure H和ure J數(shù)量較少，表達(dá)值也較低。圖4 脲酶基因的表達(dá)情況

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號(hào)：2996217