生長素外向轉(zhuǎn)運(yùn)體PIN (PIN-FORMED)蛋白是一種典型的跨膜運(yùn)輸?shù)鞍?通過參與植物體內(nèi)生長素的極性運(yùn)輸進(jìn)而在植物的生長發(fā)育過程中發(fā)揮重要作用。為弄清PIN蛋白在桃(Prunus persica)基因組中的分布、結(jié)構(gòu)及進(jìn)化,研究家族成員在不同樹型桃中的表達(dá)特性,利用擬南芥(Arabidopsis thaliana)已知的8個(gè)PIN蛋白和Mem_trans (PF03547)保守域從桃全基因組中進(jìn)行桃PIN蛋白基因家族成員鑒定,并利用TBtools v0.6733、GSDS 2.0、MEME 4.9、Protparam V12.1、MEGA 7.0、PlantCARE等生物信息學(xué)軟件對(duì)鑒定到的PpPIN蛋白基因家族成員進(jìn)行染色體定位、基因結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)理化性質(zhì)、motif基序、系統(tǒng)進(jìn)化和啟動(dòng)子順式作用元件分析;基于轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果和q RT-PCR對(duì)PpPINs基因在不同樹型桃中的表達(dá)特性進(jìn)行分析。本研究鑒定出15個(gè)PpPIN蛋白基因家族成員;15個(gè)PpPIN基因不均勻分布在桃6條染色體上,除PpPIN3和PpPIN5外,其余的PpPIN基因均含有內(nèi)含子,內(nèi)含子數(shù)量...

【文章頁數(shù)】：14 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 實(shí)驗(yàn)材料
    1.2 桃PIN蛋白基因家族成員鑒定
    1.3 桃PIN蛋白基因家族相關(guān)生物信息學(xué)分析及進(jìn)化樹構(gòu)建
    1.4 桃PIN蛋白家族基因在不同樹型桃中表達(dá)分析
    1.5 實(shí)時(shí)熒光定量PCR (q RT-PCR)
    1.6 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 桃PIN蛋白基因家族鑒定及序列分析
    2.2 桃PIN蛋白家族系統(tǒng)進(jìn)化分析
    2.3 桃PIN蛋白基因家族motif序列和基因結(jié)構(gòu)分析
    2.4 桃PIN蛋白基因家族啟動(dòng)子元件分析
    2.5 桃PIN蛋白基因家族表達(dá)分析
3 討論
4 結(jié)論



本文編號(hào)：3870966