植物根際土壤和根組織內(nèi)棲息著豐富多樣的微生物,這些微生物在植物的生長、發(fā)育、健康以及產(chǎn)量等方面發(fā)揮著重要的作用。理解植物根際和根內(nèi)生微生物種類組成、結(jié)構(gòu)、多樣性及其功能,對于理解植物微生物形成機制和生態(tài)學(xué)功能、解析微生物-植物-病害相互作用機制、以及挖掘和開發(fā)新的植物促生和病害防治資源與策略具有重要的意義。本課題以番茄為材料,采用基于高通量測序與宏基因組學(xué)研究了番茄根際與根內(nèi)生細(xì)菌菌群結(jié)構(gòu)和多樣性,栽培品種和土壤對植物微生物的影響,不同生長時期番茄根微生物菌群結(jié)構(gòu)和多樣性變化以及番茄根微生物組主要功能特性等。結(jié)果表明,番茄根際細(xì)菌主要由 Acidobacteria Subgroups、Burkholderiales、Cytophagales、Gemmatimonadales、Rhizobiales、Sphingobacteriales、Sphingomonadales、Xanthomonadales 等優(yōu)勢種群組成,分屬于 Acidobacteria、Bacteroidetes、Gemmatimonadetes和Proteobacteria等細(xì)菌門。而根內(nèi)生細(xì)菌主要由Bacillus、... 

【文章來源】：福建師范大學(xué)福建省

【文章頁數(shù)】：111 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１－１稀釋曲線（Ａ：番茄品種試驗；Ｂ：?土壤類型試驗）??Ｆｉｇ．１－１?Ｉｎｄｉｖｉｄｕａｌ?ｒａｒｅｆａｃｔｉｏｎ?ｃｕｒｖｅｓ?ｆｏｒ?ａｌｌ?ｓａｍｐｌｅｓ．?（Ａ：?Ｔｈｅ?ｔｏｍａｔｏ?ｃｕｌｔｉｖａｒ?

Ａｃｉｄｏｂａｃｔｅｒｉａ?的?Ｓｕｂｇｒｏｕｐｓ，以及?Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ?的?Ｍｙｘｏｃｏｃｃａｌｅｓ?和?ＴＲＡ３－２０?具有較??低的ＯＴＵｓ豐度；而屬于Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ的Ｍｅｔｈｙｌｏｐｈｉｌａｌｅｓ卻具有較高的ＯＴＵｓ豐度??（圖１－４）。此外，基于豐度最高ＯＴＵｓ的聚類分析也表明，不同的樣本（品種或亞??種的分類差異）沒有明顯的聚集趨勢（圖１－４）。??采用基于ＯＴＵ的Ａｌｐｈａ多樣性（ＯＴＵ數(shù)、Ｃｈａｏｌ指數(shù)、ＡＣＥ指數(shù)、Ｓｈａｎｎｏｎ??指數(shù)及Ｓｉｍｐｓｏｎｓ指數(shù)）分析和對比不同番茄品種根際細(xì)菌的多樣性（圖１－５Ａ、Ｂ、??Ｃ，表１－５）。稀釋曲線圖表明所有樣本的數(shù)據(jù)量合理，且每個樣本中大多數(shù)的ＯＴＵｓ??都被檢測到（圖１－１Ａ）。此外，所有樣品的覆蓋率（Ｃｏｖｅｒａｇｅ）指數(shù)都在９２％以上，??說明測序深度足夠（表１－５）。??八?Ｃ?Ｈｕｉｔｌ?Ｉｔｕｌｃｘ?Ｈ?ＳｌｉｉｌｉＭＨｉｄ?ｉｉｔｔｌｃｘ??Ｊ４ＵＯ?Ｖｓ???＝??９．７?—?＿＿＿?—?？??－－Ｂ?｜?曰？＇?ｒｉＰ?ｐ??９，?＿?二１?＿?—」＝＿?－Ｌ——Ｉ?—?＾＿＿－??“?－?—?鬥?「＿??１?－?．?Ｉ?．???????２４００?－??－??ｕｐ?ｉｉｓ?ｉｎ?＼＼７?ｍｃ．?ｑｋ?ｒ？?＼ｙ?ｖｒ?７＼?ｉｉｐ?ｉｉｓ?ｉｒｒ?ｕ／?ｍ＜，?Ｔｔ、?ｘｚ?ｖｒ?ｚｗ??Ｃ?ＯＴＵ?ｎｕｍｂｅｒ?Ｄ??２３００

