本文關(guān)鍵詞：青皮苦瓜鯊烯合酶基因ORF序列的克隆和正選擇分析

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【摘要】：為研究葫蘆科植物中三萜皂苷生物合成通路中的關(guān)鍵酶鯊烯合酶的分子進(jìn)化,克隆青皮苦瓜鯊烯合酶基因的c DNA序列,并進(jìn)行正選擇分析。根據(jù)葫蘆科植物之間的同源性設(shè)計(jì)青皮苦瓜鯊烯合酶引物。采用3'RACE和5'RACE快速擴(kuò)增技術(shù)分兩步進(jìn)行巢式PCR擴(kuò)增鯊烯合酶ORF序列。根據(jù)克隆出來的青皮苦瓜編碼框序列以及在Gen Bank數(shù)據(jù)庫中完整的陸生植物鯊烯合酶編碼框序列信息,用貝葉斯方法和PAML4軟件進(jìn)行鯊烯合酶的正選擇分析。青皮苦瓜鯊烯合酶基因c DNA的克隆,命名為Mc SS,其c DNA序列全長(zhǎng)為1 548 bp,ORF 1 251 bp,編碼417個(gè)氨基酸殘基。通過正選擇運(yùn)算,檢測(cè)到33個(gè)正選擇位點(diǎn),其正選擇位點(diǎn)主要集中在第二跨膜區(qū)及其兩側(cè)。本研究成功克隆得到青皮苦瓜鯊烯合酶基因全長(zhǎng)c DNA序列并對(duì)其正選擇分析,在三萜合成通路上為鯊烯合酶的定點(diǎn)突變提供重要參考。
【作者單位】： 廣西醫(yī)科大學(xué)生物化學(xué)與分子生物學(xué)教研室;廣西高校生物分子醫(yī)學(xué)研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 青皮苦瓜 基因克隆 鯊烯合酶 正選擇
【基金】：國家自然科學(xué)基金(No.31260069)資助
【分類號(hào)】：S642.5;Q943.2
【正文快照】： Cloning and Positive Selection Analysis of Squalene Synthase Gene ORF inGreen Momordica charantiaQian Jieying1Ma Chengtong1Chao Naixia1,2Chen Qicong1Lan Xiuwan1,2Sun Jian1,2Wu Yaosheng1,2*1 Department of Biochemistry and Molecular Biology,Guangxi Medical

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本文編號(hào)：542848