大口黑鱸PACAP基因SNPs的篩選及其與生長性狀的關(guān)聯(lián)分析
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【摘要】:垂體腺苷酸環(huán)化激酶多肽(pituitary adenylate cyclase-activating polypeptide,PACAP)是一種能夠促進生長激素、促性腺激素和催乳素分泌的多效激素,屬于胰高血糖素/分泌肽家族的成員。為探索PACAP基因多態(tài)性對大口黑鱸(Micropterus salmoides)生長性狀的影響,本研究采用直接測序的方法在PACAP基因上檢測到一個單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)位點:A-2282C,基因型檢測共發(fā)現(xiàn)3種基因型:AA、AC和CC,其基因型頻率分別為0.034、0.645和0.321,A等位基因頻率為0.356 3,C等位基因頻率為0.643 7。隨機選取同批繁殖、同塘養(yǎng)殖的327尾大口黑鱸用Snapshot方法進行SNPs位點檢測和分型,構(gòu)建最小二乘分析模型,分析基因型與生長性狀的相關(guān)性。χ2檢測結(jié)果顯示,哈溫-平衡常數(shù)為0.061 5,即該位點在所檢測大口黑鱸群體中基本處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài),有效等位基因數(shù)(Ne)為1.846 5,期望雜合度(Ho)和觀測雜合度(He)分別為0.540 9和0.644 2。方差分析結(jié)果顯示,AC基因型群體的平均體質(zhì)量、體高和全長相對于AA基因型群體分別增長了30.6%、10.7%和8.3%,相對于CC基因型群體分別增長了10.5%、4.7%和2.7%;且AC基因型群體在體質(zhì)量、體高和全長上顯著高于AA和CC基因型群體(P0.05)。另外,雖然AA基因型群體的平均體質(zhì)量、體高和全長相對于CC基因型群體分別增長了18.1%、5.8%和5.4%,但AA型群體和CC群體在各生長性狀上沒有顯著差異(P0.05)。該位點可能是影響大口黑鱸生長性狀的的主效數(shù)量性狀核苷酸(quantitative trait nucleotides,QTN)或與之緊密連鎖,可作為大口黑鱸選育的候選分子標記。
【作者單位】: 中國水產(chǎn)科學研究院珠江水產(chǎn)研究所/農(nóng)業(yè)部熱帶亞熱帶水產(chǎn)資源利用與養(yǎng)殖重點實驗室;上海海洋大學水產(chǎn)與生命學院;
【關(guān)鍵詞】: 大口黑鱸 垂體腺苷酸環(huán)化激酶多肽(PACAP) SNP 生長
【基金】:國家科技支撐計劃(No.2012BAD26B03) 國家自然科學基金(No.31201985) 農(nóng)業(yè)部引進國際先進農(nóng)業(yè)科學技術(shù)計劃(948計劃)項目(No.2011-G12)
【分類號】:S917.4
【正文快照】: 垂體腺苷酸環(huán)化激酶多肽(pituitary adenylatecyclase-activating polypeptide,PACAP)是魚類的一種多效激素,不僅具有刺激和提高生長激素、促性腺激素、催乳激素和生長乳素分泌的生物學功能(Montero et al.,1998;Matsuda et al.,2008),還參與動物采食量(Nakata et al.,2004)和
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7 丁建華;,
本文編號:490799
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