本文關(guān)鍵詞：高粱SBP-box基因家族全基因組鑒定及表達(dá)分析

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【摘要】：SQUAMOSA PROMOTER BINDING PROTEIN box(SBP-box)基因家族編碼一類綠色植物特有的轉(zhuǎn)錄因子,其功能涉及作物遺傳改良的許多方面,如產(chǎn)量、株型、抗逆性等,具有重要的實(shí)際應(yīng)用價(jià)值。本研究通過(guò)生物信息學(xué)方法從高粱(Sorghum bicolor L.)全基因組中鑒定出18個(gè)SBP-box基因,分布于9條染色體上,其中8個(gè)基因位于基因組重復(fù)區(qū)域。系統(tǒng)發(fā)育分析表明高粱SBP-box基因家族可分為6個(gè)亞家族,其中Sb SBP12、Sb SBP3和Sb SBP15分別與玉米Zm LG1、Zm TGA1和Zm UB2/3直系同源�；赗NA-seq數(shù)據(jù)的表達(dá)分析發(fā)現(xiàn)高粱SBP-box基因在花序原基中表達(dá)量最高,Sb SBP9和Sb SBP17為花序原基特異表達(dá)基因,Sb SBP5、Sb SBP8和Sb SBP18等基因受外源ABA和PEG脅迫上調(diào)表達(dá),表明SBP-box基因可能參與高粱對(duì)非生物逆境的響應(yīng)。本研究為高粱SBP-box家族重要基因的克隆提供了參考,相關(guān)基因可作為高粱遺傳改良的候選基因。
【作者單位】： 山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院旱地農(nóng)業(yè)研究中心農(nóng)業(yè)部黃土高原作物基因資源和種質(zhì)創(chuàng)制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院高粱研究所高粱遺傳與種質(zhì)創(chuàng)新山西省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所;
【關(guān)鍵詞】： 高粱 SBP-box基因家族 系統(tǒng)進(jìn)化分析 表達(dá)分析
【基金】：現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)(編號(hào):CARS-06-01-01) 山西省財(cái)政支農(nóng)項(xiàng)目(編號(hào):2014ZYFZ-09) 山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院重點(diǎn)項(xiàng)目(編號(hào):YZD1401);山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院博士研究基金項(xiàng)目(編號(hào):YBSJJ1407)資助~~
【分類號(hào)】：Q943.2;S514
【正文快照】： 轉(zhuǎn)錄因子(Transcription factor,TF)是一類能特異地與DNA分子結(jié)合并通過(guò)激活或抑制下游靶基因的轉(zhuǎn)錄來(lái)調(diào)節(jié)基因表達(dá)的蛋白分子[1,2]。高等植物轉(zhuǎn)錄因子在生長(zhǎng)發(fā)育、形態(tài)建成、次生代謝和抗逆反應(yīng)等多種過(guò)程發(fā)揮著重要作用。SQUAMOSA PROMOTER BINDING PROTEIN box(SBP-box)基

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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5 常纓;張微;李宏玲;王鶴萌;董士嘉;;轉(zhuǎn)錄因子AtOFP4影響擬南芥表皮細(xì)胞的伸長(zhǎng)[J];東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);2015年03期

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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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6 呂德康;葛瑛;柏錫;李勇;朱延明;;生物信息學(xué)在植物miRNA研究中的應(yīng)用[J];生物信息學(xué);2009年02期

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【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 韓瑤瑤;普通煙草SBP-box基因的鑒定、系統(tǒng)進(jìn)化分析和功能研究[D];西北大學(xué);2015年

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本文編號(hào)：581994