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赤霉素處理下甜櫻桃果實轉(zhuǎn)錄組分析及成熟軟化相關(guān)基因表達分析

發(fā)布時間:2024-03-23 12:12
  果實的成熟軟化是一個復(fù)雜的過程,細胞壁組分的降解和結(jié)構(gòu)的改變影響著果實硬度和質(zhì)地變化,是導(dǎo)致果實耐貯性降低的主要原因。本試驗以10生的‘紅燈’甜櫻桃為試材,以不同濃度GA3進行處理。利用高通量測序技術(shù)對GA3處理下的甜櫻桃果實進行轉(zhuǎn)錄組測序,通過生物信息學(xué)分析,選取測序結(jié)果中的細胞壁降解酶基因及調(diào)控基因MADS-box轉(zhuǎn)錄因子,通過實時熒光定量PCR分析這些基因在GA3處理下基因表達水平。研究結(jié)果如下:(1)本試驗共獲得88593條轉(zhuǎn)錄本,平均長度1088bp,預(yù)測到65727條unigenes,平均長度1368bp。將unigenes在Nr,Nt,Pfam,KOG/COG,Swiss-prot,KEGG,GO 7大數(shù)據(jù)庫中進行比對注釋,共有45115條unigenes得到注釋。對不同GA3處理濃度和不同時期的差異基因進行分析,篩選出PG、PME、α-L-Af、Cx、β-Gal、XTH、PEL 7個細胞壁降解相關(guān)酶基因,其中PG,β-Gal基因上調(diào)表達,PME、α-L-Af、Cx、XTH、PEL基因...

【文章頁數(shù)】:69 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖2甜櫻桃果實unigenes的GO功能分類Fig.2GOcategoriesofsweetcherryfruitunigenes

圖2甜櫻桃果實unigenes的GO功能分類Fig.2GOcategoriesofsweetcherryfruitunigenes

是一套國際標準的基因功能分類體系,本研究中用該體系對甜櫻桃果實轉(zhuǎn)錄組的unigenes進行功能分類,結(jié)果發(fā)現(xiàn)有31782條unigenes映射到不同的功能節(jié)點上。如圖2所示,這些unigenes分別歸到生物學(xué)過程、細胞組分和分子功能三大類中,更進一步劃分到5....


圖3甜櫻桃果實轉(zhuǎn)錄組在不同時期、不同濃度GA3處理下基因表達的熱圖分析

圖3甜櫻桃果實轉(zhuǎn)錄組在不同時期、不同濃度GA3處理下基因表達的熱圖分析

183.1.3GA3處理的甜櫻桃果實成熟軟化過程中轉(zhuǎn)錄組變化對不同濃度GA3處理的甜櫻桃果實在轉(zhuǎn)色期和成熟期的基因表達情況進行熱圖分析,如圖3所示,不同成熟期基因表達水平明顯被分為2類,兩個時期被明顯分開,表明不同濃度GA3處理甜櫻桃果實中的基因表達情況雖有差異,但在同一時期相似....


圖4GA3處理的甜櫻桃果實在不同時期差異基因GO分類Fig.4GOcategoriesofsweetcherryfruitgenesindifferentperiodsunderGA3treatments不同成熟時期差異基因分子功能中富集差異基因最多的前3條GO條目分別是氧化還原酶活性、作用于配對供體的氧化還原酶活性、水解酶活性,作用于糖基鍵(表

圖4GA3處理的甜櫻桃果實在不同時期差異基因GO分類Fig.4GOcategoriesofsweetcherryfruitgenesindifferentperiodsunderGA3treatments不同成熟時期差異基因分子功能中富集差異基因最多的前3條GO條目分別是氧化還原酶活性、作用于配對供體的氧化還原酶活性、水解酶活性,作用于糖基鍵(表

20圖4GA3處理的甜櫻桃果實在不同時期差異基因GO分類Fig.4GOcategoriesofsweetcherryfruitgenesindifferentperiodsunderGA3treatments不同成熟時期差異基因分子功能中富集差異基因最多的前3條GO條目分別是氧化....


圖5甜櫻桃果實發(fā)育過程中PG、PME基因表達水平Fig.5PGandPMEgeneexpressionduringthedevelopmentofsweetcherryfruit

圖5甜櫻桃果實發(fā)育過程中PG、PME基因表達水平Fig.5PGandPMEgeneexpressionduringthedevelopmentofsweetcherryfruit

243.2GA3處理對甜櫻桃成熟軟化相關(guān)基因表達和酶活性的影響3.2.1細胞壁降解酶相關(guān)基因表達與果實硬度的相關(guān)性分析對甜櫻桃果實發(fā)育過程中的細胞壁降解酶相關(guān)基因的表達水平與果實硬度變化的相關(guān)性進行分析(表8),PG基因和XTH基因表達水平與果實硬度的相關(guān)性系數(shù)分別為-0.920....



本文編號:3935901

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