本文關(guān)鍵詞：基于RNA-Seq技術(shù)的苜蓿根蘗性狀發(fā)生相關(guān)下調(diào)基因

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【摘要】：為了從分子水平上分析苜蓿(Medicago sativa)根蘗性狀的發(fā)生機(jī)制,對(duì)根蘗型苜蓿的根蘗與非根蘗根部進(jìn)行RNA-seq轉(zhuǎn)錄組文庫(kù)構(gòu)建,并分析差異表達(dá)基因及其功能。分別提取品系"BL-101"的根蘗型苜蓿根蘗與非根蘗部位總RNA,利用磁珠法分離m RNA后通過(guò)PCR擴(kuò)增構(gòu)建RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組文庫(kù),并對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行分析,得到差異表達(dá)基因15 978條,本研究重點(diǎn)分析下調(diào)基因,通過(guò)生物過(guò)程分類,發(fā)現(xiàn)與根蘗性狀發(fā)生有關(guān)的表達(dá)下調(diào)的基因?yàn)?個(gè),經(jīng)生物學(xué)信息分析確定,其中2個(gè)屬于Lon蛋白酶家族,其余分別屬于植物肌動(dòng)蛋白酶家族,硫氧還蛋白和脂氧合酶,其與植物抗逆性相關(guān),且與植物激素ABA的調(diào)控有關(guān)。研究結(jié)果可以為探討苜蓿根蘗性狀發(fā)生的分子機(jī)制提供理論依據(jù)。
【作者單位】： 北京林業(yè)大學(xué)林學(xué)院;北京林業(yè)大學(xué)草地資源與生態(tài)研究中心;
【關(guān)鍵詞】： 苜蓿 根系生長(zhǎng) 生物信息學(xué) 脫落酸
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金——基于RNA-seq技術(shù)的苜蓿根蘗性狀發(fā)生分子機(jī)制研究(31201843) 北京林業(yè)大學(xué)校級(jí)大學(xué)生創(chuàng)新項(xiàng)目——基于RNA-seq技術(shù)的苜蓿根蘗性狀發(fā)生分子機(jī)制的研究(X201410022009)
【分類號(hào)】：S541.9
【正文快照】： k遘俎，

本文編號(hào)：602408