本文選題：ACC脫氨酶　切入點：根際細菌　出處：《西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版)》2017年06期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：【目的】對楊凌和長武兩地小麥根際土壤中能產(chǎn)生1-氨基環(huán)丙烷-1-羧酸(ACC)細菌的多樣性進行調(diào)查比較�！痉椒ā恳訟CC為唯一氮源從小麥根際土壤中富集和純化產(chǎn)ACC脫氨酶細菌,使用Mi-seq高通量測序平臺對富集產(chǎn)物進行多樣性檢測,構(gòu)建16SrDNA基因克隆文庫,對所分離的產(chǎn)ACC脫氨酶細菌進行系統(tǒng)發(fā)育分析;利用R語言繪圖,對兩地區(qū)該類細菌群落結(jié)構(gòu)進行對比研究�！窘Y(jié)果】長武地區(qū)小麥根際土壤2個樣品中優(yōu)化后的序列共計55 715條,基于97%的相似性被劃分為35個OTU,Shannon多樣性指數(shù)為1.43和0.6,Simpson多樣性指數(shù)為0.380 5和0.773 7,經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育分析,主要隸屬于假單胞菌屬(Pseudomonas)、腸桿菌屬(Enterobacteriaceae)、無色桿菌屬(Achromobacter)、不動桿菌屬(Acinetobacter)和乳球菌屬(Lactococcus),所占比例分別為73.26%,15.86%,4.03%,3.26%和1.87%。楊凌地區(qū)小麥根際土壤2個樣品中優(yōu)化后序列共計34 044條,基于97%的相似性被劃分為37個OTU,Shannon多樣性指數(shù)為2.21和2.38,Simpson多樣性指數(shù)為0.181 7和0.140 4,經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育分析,主要隸屬于腸桿菌屬(Enterobacteriaceae)、無色桿菌屬(Achromobacter)、假單胞菌屬(Pseudomonas)、芽孢桿菌屬(Bacillus)、寡養(yǎng)單胞菌屬(Stenotrophomonas),所占比例分別為37.66%,23.51%,14.90%,9.07%和5.80%�！窘Y(jié)論】楊凌、長武地區(qū)小麥產(chǎn)ACC脫氨酶根際促生細菌的種類有部分重疊,但豐度差異較大,在空間分布上呈現(xiàn)一定程度的地緣隔離,調(diào)查結(jié)果可用于指導(dǎo)產(chǎn)ACC脫氨酶根際促生菌的資源開發(fā)及施用效果研究。
[Abstract]:[objective] to investigate and compare the diversity of 1-aminocyclopropane-1-carboxylic acid (ACC) producing bacteria in wheat rhizosphere soil between Yang Ling and Changwu. [methods] ACC deaminase producing bacteria were enriched and purified from wheat rhizosphere soil with ACC as the sole nitrogen source. Using Mi-seq high-throughput sequencing platform to detect the diversity of enriched products, construct 16s rDNA gene clone library, analyze the phylogeny of the isolated ACC deaminase bacteria. The community structure of this kind of bacteria was compared between the two regions. [results] 55,715 optimized sequences were obtained from two samples of wheat rhizosphere soil in Changwu area. The similarity based on 97% was divided into 35 OTU Shannon diversity indices of 1.43 and 0.6 Simpson diversity indices of 0.380 5 and 0.773 7, respectively. Phylogenetic analysis was performed. It mainly belongs to Pseudomonas, Enterobacteriaceaeae, Achromobacter, Acinetobacter, Acinetobacter and Lactococcus, the proportions of which are 73.260.864.033.26% and 1.877.The optimized sequence in two samples of wheat rhizosphere soil in Yang Ling area is 34 044. The similarity based on 97% was divided into 37 OTU Shannon diversity indices of 2.21 and 2.38 Simpson diversity indices of 0.1817 and 0.1404, respectively. It is mainly belong to Enterobacteriaceaeae, chromobacter, Pseudomonas, Bacillus, Stenotrophomonas oligotrophoniae, and the proportions are 37.66% and 5.80%, respectively. [conclusion] Yang Ling has some overlapping species of ACC deaminase promoting rhizosphere bacteria in Changwu area. But the abundance is quite different, showing a certain degree of geographical isolation in the spatial distribution, the results of the investigation can be used to guide the development of ACC deaminase producing rhizosphere promoting bacteria resources and application effect.
【作者單位】： 西北農(nóng)林科技大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【基金】：國家“863”計劃項目(2011AA100504)
【分類號】：S154.381

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本文編號：1635727