水曲柳SnRK2B基因和啟動(dòng)子的克隆及分析
發(fā)布時(shí)間:2017-07-06 09:18
本文關(guān)鍵詞:水曲柳SnRK2B基因和啟動(dòng)子的克隆及分析
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【摘要】:為了研究水曲柳中同源SnRK2轉(zhuǎn)錄因子的功能,在水曲柳干旱響應(yīng)轉(zhuǎn)錄組中尋得SnRK2B的同源序列并克隆得到SnRK2B轉(zhuǎn)錄因子基因全長,將其命名為FmSnRK2B。使用SiteFinding-PCR法擴(kuò)增獲得SnRK2B啟動(dòng)子序列,并對FmSnRK2B基因編碼區(qū)及其啟動(dòng)子進(jìn)行生物信息學(xué)分析和啟動(dòng)子順式調(diào)控元件分析。結(jié)果表明,克隆得到的全長序列包含完整的開放閱讀框1074bp,編碼357個(gè)氨基酸。啟動(dòng)子順式作用元件分析結(jié)果表明,其啟動(dòng)子區(qū)包含脫落酸應(yīng)答元件ABRE及脅迫相關(guān)元件HSE、MBS等。干旱脅迫下,FmSnRK2B基因的表達(dá)隨脅迫時(shí)間的延長先增加后降低,表明其參與植株的抗逆過程。本研究對進(jìn)一步揭示水曲柳的抗逆機(jī)制具有重要意義。
【作者單位】: 東北林業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】: SnRKB 生物信息學(xué)分析 水曲柳
【基金】:國家林業(yè)科技支撐項(xiàng)目(2012BAD010503) 國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31270697)
【分類號(hào)】:S792.41
【正文快照】: 蔗糖非酵解型蛋白激酶(sucrose non-fermenting 1-related protein kinase,SnRK)是廣泛存在于植物中的一類Ser/Thr類蛋白激酶,參與蛋白質(zhì)的磷酸化及植物體內(nèi)多種信號(hào)途徑的轉(zhuǎn)導(dǎo),與酵母的SNF1(sucrosenon-fermenting 1)和哺乳動(dòng)物中的AMPK(AMP-activated protein kinases)同源,,
本文編號(hào):525606
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