本文關(guān)鍵詞：利用基因芯片技術(shù)分析空腸彎曲菌的遺傳特征

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【摘要】：目的為分析我國彎曲菌遺傳特征,本研究根據(jù)已發(fā)表多株彎曲菌的全基因組測序特征及比對結(jié)果自行設(shè)計基因芯片,利用芯片對我國不同宿主來源菌株進行遺傳特異性分析。方法根據(jù)前期基因組水平比對分析的結(jié)果,利用Combimatrix tiling Custom ArrayTM90K芯片,設(shè)計DNA芯片。芯片包含已測序菌株ICDCCJ07001、269.97、NCTC11168、81-176、81-116和RM1221共3384個CDS的探針序列,以及空腸彎曲菌耐藥及致病性相關(guān)2個質(zhì)粒共80個CDS的探針序列,與脂寡糖的合成相關(guān)基因簇16種共219個CDS的探針序列、莢膜多糖合成相關(guān)基因簇7種共160個CDS的所有序列。對我國不同宿主來源27株分離菌株提取DNA,利用芯片進行雜交,獲得雜交信息并分析不同菌株CDS分布特征分析及聚類特點。結(jié)果中國菌株的主要變異區(qū)域主要存在于與脂寡糖、莢膜多糖合成相關(guān)的基因簇、鞭毛修飾相關(guān)的基因簇、DNA限制/修飾相關(guān)的基因簇以及空腸彎曲菌Mu樣噬菌體基因簇�；蚪M水平不同來源菌株CDS分布的聚類結(jié)果沒有發(fā)現(xiàn)顯著的宿主歸因特點,但GBS相關(guān)菌株脂寡糖合成相關(guān)基因組成具有共性特征。結(jié)論通過驗證以及與過去研究的比較,本次研究中的基因芯片技術(shù)結(jié)果準(zhǔn)確可信,本研究所用基因芯片在分析空腸彎曲菌基因多態(tài)性方面具有很好的優(yōu)勢,可用于彎曲菌遺傳特征和重要毒力因子的分析和檢測。
【作者單位】： 中國疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所傳染病預(yù)防控制國家重點實驗室;
【關(guān)鍵詞】： 空腸彎曲菌 基因芯片 遺傳變異
【基金】：國家自然科學(xué)基金(No.81271789) 國家重點基礎(chǔ)研究發(fā)展計劃(973計劃)(No.2013CB127204)~~
【分類號】：R378
【正文快照】： 梁昊,劉紅瑩,尤元海,顧一心,張艾煜,王敏,何利華,孟凡亮,張建中,張茂俊自2000年2月第一株空腸彎曲菌(Campylobacter jejuni)NCTC11168的全基因組序列完成圖發(fā)布以來,陸續(xù)有多株空腸彎曲菌完成了全基因組測序。對不同菌株的序列比較分析顯示空腸彎曲菌遺傳變異度較大[1-8]。這

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1 張建中;;空腸彎曲菌病[J];傳染病信息;2005年02期

2 高正琴;張強;邢進;王春玲;賀爭鳴;邢瑞昌;;空腸彎曲菌套式PCR快速檢測方法的建立與初步應(yīng)用[J];中國比較醫(yī)學(xué)雜志;2006年12期

3 袁寶君;吳高林;喬昕;戴建華;;多重PCR與傳統(tǒng)方法檢測空腸彎曲菌的比較研究[J];衛(wèi)生研究;2007年01期

4 欒軍;祝長青;蔣原;金偉青;;空腸彎曲菌保存方法的比較[J];口岸衛(wèi)生控制;2007年04期

5 張茂俊;張建中;;空腸彎曲菌耐藥現(xiàn)狀[J];疾病監(jiān)測;2007年12期

6 拜世英;;淺述空腸彎曲菌誘發(fā)格林-巴利綜合征的機制和防控[J];醫(yī)學(xué)與哲學(xué)(臨床決策論壇版);2010年03期

7 邢叢叢;李震中;白欣立;徐飛;付金生;馬海陽;李文倩;盧小衛(wèi);;空腸彎曲菌Penner O:19 galE基因真核表達質(zhì)粒的構(gòu)建[J];腦與神經(jīng)疾病雜志;2012年02期

8 陸磊;焦新安;黃金林;;空腸彎曲菌細胞致死性腫脹毒素研究進展[J];中國人獸共患病學(xué)報;2012年10期

9 邢麗萍;薛永春;楊月清;;空腸彎曲菌分型技術(shù)的研究進展[J];公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué);2012年06期

10 劉孝波;蔣棟能;蒲曉允;;利用環(huán)介導(dǎo)恒溫擴增法快速檢測空腸彎曲菌[J];醫(yī)學(xué)研究雜志;2013年08期

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 張弓;黃金林;焦新安;;空腸彎曲菌“活的非可培養(yǎng)狀態(tài)”研究進展[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會2009學(xué)術(shù)年會論文集（下冊）[C];2009年

