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赤霉素處理下甜櫻桃果實轉錄組分析及成熟軟化相關基因表達分析

發(fā)布時間:2024-03-23 12:12
  果實的成熟軟化是一個復雜的過程,細胞壁組分的降解和結構的改變影響著果實硬度和質地變化,是導致果實耐貯性降低的主要原因。本試驗以10生的‘紅燈’甜櫻桃為試材,以不同濃度GA3進行處理。利用高通量測序技術對GA3處理下的甜櫻桃果實進行轉錄組測序,通過生物信息學分析,選取測序結果中的細胞壁降解酶基因及調控基因MADS-box轉錄因子,通過實時熒光定量PCR分析這些基因在GA3處理下基因表達水平。研究結果如下:(1)本試驗共獲得88593條轉錄本,平均長度1088bp,預測到65727條unigenes,平均長度1368bp。將unigenes在Nr,Nt,Pfam,KOG/COG,Swiss-prot,KEGG,GO 7大數(shù)據(jù)庫中進行比對注釋,共有45115條unigenes得到注釋。對不同GA3處理濃度和不同時期的差異基因進行分析,篩選出PG、PME、α-L-Af、Cx、β-Gal、XTH、PEL 7個細胞壁降解相關酶基因,其中PG,β-Gal基因上調表達,PME、α-L-Af、Cx、XTH、PEL基因...

【文章頁數(shù)】:69 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖2甜櫻桃果實unigenes的GO功能分類Fig.2GOcategoriesofsweetcherryfruitunigenes

圖2甜櫻桃果實unigenes的GO功能分類Fig.2GOcategoriesofsweetcherryfruitunigenes

是一套國際標準的基因功能分類體系,本研究中用該體系對甜櫻桃果實轉錄組的unigenes進行功能分類,結果發(fā)現(xiàn)有31782條unigenes映射到不同的功能節(jié)點上。如圖2所示,這些unigenes分別歸到生物學過程、細胞組分和分子功能三大類中,更進一步劃分到5....


圖3甜櫻桃果實轉錄組在不同時期、不同濃度GA3處理下基因表達的熱圖分析

圖3甜櫻桃果實轉錄組在不同時期、不同濃度GA3處理下基因表達的熱圖分析

183.1.3GA3處理的甜櫻桃果實成熟軟化過程中轉錄組變化對不同濃度GA3處理的甜櫻桃果實在轉色期和成熟期的基因表達情況進行熱圖分析,如圖3所示,不同成熟期基因表達水平明顯被分為2類,兩個時期被明顯分開,表明不同濃度GA3處理甜櫻桃果實中的基因表達情況雖有差異,但在同一時期相似....


圖4GA3處理的甜櫻桃果實在不同時期差異基因GO分類Fig.4GOcategoriesofsweetcherryfruitgenesindifferentperiodsunderGA3treatments不同成熟時期差異基因分子功能中富集差異基因最多的前3條GO條目分別是氧化還原酶活性、作用于配對供體的氧化還原酶活性、水解酶活性,作用于糖基鍵(表

圖4GA3處理的甜櫻桃果實在不同時期差異基因GO分類Fig.4GOcategoriesofsweetcherryfruitgenesindifferentperiodsunderGA3treatments不同成熟時期差異基因分子功能中富集差異基因最多的前3條GO條目分別是氧化還原酶活性、作用于配對供體的氧化還原酶活性、水解酶活性,作用于糖基鍵(表

20圖4GA3處理的甜櫻桃果實在不同時期差異基因GO分類Fig.4GOcategoriesofsweetcherryfruitgenesindifferentperiodsunderGA3treatments不同成熟時期差異基因分子功能中富集差異基因最多的前3條GO條目分別是氧化....


圖5甜櫻桃果實發(fā)育過程中PG、PME基因表達水平Fig.5PGandPMEgeneexpressionduringthedevelopmentofsweetcherryfruit

圖5甜櫻桃果實發(fā)育過程中PG、PME基因表達水平Fig.5PGandPMEgeneexpressionduringthedevelopmentofsweetcherryfruit

243.2GA3處理對甜櫻桃成熟軟化相關基因表達和酶活性的影響3.2.1細胞壁降解酶相關基因表達與果實硬度的相關性分析對甜櫻桃果實發(fā)育過程中的細胞壁降解酶相關基因的表達水平與果實硬度變化的相關性進行分析(表8),PG基因和XTH基因表達水平與果實硬度的相關性系數(shù)分別為-0.920....



本文編號:3935901

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