人Latexin基因及蛋白質(zhì)的生物信息學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2017-07-28 16:32
本文關(guān)鍵詞:人Latexin基因及蛋白質(zhì)的生物信息學(xué)分析
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【摘要】:Latexin(Lxn)是人的羧肽酶抑制劑,并有腫瘤抑制因子的作用。利用生物信息學(xué)分析Lxn基因的啟動子和Cp G島以及Lxn蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)、結(jié)構(gòu)特點(diǎn)、功能特征后發(fā)現(xiàn),Lxn基因存在兩個(gè)啟動子和Cp G島,且一個(gè)Cp G島與啟動子重合;Lxn是全長222個(gè)氨基酸,等電點(diǎn)5.52,無信號肽、無跨膜結(jié)構(gòu)的親水不穩(wěn)定蛋白質(zhì);蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)有4個(gè)α螺旋和9個(gè)β折疊,三級預(yù)測結(jié)構(gòu)可信度為99.55%,拉曼圖表明結(jié)構(gòu)穩(wěn)定;與Lxn相互作用的蛋白質(zhì)主要是羧肽酶,另外Lxn還參與炎癥反應(yīng)和溫度引起的痛覺反應(yīng)等生物過程;啟動子和氨基酸在靈長類間的同源性極高。對Lxn的表達(dá)、結(jié)構(gòu)及功能的預(yù)測分析可以為研究Lxn在生命過程中的作用提供重要的信息。
【作者單位】: 天津醫(yī)科大學(xué)腫瘤醫(yī)院國家腫瘤臨床醫(yī)學(xué)研究中心天津市腫瘤防治重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】: Latexin 羧肽酶抑制劑 腫瘤抑制因子 生物信息學(xué)
【基金】:國家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(81301711)
【分類號】:Q811.4;R3416
【正文快照】: Latexin(Lxn)是目前已知的哺乳類動物中唯一的羧肽酶抑制劑[1],具有222個(gè)氨基酸殘基,相對分子質(zhì)量為29 k D。Lxn在人的心臟、前列腺、卵巢、腎臟、胰腺、結(jié)腸等多個(gè)器官中均有表達(dá)[2],并且調(diào)控了干細(xì)胞中蛋白質(zhì)表達(dá)的豐度[3]。Liang等[4]發(fā)現(xiàn)小鼠Lxn的表達(dá)影響其體內(nèi)造血干細(xì)
【相似文獻(xiàn)】
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1 彭詠波;馬永平;夏永鵬;邱宗蔭;;肽質(zhì)量指紋譜鑒定蛋白質(zhì)時(shí)生物信息學(xué)分析條件的優(yōu)化[J];分析化學(xué);2008年04期
2 陳塵;王政軍;曹鑫林;王U喼,
本文編號:585004
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