發(fā)布時(shí)間：2017-11-03 02:23

  本文關(guān)鍵詞：核盤菌磷酸泛酰巰基乙胺基轉(zhuǎn)移酶編碼基因的預(yù)測(cè)與生物信息學(xué)分析

  更多相關(guān)文章： 核盤菌 磷酸泛酰巰基乙胺基轉(zhuǎn)移酶 生物信息學(xué)

【摘要】：為了解磷酸泛酰巰基乙胺基轉(zhuǎn)移酶(PPTases)在核盤菌生理代謝與致病過(guò)程中的作用,在核盤菌全基因組中尋找PPTases同源物。利用同源比對(duì)的方法,預(yù)測(cè)出核盤菌中PPTases基因,進(jìn)而分析其編碼蛋白的基本理化性質(zhì)、疏水性、跨膜區(qū)、信號(hào)肽、亞細(xì)胞定位、二級(jí)、三級(jí)結(jié)構(gòu)和保守結(jié)構(gòu)域,并對(duì)PPTases編碼氨基酸進(jìn)行遺傳進(jìn)化分析。結(jié)果表明,在核盤菌全基因組中預(yù)測(cè)存在3個(gè)PPTases基因同源物,分別命名為:Ss-Ppt1、Ss-Ppt2和Ss-Ppt3。3個(gè)蛋白均為親水性的非分泌型蛋白,在其二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu)中α螺旋結(jié)構(gòu)和無(wú)規(guī)則卷曲占主要部分,且三者都含有PPTases的保守結(jié)構(gòu)域SCOP和(或)ACPS。
【作者單位】： 安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院;宿州學(xué)院生物與食品工程學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 核盤菌 磷酸泛酰巰基乙胺基轉(zhuǎn)移酶 生物信息學(xué)
【基金】：國(guó)家公益性行業(yè)(農(nóng)業(yè))科研專項(xiàng)(201103016) 安徽省現(xiàn)代產(chǎn)業(yè)(油菜)體系專項(xiàng) 2014年宿州區(qū)域發(fā)展協(xié)同創(chuàng)新中心全國(guó)開(kāi)放課題(2014SZXTKF04ZD)共同資助
【分類號(hào)】：S432.4;Q811.4
【正文快照】： 核盤菌[Sclerotinia sclerotiorum(Lib.)de Bary],是屬于子囊菌門、柔膜菌目、核盤菌科、核盤菌屬的植物病原真菌,可以侵染400種以上的植物,使多種重要的農(nóng)作物產(chǎn)生重大經(jīng)濟(jì)損失[1]。充分認(rèn)識(shí)核盤菌的生理代謝及其致病機(jī)制是防控核盤菌的基礎(chǔ)。磷酸泛酰巰基乙胺基轉(zhuǎn)移酶(phosp

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前5條

1 李秀麗;樊淼;吳亞;張茜茹;高智謀;;核盤菌磷酸泛酰巰基乙胺基轉(zhuǎn)移酶編碼基因的預(yù)測(cè)與生物信息學(xué)分析[J];安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);2016年03期

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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前2條

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中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前5條

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中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

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3 游琴;四川三個(gè)地區(qū)油菜核盤菌遺傳分化情況研究[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

4 楊雷;利用綠色熒光蛋白基因標(biāo)記核盤菌菌絲[D];哈爾濱工業(yè)大學(xué);2006年

5 黃娟;核盤菌致病機(jī)制的關(guān)鍵因子分析[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2006年

6 李沛利;四川省核盤菌種群結(jié)構(gòu)研究[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2006年

7 黃夢(mèng)穎;擬南芥與核盤菌互作中調(diào)控細(xì)胞氧化還原狀態(tài)的基因的鑒定與功能分析[D];福建農(nóng)林大學(xué);2014年

8 張重梅;大量產(chǎn)小孢子核盤菌菌株生物學(xué)特性及其小孢子萌發(fā)特性研究[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2011年

9 郭艷梅;核盤菌EST序列分析及農(nóng)桿菌介導(dǎo)的遺傳轉(zhuǎn)化體系的優(yōu)化[D];吉林大學(xué);2008年

10 王雪亮;核盤菌轉(zhuǎn)錄因子SsMADS1的表達(dá)及其互作蛋白篩選的研究[D];吉林大學(xué);2015年

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本文編號(hào)：1134242