本文關(guān)鍵詞：文蛤HDAC1基因克隆、時空表達及生長相關(guān)SNP位點篩查

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【摘要】：為探索HDAC1基因在文蛤生長發(fā)育中的作用,研究通過已構(gòu)建的文蛤轉(zhuǎn)錄組文庫,利用SMART RACE技術(shù)擴增得到文蛤HDAC1(Mm-HDAC1)基因的c DNA全長序列,分析了其生物信息學、組織及發(fā)育階段表達特征,并用直接測序法在外顯子中篩查生長相關(guān)的SNP位點。結(jié)果顯示,Mm-HDAC1基因的c DNA全長3065 bp,開放閱讀框1599 bp,編碼532個氨基酸;氨基酸序列比對發(fā)現(xiàn),文蛤與其他物種同源性為74.3%—78.7%。熒光定量PCR(q RT-PCR)結(jié)果表明,Mm-HDAC1基因在文蛤6個組織中均有表達,其中外套膜中的表達量相對最高,并與其他組織間有極顯著差異(P0.01);不同發(fā)育時期的表達差異結(jié)果表明,MmHDAC1基因在殼頂幼蟲期表達量最高,顯著高于其他發(fā)育時期(P0.05)。SNP位點篩查結(jié)果表明,在MmHDAC1基因的外顯子區(qū)域發(fā)現(xiàn)了19個SNP位點,其中有3個SNP位點(627AT、924TC和1266TC)與文蛤生長相關(guān)。
【作者單位】： 浙江萬里學院浙江省水產(chǎn)種質(zhì)資源高效利用技術(shù)研究重點實驗室;
【關(guān)鍵詞】： 文蛤 組蛋白去乙�；� cDNA 熒光定量 SNP
【基金】：國家自然科學基金項目(31372527) 國家現(xiàn)代貝類產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系項目(CARS-48) 浙江省重大科技專項(2012C12907-4) 國家水產(chǎn)種質(zhì)資源平臺項目(2015DKA30470)資助~~
【分類號】：S917.4
【正文快照】： 組蛋白去乙�；�1(Histone deacetylase 1,HDAC1)是HDACs家族中的重要一員,在卵母細胞成熟、胚胎發(fā)育、神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)生、骨骼分化、心臟發(fā)育、表皮分化、干細胞分化等過程中都發(fā)揮重要作用[1]。HDAC1是發(fā)現(xiàn)的第一個哺乳動物組蛋白脫乙�；�,推測其可能是基因轉(zhuǎn)錄的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因

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本文編號：531466