為明確SPL(Squamosa Promoter Binding Protein Like)在莧菜中的功能,基于‘全紅’莧菜轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù)篩選獲得17個(gè)SPL家族成員,并進(jìn)行生物信息學(xué)分析預(yù)測(cè)。結(jié)果表明,17個(gè)AmSPL蛋白分別由186～777個(gè)氨基酸組成,相對(duì)分子量從20.53～88.27ku。構(gòu)建AmSPL與擬南芥(Arabidopsis thaliana L.)16個(gè)AtSPL成員系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù),并根據(jù)AtSPLs基因家族的分類(lèi)標(biāo)準(zhǔn)將AmSPL成員分為6組。實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析表明,在黑暗條件下,AmSPLs的表達(dá)量均高于藍(lán)光下,推測(cè)AmSPLs的表達(dá)可能通過(guò)某種方式受到藍(lán)光的負(fù)調(diào)控。預(yù)測(cè)分析其中的8個(gè)AmSPL可能是miR156的靶基因。

【文章頁(yè)數(shù)】：11 頁(yè)

【部分圖文】：

圖4Am-miR156a-5p、Am-miR156-1與8個(gè)AmSPLs互補(bǔ)序列的序列比對(duì)

由圖4可知，17個(gè)AmSPL家族成員中有8個(gè)成員含有與miR156成熟體互補(bǔ)序列，分別為AmSPL1,AmSPL2,AmSPL4,AmSPL5,AmSPL6,AmSPL7,AmSPL8和AmSPL13，初步表明這8個(gè)AmSPLs可能是miR156的靶基因。2.5AmSPL基因家....

圖5莧菜AmSPLs的qRT-PCR定量結(jié)果與其對(duì)應(yīng)的FPKM值

目前基于全基因組研究的深入，越來(lái)越多物種的SPL基因家族被鑒定出來(lái)，其中擬南芥中發(fā)現(xiàn)16個(gè)，水稻19個(gè)，小麥58個(gè)，番茄15個(gè)。然而對(duì)于沒(méi)有全基因組的物種更多的是通過(guò)轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行分析鑒定。SPL是植物的特異性轉(zhuǎn)錄因子，含有高度保守的SBP結(jié)構(gòu)域[35]，它能夠與花分生組織中的特性基....

圖1AmSPL家族進(jìn)化樹(shù)（a）及蛋白結(jié)構(gòu)分析（b)

由圖3可知，33個(gè)SPL成員共分為6個(gè)組，GroupⅠ含有9個(gè)AmSPL家族蛋白，分別為AmSP4,AmSPL12,AmSPL14,AmSPL17,AmSPL2,AmSPL1,AmSPL15,AmSPL3和AmSPL16，并含有4個(gè)AtSPL家族蛋白；GroupⅡ含有Am....

圖2AmSPL家族蛋白SBP保守結(jié)構(gòu)域

圖1AmSPL家族進(jìn)化樹(shù)（a）及蛋白結(jié)構(gòu)分析（b)圖3‘全紅’莧菜（Am）與擬南芥（At)SPL家族蛋白系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)

本文編號(hào)：3897796