發(fā)布時(shí)間：2024-04-14 09:07

　　目的探討B(tài)RAF基因突變型甲狀腺乳頭狀癌組織基因表達(dá)及腫瘤微環(huán)境的變化。方法從癌癥基因組圖譜數(shù)據(jù)庫獲得甲狀腺乳頭狀癌的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)和BRAF基因的突變數(shù)據(jù),用Perl語言合并數(shù)據(jù),并分為基因突變組、基因野生組;R軟件篩選兩組差異表達(dá)基因,用基因本體論(GO)和京都基因與基因組百科全書(KEGG)富集分析差異表達(dá)基因功能、信號(hào)通路;用惡性腫瘤中基質(zhì)細(xì)胞和免疫細(xì)胞評(píng)估軟件對(duì)兩組間質(zhì)細(xì)胞和炎癥細(xì)胞進(jìn)行評(píng)分,腫瘤免疫評(píng)估軟件對(duì)免疫細(xì)胞豐度進(jìn)行分析。結(jié)果基因突變組290例,基因野生組199例,差異表達(dá)基因1 524個(gè)。BRAF基因突變組中PD-L1、PD-L2、CD80、CD86、CTLA4等基因表達(dá)上調(diào)。GO和KEGG分析顯示,部分生物學(xué)過程、分子功能、信號(hào)通路與BRAF基因突變相關(guān)�；蛲蛔兘M癌組織中基質(zhì)細(xì)胞、免疫細(xì)胞水平高于基因野生組(P均<0.05)。與基因野生組比較,基因突變組腫瘤組織中B淋巴細(xì)胞、CD4+T淋巴細(xì)胞、中性粒細(xì)胞、巨噬細(xì)胞、樹突狀細(xì)胞豐度值高(P均<0.05),而兩組腫瘤組織中CD8+T淋巴細(xì)胞豐度值比較差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.737)。結(jié)論BRAF基因...

【文章頁數(shù)】：4 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 甲狀腺乳頭狀癌患者隊(duì)列的獲取
    1.2 轉(zhuǎn)錄組差異表達(dá)基因的篩選
    1.3 差異表達(dá)基因功能與信號(hào)通路的分析
    1.4 腫瘤微環(huán)境分析
    1.5腫瘤組織中免疫細(xì)胞水平分析
    1.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
2 結(jié)果
    2.1 與BRAF基因突變相關(guān)的差異表達(dá)基因
    2.2 差異表達(dá)基因的功能
    2.3 差異表達(dá)基因參與的信號(hào)通路
    2.4 兩組腫瘤微環(huán)境改變
    2.5 兩組腫瘤組織中免疫細(xì)胞水平比較
3 討論



本文編號(hào)：3954443