氮循環(huán)是微生物和化學過程介導(dǎo)的生物地球化學循環(huán)。利用基因測序技術(shù)研究環(huán)境中參與氮循環(huán)的微生物群落、微生物及功能基因,是環(huán)境基因組學和微生物生態(tài)學的重要研究熱點。近年來,各種類型的數(shù)據(jù)庫被開發(fā)并應(yīng)用到功能分析中。本文結(jié)合時下最新研究成果,聚焦由微生物引起的同化硝酸鹽還原作用、異化硝酸鹽還原作用、反硝化作用、固氮作用、硝化作用(包括完全氨氧化作用)和厭氧氨氧化作用等6種無機氮循環(huán)途徑的功能基因,對比了National Center for Biotechnology Information (NCBI)、Integrated Microbial Genomes (IMG)、Universal Protein (UniProt)、Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)、 Protein Families(Pfam)、 Functional Gene(FunGene)、Clusters of Orthologous Groups (COG)和NCycDB等數(shù)據(jù)庫的設(shè)計理念和功能特點,并結(jié)合環(huán)境介質(zhì)、表征基因、分析方法和比對方法等影響因素,分析...

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【部分圖文】：

圖1文獻統(tǒng)計圖

根據(jù)圖1B可知，narB、nirA和nasA基因多用于表征同化硝酸鹽還原作用，nrfA和nirB基因多用于表征異化硝酸鹽還原作用，nosZ、norB和多用途基因nirK、narG多用于表征反硝化作用，nifH基因多用于表征固氮作用，amoA和hao基因多用于表征硝化作用，hzsA....

本文編號：3928496