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大豆GmC4H基因的克隆及同源基因的生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2017-06-28 05:04

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【摘要】:本研究分別在大豆品種中豆27和九農(nóng)20中克隆大豆肉桂酸-4-羥化酶基因(Glyma.20G114200),得到長度為1 797 bp的C4H基因c DNA序列。比對兩者c DNA序列發(fā)現(xiàn)4個(gè)堿基差異位點(diǎn)。通過對二者氨基酸序列進(jìn)行理化性質(zhì)及結(jié)構(gòu)與功能分析發(fā)現(xiàn),C4H基因編碼蛋白的5~24位氨基酸之間和32~55位氨基酸之間存在跨膜區(qū)域;C4H蛋白含有細(xì)胞色素P450結(jié)構(gòu)域。大豆C4H基因的四個(gè)拷貝分別分布于第2、第10、第14和第20號染色體上,Glyma.20G114200與Glyma.10G275600的蛋白質(zhì)同源性高,而另外兩個(gè)同源基因Glyma.02G236500和Glyma.14G205200的蛋白質(zhì)同源性高。結(jié)果表明,可能大豆4個(gè)C4H同源基因在進(jìn)化過程中發(fā)生了功能的較大分化。
【作者單位】: 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院大豆生物學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/東北農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)業(yè)部東北大豆生物學(xué)與遺傳育種重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】大豆 異黃酮 CH 生物信息學(xué)分析
【基金】:國家自然科學(xué)基金(31201227,31301339) 教育廳新世紀(jì)優(yōu)秀人才項(xiàng)目(1253-NCET-005) 東農(nóng)學(xué)者“青年才俊”計(jì)劃(14QC27) 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)“學(xué)術(shù)骨干”項(xiàng)目(15XG04) 黑龍江省教育廳科研項(xiàng)目(12541049)共同資助
【分類號】:Q943.2;S565.1
【正文快照】: Cloning of Gm C4H Gene and Bioinformatics Analysis of Homologous Genesin SoybeanZhang Dongxue Wang Yan Jing Yan Wu Depeng Li Dongmei Han Yingpeng Zhao Xue Li WenbinWu Xiaoxia*Key Laboratory of Soybean Biology in Chinese Ministry of Education/Key Laborato

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  本文關(guān)鍵詞:大豆GmC4H基因的克隆及同源基因的生物信息學(xué)分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。



本文編號:492572

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