本文關(guān)鍵詞：來(lái)自肺炎患兒的A1基因亞型人偏肺病毒全基因組序列分析，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：人偏肺病毒(human metapneumovirus,HMPV)是嬰幼兒呼吸道感染的重要病原之一。本研究目的在于分析在HMPV監(jiān)測(cè)中發(fā)現(xiàn)的少見(jiàn)型別A1基因亞型BJ-1610的全基因組序列,為HMPV的進(jìn)一步研究提供數(shù)據(jù)支持。BJ-1610來(lái)源于一名患有肺炎的3月齡女?huà)氲谋茄氏匆簶?biāo)本。對(duì)該毒株進(jìn)行全基因組RNA分段擴(kuò)增、測(cè)序、序列拼接并分析其基因組特征、變異程度及是否存在重組等現(xiàn)象。BJ-1610株基因組全長(zhǎng)為13 406nt(KU821121)。BJ-1610與HMPV參考株進(jìn)行全基因和各蛋白核苷酸和氨基酸序列比較,顯示全基因組的核苷酸相似性范圍為81.2%~98.4%,其中相似性最高的為澳大利亞株(KC562226),而SH和G基因則與其他澳大利亞株相似性更高。系統(tǒng)進(jìn)化分析發(fā)現(xiàn)BJ-1610與HMPV A1基因亞型參考株位于同一分支,顯示了與相似性分析相同的特征。對(duì)BJ-1610的膜表面蛋白F、SH和G蛋白序列進(jìn)行分析結(jié)果顯示,F蛋白最為保守,SH基因編碼區(qū)的終止密碼發(fā)生了突變,導(dǎo)致終止密碼后移15位,長(zhǎng)度由552bp變?yōu)?67bp;G蛋白氨基酸序列突變較多,并導(dǎo)致N-糖基化位點(diǎn)的減少。HMPV作為兒童呼吸道疾病的重要病原之一,對(duì)其流行株基因組的分析將對(duì)其流行特征、遺傳進(jìn)化、致病機(jī)理、疫苗研制和抗病毒藥物研發(fā)等方面的研究產(chǎn)生積極的推動(dòng)作用。
【作者單位】： 首都兒科研究所病毒研究室兒童病毒病病原學(xué)北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 兒童肺炎 人偏肺病毒 A基因亞型 基因組 序列分析
【基金】：北京市衛(wèi)生系統(tǒng)高層次衛(wèi)生技術(shù)人才培養(yǎng)計(jì)劃(項(xiàng)目號(hào):2013-3-087) 北京市科技計(jì)劃(項(xiàng)目號(hào):Z111107056811041),題目:北京兒童急性傳染病監(jiān)測(cè)體系的建立 國(guó)家自然科學(xué)基金(項(xiàng)目號(hào):30872153),題目:新發(fā)現(xiàn)的病毒與兒科呼吸道感染的病原學(xué)研究
【分類(lèi)號(hào)】：R725.6
【正文快照】： 2001年荷蘭學(xué)者Van den Hoogen等報(bào)告在研究中發(fā)現(xiàn)了人偏肺病毒(Human Metapneumovirus,HMPV)[1],此后世界各地學(xué)者相繼報(bào)道了其感染情況[2,3]。HMPV是嬰幼兒呼吸道感染的重要病原之一,嚴(yán)重威脅著五歲以下嬰幼兒、老年人及免疫功能低下者的健康。全球流行病學(xué)研究顯示,大多數(shù)

【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：472301