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小麥幼苗內(nèi)生菌多樣性的宏基因組分析

發(fā)布時(shí)間:2018-02-22 18:19

  本文關(guān)鍵詞: 小麥幼苗 內(nèi)生菌 宏基因組 多樣性 系統(tǒng)發(fā)育分析 出處:《植物病理學(xué)報(bào)》2017年03期  論文類(lèi)型:期刊論文


【摘要】:小麥?zhǔn)鞘澜绺鞯貜V泛種植的重要禾本科作物,在生長(zhǎng)過(guò)程中與內(nèi)生菌形成和諧共生的微生態(tài)體系,內(nèi)生菌次生代謝產(chǎn)物具有抗病、防蟲(chóng)與促生等重要作用。宏基因組技術(shù)是研究環(huán)境微生物及內(nèi)生菌多樣性的重要手段。本研究首先富集純化幼苗期小麥內(nèi)生菌的宏基因組DNA,PCR擴(kuò)增內(nèi)生細(xì)菌的16S rDNA及內(nèi)生真菌rDNA-ITS序列,構(gòu)建了大腸桿菌克隆文庫(kù),選取陽(yáng)性克隆測(cè)序。根據(jù)16S rDNA信息及系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)對(duì)內(nèi)生細(xì)菌群初步分析,劃分為9個(gè)分類(lèi)操作單元(operational taxonomic unites,OTUs),主要包括γ-變形菌綱腸桿菌科(95.59%)、梭菌綱(1.47%)及不可培養(yǎng)細(xì)菌(2.94%),其中腸桿菌科菌群為優(yōu)勢(shì)菌。內(nèi)生真菌rDNA-ITS克隆序列根據(jù)序列相似性和系統(tǒng)發(fā)育分析劃歸為13個(gè)OTUs,主要為不可培養(yǎng)真菌(37.50%)與子囊菌(62.50%),后者分屬于半子囊菌綱(30.00%)、座囊菌綱(5.00%)與糞殼菌綱(27.50%)3個(gè)菌綱,其中不可培養(yǎng)真菌為優(yōu)勢(shì)菌。上述研究結(jié)果表明小麥幼苗內(nèi)生菌遺傳多樣性分布較廣,本研究為進(jìn)一步挖掘利用小麥內(nèi)生菌資源提供了基礎(chǔ)信息。
[Abstract]:Wheat is an important gramineous crop widely planted all over the world. In the process of growth, wheat and endophytic bacteria form a harmonious and symbiotic microecological system. The secondary metabolites of endophytic bacteria are resistant to disease. Macrogenome technology is an important method to study the diversity of environmental microbes and endophytic bacteria. In this study, the macrogenomic DNA of wheat endophytic bacteria in seedling stage was first enriched and purified to amplify 16s rDNA of endophytic bacteria. RDNA-ITS sequence of endophytic fungi, Escherichia coli clone library was constructed, positive clones were selected and sequenced. According to 16s rDNA information and phylogenetic tree, the endophytic bacterial population was preliminarily analyzed. It is divided into 9 taxonomic taxonomic units, including 緯 -Proteus Enterobacteriaceae 95.59m, Clostridium 1.4775) and non-culturable bacteria 2.9410, in which Enterobacteriaceae is the dominant bacteria. The rDNA-ITS clone sequence of endophytic fungi is based on sequence similarity and similarity. Phylogenetic analysis was classified into 13 OTUs, mainly non-culturable fungi (37.50) and ascomycetes 62.50. The latter belong to the class of semiascomycetes 30.00m, cystacea 5.00) and fecal shell fungi 27.50). The results showed that the genetic diversity of endophytes in wheat seedlings was wide. This study provided basic information for the further exploitation of wheat endophyte resources.
【作者單位】: 江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所;
【基金】:國(guó)家公益性行業(yè)(農(nóng)業(yè))項(xiàng)目(201503112)
【分類(lèi)號(hào)】:S182;S512.1

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