藍莓磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因cDNA克隆及表達分析
本文關(guān)鍵詞:藍莓磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因cDNA克隆及表達分析
【摘要】:磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(phosphoenolpyruvate carboxylase,PEPCase,EC4.1.1.31)在植物代謝過程中發(fā)揮重要作用。本研究從藍莓果實中克隆到磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶編碼基因VcPEPC。該基因開放閱讀框全長為2 907 bp,可編碼968個氨基酸,分子量為110.59 kD。由于該蛋白具有磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶結(jié)構(gòu)特征,認為VcPEPC屬于PEPcase家族(pfam00311)。二級結(jié)構(gòu)預測表明,VcPEPC蛋白序列含有雙螺旋(54.44%)、擴展鏈(11.67%)、β轉(zhuǎn)角(6.71%)以及無規(guī)則卷曲(27.17%)。進化樹分析發(fā)現(xiàn)VcPEPC與瓜、蓖麻和葡萄遺傳距離較近。反轉(zhuǎn)錄PCR分析表明,VcPEPC基因在藍莓根、莖、葉、花、果實中均有表達。在奧尼爾葉片中的表達量高于藍豐、布里吉塔和夏普蘭,在夏普蘭綠色大果中表達量較高,成熟后基因表達下調(diào)。
【作者單位】: 浙江師范大學浙江省特色經(jīng)濟植物生物技術(shù)研究重點實驗室;金華職業(yè)技術(shù)學院農(nóng)業(yè)與生物工程學院;
【關(guān)鍵詞】: 藍莓 PEPC 克隆 表達
【基金】:浙江省金華市科技局農(nóng)業(yè)類重點項目(2013-2-002) 浙江省公益性技術(shù)應用研究計劃項目(2015C32129) 浙江省新品種選育重大專項(2012C12904-6)共同資助
【分類號】:S663.9
【正文快照】: Cloning and Expression Analysing of Phosphoenolpyruvate Carboxylasec DNA in BlueberryShao Xu1Wang Yue1Ying Yanbiao1Zhu Youyin2Liu Xianglei2Ge Fan2Guo Weidong1*1 Zhejiang Provincial Key Laboratory of Biotechnology on Specialty Economic Plants,Zhejiang Nor
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