二化螟滯育誘導(dǎo)期對(duì)光周期信號(hào)的分子響應(yīng)研究
【學(xué)位單位】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:S433.4
【部分圖文】:
技術(shù)路線圖
二化螟滯育誘導(dǎo)期對(duì)光周期信號(hào)的分子響應(yīng)研究處理,即 A1-A6 和 B1-B6。A 組中的幼蟲飼養(yǎng)在 LD16:8 h 條件下,在不同期用 LD12:12 h 對(duì)幼蟲進(jìn)行光周期轉(zhuǎn)換處理。處理 A1 的幼蟲一直飼養(yǎng)16:8 h 條件下;處理 A2 的幼蟲在 7、8 日齡時(shí)接受 LD12:12 h 處理,其余均接受 LD16:8 h 處理;處理 A3 的幼蟲在第 9、10 日齡接受 LD12:12 h 處余時(shí)間均接受 LD16:8 h 處理,其他處理以此類推。B 組中的幼蟲飼養(yǎng)12:12 h 條件下,在不同的時(shí)期用 LD16:8 h 對(duì)幼蟲進(jìn)行光周期轉(zhuǎn)換處理。試?yán)砭唧w見圖 2-1。每個(gè)處理 50-60 頭幼蟲,并設(shè)置 3 個(gè)生物學(xué)重復(fù)。二化螟蟲期 51 天后仍不化蛹視為其已進(jìn)入滯育(Chen et al 2016),統(tǒng)計(jì)各處理進(jìn)育的幼蟲數(shù)量,計(jì)算各處理滯育率。
二化螟幼蟲滯育率較低,分別為 97.6%和 80.6%顯著低于處理 B1、B2、B6 的滯育率(圖3-1 B)。已有研究表明二化螟 3 齡期屬于滯育誘導(dǎo)的敏感齡期(Xiao et al 2009a),而二化螟 9-12 日齡時(shí)期屬于 3 齡期。3.2 二化螟滯育誘導(dǎo)期響應(yīng)光周期信號(hào)的差異表達(dá)基因?yàn)榱松钊胩骄慷跍T導(dǎo)期對(duì)光周期的響應(yīng)機(jī)制,本研究應(yīng)用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù),篩選二化螟滯育誘導(dǎo)期敏感期響應(yīng)光周期信號(hào)的差異表達(dá)基因。結(jié)合以往的研究,本研究在二化螟幼蟲期 10 日齡對(duì) LD12:12 h 和 LD16:8 h 光周期下的二化螟進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。3.2.1 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果質(zhì)量評(píng)估和 Trinity 拼接樣品測(cè)序結(jié)果質(zhì)量評(píng)估見表 3-1。各樣品測(cè)序結(jié)果錯(cuò)誤率均為 0.02%,GC 比例在 46%到 48%之間。RL、RS 這 2 個(gè)處理中得到的 Clean Reads 分別為 69203734條、75863594 條。將所得 Clean Reads 進(jìn)行 Trinity 拼接之后得到共得到 Transcripts197995 條,Unigenes 94448 條。測(cè)序結(jié)果中 Transcripts 和 Unigenes 的分布情況見圖 3-2 和圖 3-3。其中,Transcripts 的平均長(zhǎng)度為 713 bp,長(zhǎng)度在 200-500 bp之間的 Transcripts 占 67.64%;Unigenes 平均長(zhǎng)度為 1195 bp,長(zhǎng)度在 500-1000 bp之間的 Unigenes 占 29.83%(表 3-2)。
【參考文獻(xiàn)】
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本文編號(hào):2853988
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