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辣椒雜交種與親本苗期葉片基因差異表達(dá)分析

發(fā)布時(shí)間:2017-07-14 17:17

  本文關(guān)鍵詞:辣椒雜交種與親本苗期葉片基因差異表達(dá)分析


  更多相關(guān)文章: 辣椒 雜種優(yōu)勢(shì) 轉(zhuǎn)錄組 RNA-seq


【摘要】:目前辣椒雜種優(yōu)勢(shì)的利用已取得很大成效,但是辣椒雜種優(yōu)勢(shì)的分子機(jī)理仍然不明。辣椒雜種優(yōu)勢(shì)的分子機(jī)理是一個(gè)重要的生物學(xué)和農(nóng)學(xué)課題。為比較分析苗期辣椒雜交種(D6×D7,D7×D6)及其親本(D6、D7)的成熟功能葉轉(zhuǎn)錄譜,把4個(gè)功能葉c DNA文庫(kù)在Illumina Hi Seq 2000平臺(tái)進(jìn)行RNASeq分析。通過(guò)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,共得到0.6億條原始的reads,經(jīng)過(guò)篩選獲得0.44億條高質(zhì)量reads(100 bp);虼嬖谂c缺失變異統(tǒng)計(jì)結(jié)果表明,單親表達(dá)一致型有1068個(gè)(6.20%)和780個(gè)(4.56%)基因分別在正交(D6×D7)和反交(D7×D6)中被檢測(cè)到,在4種基因存在與缺失變異類(lèi)型中所占比例比較高。對(duì)雙親表達(dá)量不同的基因作進(jìn)一步表達(dá)模式分析,結(jié)果表明,雜種(正、反交)與雙親相比,大部分基因呈均非加性表達(dá),加性表達(dá)基因比例不足8%,在非加性表達(dá)基因中,超顯性表達(dá)的基因占大多數(shù),正、反交分別為66.08%和62.96%,這與偏單親的顯性模型分析結(jié)論相一致。
【作者單位】: 廣東省農(nóng)科院蔬菜研究所;福建農(nóng)林大學(xué)作物科學(xué)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】辣椒 雜種優(yōu)勢(shì) 轉(zhuǎn)錄組 RNA-seq
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金(31301776) 廣東省科技計(jì)劃項(xiàng)目(2015B0202009,2016B070701010) 廣州市科技計(jì)劃項(xiàng)目(201510010119)
【分類(lèi)號(hào)】:S641.3
【正文快照】: 雜種優(yōu)勢(shì)是指遺傳結(jié)構(gòu)不同的兩個(gè)群體(或個(gè)體)雜交所產(chǎn)生的F1代在生產(chǎn)、生活、繁殖和適應(yīng)性等方面優(yōu)于雙親均值或超過(guò)兩個(gè)親本的現(xiàn)象[1]。雜交育種是根據(jù)品種的選育目標(biāo)選配親本,通過(guò)雜種優(yōu)勢(shì)群的劃分、自交系的培育、對(duì)自交系一般配合力和特殊配合力的檢測(cè)等手段,獲得新品種

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前4條

1 殷亞娟;曹廣力;黃茉莉;薛仁宇;貢成良;;基于RNA-Seq分析幼蟲(chóng)5齡期至化蛹初期家蠶卵巢發(fā)育中的細(xì)胞進(jìn)程相關(guān)基因[J];蠶業(yè)科學(xué);2013年06期

2 江南;譚曉風(fēng);張琳;;基于RNA-Seq的油茶種子油脂合成過(guò)程磷脂酰肌醇信號(hào)系統(tǒng)的基因分析[J];食品與生物技術(shù)學(xué)報(bào);2014年06期

3 蘭道亮;熊顯榮;位艷麗;徐通;鐘金城;字向東;王永;李鍵;;基于RNA-Seq高通量測(cè)序技術(shù)的牦牛卵巢轉(zhuǎn)錄組研究:進(jìn)一步完善牦;蚪Y(jié)構(gòu)及挖掘與繁殖相關(guān)新基因[J];中國(guó)科學(xué):生命科學(xué);2014年03期

4 ;[J];;年期

中國(guó)重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前3條

1 趙西西;王成成;陳國(guó)華;林劍青;賀竹梅;;RNA-Seq揭示黃曲霉胞內(nèi)氧化還原反應(yīng)與黃曲霉毒素合成的關(guān)系[A];中國(guó)遺傳學(xué)會(huì)第九次全國(guó)會(huì)員代表大會(huì)暨學(xué)術(shù)研討會(huì)論文摘要匯編(2009-2013)[C];2013年

2 張玉剛;祝軍;梁美霞;戴洪義;;利用RNA-Seq分析柱型和普通型蘋(píng)果轉(zhuǎn)錄水平差異[A];中國(guó)園藝學(xué)會(huì)2011年學(xué)術(shù)年會(huì)論文摘要集[C];2011年

3 于安民;楊錦芬;;基于RNA-seq的陽(yáng)春砂果實(shí)可溶性糖及萜類(lèi)代謝的基因表達(dá)譜分析[A];生態(tài)文明建設(shè)中的植物學(xué):現(xiàn)在與未來(lái)——中國(guó)植物學(xué)會(huì)第十五屆會(huì)員代表大會(huì)暨八十周年學(xué)術(shù)年會(huì)論文集——第4分會(huì)場(chǎng):資源植物學(xué)[C];2013年

中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前3條

1 李雪艷;基于RNA-Seq的蘭州百合鱗莖淀粉-蔗糖代謝關(guān)鍵酶SuSy和INV基因的挖掘[D];沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

2 冉隆科;基于RNA-Seq的卵巢癌鉑類(lèi)敏感和耐藥性IncRNAs的系統(tǒng)識(shí)別及其差異表達(dá)分析研究[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2015年

3 梁書(shū)利;基于RNA-Seq技術(shù)的畢赤酵母轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究及其表達(dá)元件的挖掘[D];華南理工大學(xué);2012年

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 田巍;使用多種模擬和真實(shí)數(shù)據(jù)對(duì)常用的RNA-seq比對(duì)軟件的測(cè)試與綜合比較[D];華南理工大學(xué);2015年

2 胡呈呈;基于RNA-seq的前列腺癌1ncRNA相關(guān)的分析研究[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2015年

3 楊波;基于RNA-Seq技術(shù)的長(zhǎng)江三角洲白山羊優(yōu)質(zhì)筆料毛性狀研究及皮膚毛囊結(jié)構(gòu)的觀察[D];揚(yáng)州大學(xué);2015年

4 王sコ,

本文編號(hào):541962


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