ｔｙｐｅｓ；?Ｂ：?Ｔｈｅ?ｓｏｉｌ?ｓａｍｐｌｅｓ?ｅｘｃｅｐｔ?ｆｏｒ?Ｃｏｍｍｏｄｉｔｙ?ｓｏｉｌｓ?ＣＦ?ａｎｄ?ＨＦ）??對相對豐度前１００的ＯＴＵｓ?（占總抽平序列的２９．８％）繪制可視化的熱點圖??（Ｈｅａｔｍａｐ）（圖１－８），顯示這些ＯＴＵｓ在不同樣品中的數(shù)目和豐度變化。基于相對??豐度前１００的ＯＴＵｓ聚類分析結(jié)果表明，樣本根據(jù)其土壤類型顯著聚類（圖１－８）。??根據(jù)ＯＴＵｓ的組成和相對豐度，樣本分為兩組，其中一組包括ＣＦ和ＨＦ?（商品化營??養(yǎng)土），與其他五種土壤相比，其番前根際細(xì)菌中屬于Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ中的??Ｎｉｔｒｏｓｏｍｏｎａｄａｌｅｓ、Ｂｕｒｋｈｏｌｄｅｒｉａｌｅｓ?和?Ｒｈｏｄｏｓｐｉｒｉｌｌｌｌａｌｅｓ，以及?Ａｃｉｄｏｂａｃｔｅｒｉａ?中的??Ａｃｉｄｏｂａｃｔｅｒｉａｌｅｓ?和?Ｓｕｂｇｒｏｕｐｓ?具有較低的?ＯＴＵｓ?豐度；而?Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ?中的??Ｍｙｘｏｃｏｃｃａｌｅｓ、?Ｍｅｔｈｙｌｏｐｈｉｌａｌｅｓ?和?Ｏｃｅａｎｏｓｐｉｒｉｌｌａｌｅｓ，?Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ?中的??Ａｃｉｄｉｍｉｃｒｏｂｉａｌｅｓ，以及?Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ?中的?Ｃｙｔｏｐｈａｇａｌｅｓ?具有較高的?ＯＴＵｓ?豐度（圖??１－８）。樣本ＤＭ、ＨＱ、ＪＸ、ＱＳ和ＸＣ構(gòu)成了另一組，進(jìn)一步劃分為兩個小組：ＱＳ??（森林土壤）和ＤＭ、ＨＱ、ＪＸ和ＸＣ?（農(nóng)日丨土壤：包括花園、農(nóng)業(yè)、草坪場和菜田）。??從旗山森林公園收集土壤樣本ＱＳ

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]根際微生物研究概況[J]. 麥靖雯,黎瑞君,張巨明.  現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2017(13)
[2]番茄根內(nèi)生假單胞菌的分離與鑒定[J]. 馬榮琴,曹毅,周俊雄,葉朝松,張媞,陳明波,馬紹城,田寶玉.  生物技術(shù). 2015(06)
[3]不同質(zhì)地土壤煙株根際微生物菌群變化分析[J]. 王淑玉,李小龍,李紅麗,曾強,王巖,林卿,田甜,孫妍.  湖南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(03)
[4]植物根際微生物的影響因素研究進(jìn)展[J]. 徐文靜,靳曉東,楊秋生.  河南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(05)
[5]番茄內(nèi)生細(xì)菌種群動態(tài)分析及拮抗菌株的篩選[J]. 王美琴,劉慧平,韓巨才,路濤.  中國農(nóng)學(xué)通報. 2010(09)
[6]植物內(nèi)生細(xì)菌的侵染定殖規(guī)律研究進(jìn)展[J]. 路國兵,張瑤,冀憲領(lǐng),牟志美,高繪菊,吳緒東.  生物技術(shù)通報. 2007(03)
[7]石油污染土壤修復(fù)植物的根-土界面微生物特征[J]. 藺昕,李培軍,孫鐵珩,李曉軍,孫麗娜.  應(yīng)用生態(tài)學(xué)報. 2007(03)
[8]廣西番茄內(nèi)生細(xì)菌的多樣性和數(shù)量動態(tài)[J]. 黎起秦,謝義靈,林緯,韋繼光,羅寬.  生物多樣性. 2006(06)
[9]番茄莖內(nèi)生細(xì)菌的分離鑒定及青枯病拮抗菌的篩選[J]. 胡青平,徐建國,劉會龍,陳五嶺,朱戰(zhàn)燁.  西北植物學(xué)報. 2006(10)
[10]根際微生物研究進(jìn)展[J]. 陸雅海,張福鎖.  土壤. 2006(02)

博士論文
[1]豆科植物根際和根瘤內(nèi)生細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)、變化規(guī)律及其影響因素研究[D]. 肖瀟.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2017

碩士論文
[1]谷子根際營養(yǎng)及根際微生物的研究[D]. 范博.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016



本文編號：2930631