馬尾松水通道蛋白PmPIP1基因克隆及在干旱脅迫下的表達分析
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【摘要】:克隆馬尾松Pinus massoniana水通道蛋白(AQP),并對其生物信息學(xué)與干旱脅迫表達模式進行分析。采用逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈式反應(yīng)(RT-PCR)以及互補脫氧核糖核酸(c DNA)末端快速擴增(RACE)方法克隆馬尾松水通道蛋白基因。采用實時熒光定量聚合酶鏈式反應(yīng)(q RT-PCR)分析其在干旱脅迫下的響應(yīng)模式。結(jié)果克隆到一個馬尾松水通道蛋白基因,命名為Pm PIP1(Gen Bank登錄號為KF582038)。此基因c DNA全長序列為1 301 bp,包括867 bp的完整開放閱讀框,99 bp的5′末端非翻譯區(qū)和335 bp的3′末端非翻譯區(qū)。編碼288個氨基酸殘基,分子量為30.86 k D,等電點(p I)8.48。Pm PIP1與菠菜Spinacia oleracea(2b5f A)水通道蛋白結(jié)構(gòu)相似。Pm PIP1含有6個跨膜區(qū),具有膜內(nèi)在蛋白(MIP)家族信號序列、高等植物高度保守序列HINPAVTFG和2個天門冬酰胺-脯氨酸-丙氨酸(NPA)保守肽段。Pm PIP1基因?qū)儋|(zhì)膜內(nèi)在蛋白(PIPs)亞族,與挪威云杉Picea abies水通道蛋白基因親緣關(guān)系最近,同源性達95%。q RT-PCR表明Pm PIP1受干旱脅迫誘導(dǎo)表達。馬尾松Pm PIP1的克隆豐富了植物AQP基因的資料庫,同時推測Pm PIP1基因可能參與了馬尾松干旱脅迫過程。
【作者單位】: 貴州省森林資源與環(huán)境研究中心;貴州大學(xué)林學(xué)院;貴州大學(xué)貴州省農(nóng)業(yè)生物工程重點實驗室;
【關(guān)鍵詞】: 植物學(xué) 馬尾松 水通道蛋白 克隆 表達
【基金】:國家自然科學(xué)基金資助項目(31260183) “十二五”國家科技支撐計劃項目(2015BAD09B0102) 國家高技術(shù)研究發(fā)展計劃(“863”計劃)項目(2011AA10020301) 貴州省重大專項(黔科合重大專項字[2012]6001號) 貴州省人才基地建設(shè)項目(黔人領(lǐng)發(fā)[2009]9號)
【分類號】:S791.248
【正文快照】: 水通道蛋白(AQP)是指細胞膜上能選擇性地高效轉(zhuǎn)運水分子的膜轉(zhuǎn)運蛋白[1]。自1993年Maurel等[2]從擬南芥Arabidopsis thaliana中分離到第1個植物水孔蛋白γ-TIP以來,已在細菌、古生菌、真菌、動物和植物等幾乎所有生物中發(fā)現(xiàn)AQP[3-5]。在植物中,擬南芥[6]和水稻Oryza sativa[7-
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