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一株土壤新種Rhodopseudomonas albus SK50-23~T的分類鑒定

發(fā)布時間:2020-08-25 14:06
【摘要】:光合細菌(Photosynthetic bacteria)是自然界中普遍存在的,具有原始光能合成體系的厭氧光照條件下生長的原核生物。光合細菌在自然界中廣泛分布于江河、湖泊、稻田、沼池、土壤、極地和溫泉等處。光合細菌依據(jù)所含光合色素和電子供體的不同分為產(chǎn)氧光合細菌和不產(chǎn)氧光合細菌。而紫色非硫細菌是不產(chǎn)氧光合細菌中的重要分支,其中紅假單胞菌屬(Rhodopseudomonas)主要存在于溝渠的表層水、淡水、微咸水、海洋棲息地及稻田和缺氧的潮汐池。之前,鉈耐性細菌菌株SK50-23~T是從鉈脅迫土壤懸浮液中作為優(yōu)勢菌被分離出,其16S rRNA部分基因序列與已知的紅假單胞菌(Rhodopseudomonas)模式菌株的相似度達96%。為此本論文對菌株SK50-23~T從形態(tài)結(jié)構(gòu)、遺傳學、生理生化學、化學成分分析等方面進行了新菌的分類鑒定。菌株SK50-23~T的16S rRNA基因序列與其最親緣的非光合營養(yǎng)的“Rhodopseudomonas boonkerdii”NS23,具有97.9%的相似性,而與Rhodopseudomonas屬其他菌株的相似性為95.5-96.7%。菌株SK50-23~T適合生長溫度為15-32℃,最適生長pH和NaCl濃度分別為6-7和0%。碳源利用實驗顯示只能利用葡萄糖酸鹽。酶活性檢測試驗中堿性磷酸酶,酯酶(C4),酯酶脂肪酶(C8),亮氨酸芳基酰胺酶和酸性磷酸酶呈陽性,萘酚磷酸水解酶呈弱陽性。存在氧化酶,過氧化氫酶和脲酶,吲哚產(chǎn)量為陰性。硝酸鹽被還原為N_2。主要脂肪酸(10%)是C18:1ω7c(54.9%)和C18:0(14.8%),C16:1ω7c(13.5%)和C16:0(12.6%),次要脂肪酸是C17:0環(huán)(2.6%),C17:0(0.9%)和未鑒定的脂肪酸(0.7%)。主要的泛醌是Q-10。菌株的DNA G+C含量為61.9mol%。此外,該菌株既沒有檢測出光合功能基因,也不能利用光進行光合作用生長。基于形態(tài)學、化學分類學和16S rRNA基因的系統(tǒng)發(fā)育上表現(xiàn)出來的特征,認定菌株SK 50-23~T為紅假單胞菌屬的一個細菌新種。在本文章中我們建議修正的Rhodopseudomonas屬包括非光合生物。因此,提出菌株SK50-23~T被分類為紅假單胞菌屬的新種,命名為Rhodopseudomonas albus sp.nov.模式菌株為SK50-23~T,菌種保藏號分別為NBRC 108825~T和CGMCC No.1.12037~T。菌株SK50-23屬于α-變形菌綱紫色非硫細菌類群中的紅假單胞菌屬(Rhodopseudomonas)。本研究的意義在于豐富菌種資源的同時為光合細菌物種進化角度和環(huán)境適應(yīng)性等方面的研究打下基礎(chǔ),對深入研究紫色非硫細菌類群的特性具有一定的現(xiàn)實意義。
【學位授予單位】:內(nèi)蒙古大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:S154.3
【圖文】:

紅假單胞菌,代謝模式


圖1.1 Rhodopseudomonas Palustris的四種代謝方式Fig 1.1 Four metabolic modes of Rhodopseudomonas Palustris正是因為紅假單胞菌(Rhodopseudomonas)屬有多種代謝模式,才能夠讓其在不同

技術(shù)路線圖


技術(shù)路線圖

菌株,活性實驗,基因序列


圖 3.1 菌株 SK50-23 基于 16S rRNA 基因序列的鄰接系統(tǒng)發(fā)育樹Fig 3.1. Neighbour-joining phylogenetic tree based on 16S rRNA gene sequences.3.2 光合功能活性實驗及基因檢測結(jié)果

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本文編號:2803789

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