2 韓茜倩;師以康;王鳳山;;在空腸彎曲菌表達N型糖蛋白的研究進展[A];山東省藥學(xué)會2010年生化與生物技術(shù)藥物學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2010年

3 高正琴;張強;邢進;王春玲;賀爭鳴;邢瑞昌;;空腸彎曲菌套式PCR快速檢測方法的建立及初步應(yīng)用[A];中國實驗動物學(xué)會第七屆學(xué)術(shù)年會論文集[C];2006年

4 劉光明;蔡慧農(nóng);曹敏杰;蘇文金;;一種檢測活的非可培養(yǎng)狀態(tài)空腸彎曲菌的新型方法[A];提高全民科學(xué)素質(zhì)、建設(shè)創(chuàng)新型國家——2006中國科協(xié)年會論文集[C];2006年

5 薛峰;徐飛;陳穎;李震中;張睿;張常印;蔣原;李懷林;陸承平;;2006-2008年華東地區(qū)空腸彎曲菌動物源分離株分子分型研究[A];動物檢疫學(xué)分會2010年學(xué)術(shù)年會論文集[C];2010年

6 黃金林;許海燕;包廣宇;張弓;劉佩紅;姜峰;潘志明;劉秀梵;焦新安;;不同來源空腸彎曲菌分子流行病學(xué)分析[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會2009學(xué)術(shù)年會論文集（上冊）[C];2009年

7 劉光明;蔡慧農(nóng);曹敏杰;蘇文金;;一種檢測活的非可培養(yǎng)狀態(tài)空腸彎曲菌的新方法[A];中國食品科學(xué)技術(shù)學(xué)會第五屆年會暨第四屆東西方食品業(yè)高層論壇論文摘要集[C];2007年

8 王君;劉秀梅;郭云昌;;雞肉空腸彎曲菌標(biāo)準(zhǔn)制定過程中風(fēng)險評估的應(yīng)用[A];達能營養(yǎng)中心青年科學(xué)工作者論壇優(yōu)秀論文集2010年第5期[C];2010年

9 祝令偉;郭學(xué)軍;馮書章;;空腸彎曲菌蛋白質(zhì)組學(xué)研究概述[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會生物制品學(xué)分會中國微生物學(xué)會獸醫(yī)微生物學(xué)專業(yè)委員會2010年學(xué)術(shù)年會（第三屆中國獸藥大會學(xué)術(shù)論壇）論文集[C];2010年

10 孫新婷;沈?qū)氥?侯鳳琴;于巖巖;;北京地區(qū)空腸彎曲菌的臨床分析[A];中華醫(yī)學(xué)會全國第九次感染病學(xué)學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2006年

中國重要報紙全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 曾繁玉;格林-巴利綜合征分子研究有重大突破[N];中國醫(yī)藥報;2002年

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1 張茂俊;格林—巴利綜合征相關(guān)空腸彎曲菌遺傳特征分析[D];中國疾病預(yù)防控制中心;2008年

2 田新英;吉蘭-巴雷綜合征相關(guān)空腸彎曲菌的蛋白質(zhì)譜特征分析[D];河北醫(yī)科大學(xué);2004年

3 馮永嘉;空腸彎曲菌粘附蛋白基因工程疫苗的實驗研究[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2003年

4 黃金林;我國部分地區(qū)雞源空腸彎曲菌流行病學(xué)及運送flaA基因的殼聚糖納米DNA疫苗免疫生物學(xué)特性研究[D];揚州大學(xué);2008年

5 束曉梅;空腸彎曲菌galE基因變異株的臨床意義研究[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2004年

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 楊靜;空腸彎曲菌致豚鼠不同時間段周圍神經(jīng)病理損傷的研究[D];河北醫(yī)科大學(xué);2015年

2 張華威;空腸彎曲菌膜融合蛋白CmeA、外膜蛋白CmeC的表達、純化與結(jié)晶篩選[D];復(fù)旦大學(xué);2012年

3 吳高林;空腸彎曲菌快速檢測方法建立和應(yīng)用的研究[D];南京醫(yī)科大學(xué);2007年

4 楊靜;空腸彎曲菌體外非理想條件下性狀變化評估[D];河北醫(yī)科大學(xué);2013年

5 尹衍新;基于CjaA蛋白檢測雞空腸彎曲菌抗體的間接ELISA方法建立及其單克隆抗體研制[D];揚州大學(xué);2010年

6 高愛民;空腸彎曲菌鐵相關(guān)受體基因序列的分析研究[D];河北醫(yī)科大學(xué);2011年

7 林世永;實時定量PCR檢測人類腹瀉糞便中空腸彎曲菌的研究與評價[D];南方醫(yī)科大學(xué);2008年

8 李文倩;C.jejuni在不同條件下的形態(tài)學(xué)變化及C.jejuni的分離[D];河北醫(yī)科大學(xué);2012年

9 鄭揚云;食品中空腸彎曲菌的污染分布規(guī)律及遺傳多樣性研究[D];廣東工業(yè)大學(xué);2013年

10 朱利;空腸彎曲菌質(zhì)粒研究初探[D];甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué);2001年

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本文編號：560292