根據(jù)甘薯[Ipomoea batatas(Linn.) Lam.]轉錄組數(shù)據(jù),從甘薯品種‘福菜薯7-6’(‘Fucaishu 7-6’)中克隆獲得1個編碼查爾酮異構酶的基因,命名為IbCHI;IbCHI基因全長732 bp,GC含量為55.19%,共編碼243個氨基酸。生物信息學分析結果表明:在IbCHI基因編碼的氨基酸序列第12至第214位包含1個Chalcone結構域;IbCHI蛋白分子式為C₁₁₅₆H₁₈₃₁N₂₉₁O₃₅₁S₇,理論相對分子質(zhì)量為25 646.41,理論等電點為pI 5.25,并可能具有1個跨膜螺旋區(qū),定位于細胞核和細胞膜上;其氨基酸序列中包含24個帶正電荷和27個帶負電荷的氨基酸殘基,丙氨酸、絲氨酸、纈氨酸和甘氨酸所占比例較高,半胱氨酸所占比例最低;IbCHI蛋白的不穩(wěn)定指數(shù)和總親水性平均系數(shù)分別為38.49和0.074,表明IbCHI蛋白是一種穩(wěn)定的親水性蛋白質(zhì);IbCHI蛋白二級結構中,α螺旋、隨機卷曲、延伸鏈和β轉角所占比例分別為39.51%、3...

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【文章目錄】：
1 材料和方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 總RNA提取和IbCHI基因克隆
        1.2.2 生物信息學分析
        1.2.3 qRT-PCR分析
        1.2.4 重組載體構建及亞細胞定位
    1.3 數(shù)據(jù)處理和分析
2 結果和分析
    2.1 IbCHI基因的克隆和生物信息學分析
        2.1.1 IbCHI基因克隆分析
        2.1.2 氨基酸序列的多重比對和同源性分析
        2.1.3 IbCHI蛋白的結構和理化性質(zhì)
        2.1.4 IbCHI基因啟動子區(qū)功能分析
    2.2 IbCHI基因的相對表達量分析
        2.2.1 IbCHI基因表達的組織特異性
        2.2.2 干旱和鹽脅迫對IbCHI基因相對表達量的影響
    2.3 IbCHI基因的亞細胞定位
3 討論和結論



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