陸地棉CAD基因家族的進(jìn)化和表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2017-06-30 14:12
本文關(guān)鍵詞:陸地棉CAD基因家族的進(jìn)化和表達(dá)分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:【目的】對(duì)陸地棉CAD基因家族成員進(jìn)行進(jìn)化和表達(dá)分析,了解其在棉纖維發(fā)育中的作用!痉椒ā繎(yīng)用生物信息學(xué)方法,從棉花基因組中篩選出21個(gè)CAD基因,并對(duì)CAD的基因結(jié)構(gòu)、染色體分布、基因倍增模式以及系統(tǒng)進(jìn)化進(jìn)行分析。利用深度表達(dá)數(shù)據(jù)分析CAD基因在棉纖維發(fā)育各時(shí)期的表達(dá)。對(duì)比觀察擬南芥cad5突變體和野生型根毛表型!窘Y(jié)果】同源性高的CAD基因復(fù)制對(duì)之間有相似的基因結(jié)構(gòu);片段重復(fù)和串聯(lián)重復(fù)是CAD基因擴(kuò)增的主要方式。進(jìn)化分析可知,CAD基因可分為七個(gè)亞組,且功能相近的基因聚類在相同亞組。利用深度測(cè)序表達(dá)數(shù)據(jù)分析可知,CAD基因在棉纖維各個(gè)發(fā)育時(shí)期均有表達(dá)。對(duì)比擬南芥cad5突變體和野生型根毛發(fā)現(xiàn),突變體相比于野生型有更長(zhǎng)的根毛!窘Y(jié)論】CAD基因參與了棉纖維的發(fā)育的過(guò)程,并對(duì)棉花纖維發(fā)育起到一定的調(diào)控作用。
【作者單位】: 新疆師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;新疆農(nóng)業(yè)科學(xué)院核技術(shù)生物技術(shù)研究所;
【關(guān)鍵詞】: 棉纖維 CAD基因家族 系統(tǒng)進(jìn)化分析 表達(dá)分析 cad突變體 根毛
【基金】:新疆維吾爾自治區(qū)高技術(shù)項(xiàng)目“棉花纖維品質(zhì)分子改良技術(shù)創(chuàng)新研究”(201111116) 國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目“棉花Gh CAD6基因在棉花纖維發(fā)育中的功能及調(diào)控機(jī)制”(31460386)~~
【分類號(hào)】:S562
【正文快照】: 0引言【研究意義】棉花是一種重要的經(jīng)濟(jì)作物,在全球100多個(gè)國(guó)家廣泛種植,由它生產(chǎn)的棉纖維是全球重要的紡織原料之一,具有極其重要的經(jīng)濟(jì)價(jià)值[1]。陸地棉(Gossypium hirsutum)是栽培面積及經(jīng)濟(jì)效益最大的栽培棉種,它貢獻(xiàn)了超過(guò)90%的棉花產(chǎn)量。此外棉花還是研究染色體加倍,細(xì)
【相似文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前3條
1 佘朝文;許棟;張青樺;蔣向輝;;杉木CAD基因生物信息學(xué)分析[J];懷化學(xué)院學(xué)報(bào);2009年11期
2 黃海燕;王玉富;薛召東;邱財(cái)生;郝冬梅;;亞麻CAD基因克隆及序列分析[J];湖北農(nóng)業(yè)科學(xué);2008年05期
3 ;[J];;年期
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,本文編號(hào):502206
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