龍眼胚性愈傷組織DRM1基因的克隆及其定位與表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2023-10-06 14:06
該研究以龍眼胚性愈傷組織的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),對(duì)龍眼胚性愈傷組織DlDRM1基因進(jìn)行克隆和生物學(xué)信息分析,并檢測(cè)其在體胚發(fā)生過程中不同發(fā)育階段、不同濃度的外源激素(2,4-D、IAA、KT)處理下及不同組織部位的表達(dá),以揭示DlDRM1基因在龍眼體胚發(fā)生過程中的功能。結(jié)果表明:(1)從龍眼轉(zhuǎn)錄組unigene序列篩選獲得龍眼結(jié)構(gòu)域重排甲基化酶1基因(命名為DlDRM1)全長序列,并利用RT-PCR法從‘紅核子’龍眼胚性愈傷組織中克隆獲得DlDRM1基因的cDNA全長序列(GenBank登錄號(hào)為KY990493);DlDRM1基因cDNA全長2 574bp,包括494bp的5′UTR,184bp的3′UTR,可編碼包含631個(gè)氨基酸的蛋白質(zhì)。(2)生物信息學(xué)分析顯示,DlDRM1是一個(gè)不穩(wěn)定的親水蛋白,不含信號(hào)肽,不存在跨膜結(jié)構(gòu)域,其分子式為C3104H4839N851O984S28;序列比對(duì)和系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,龍眼DlDRM1與臍橙DRM相似度最高(76.85%),二者親緣關(guān)系也...
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
1 材料和方法
1.1 材料
1.2 方法
1.2.1 激素處理龍眼胚性愈傷組織
1.2.2 總RNA提取及逆轉(zhuǎn)錄
1.2.3 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析及DlDRM1基因序列的獲得
1.2.4 引物設(shè)計(jì)
1.2.5 目的基因的擴(kuò)增
1.2.6 生物信息分析
1.2.7 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
1.2.8 洋蔥亞細(xì)胞定位
2 結(jié)果與分析
2.1 龍眼DlDRM1基因cDNA全長序列的獲得與驗(yàn)證
2.2 龍眼DlDRM1生物信息學(xué)分析
2.3 龍眼DlDRM1氨基酸序列比對(duì)及進(jìn)化分析
2.4 龍眼DlDRM1基因轉(zhuǎn)錄水平的qPCR分析
2.4.1 DlDRM1在‘四季蜜’龍眼不同組織部位中的表達(dá)情況
2.4.2 DlDRM1在龍眼非胚性和胚性培養(yǎng)物中轉(zhuǎn)錄水平的qPCR分析
2.4.3 DlDRM1在不同外源激素 (IAA、KT、2, 4-D) 處理下的表達(dá)模式
2.5 龍眼DlDRM1的亞細(xì)胞定位分析
3 討論
3.1 DlDRM1是一個(gè)定位于細(xì)胞膜和細(xì)胞核的含泛素結(jié)合域的蛋白
3.2 DlDRM1在龍眼體胚發(fā)生過程中發(fā)揮著重要調(diào)控作用
3.3 DlDRM1的表達(dá)受生長素和細(xì)胞分裂素調(diào)控
本文編號(hào):3851846
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【文章目錄】:
1 材料和方法
1.1 材料
1.2 方法
1.2.1 激素處理龍眼胚性愈傷組織
1.2.2 總RNA提取及逆轉(zhuǎn)錄
1.2.3 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析及DlDRM1基因序列的獲得
1.2.4 引物設(shè)計(jì)
1.2.5 目的基因的擴(kuò)增
1.2.6 生物信息分析
1.2.7 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
1.2.8 洋蔥亞細(xì)胞定位
2 結(jié)果與分析
2.1 龍眼DlDRM1基因cDNA全長序列的獲得與驗(yàn)證
2.2 龍眼DlDRM1生物信息學(xué)分析
2.3 龍眼DlDRM1氨基酸序列比對(duì)及進(jìn)化分析
2.4 龍眼DlDRM1基因轉(zhuǎn)錄水平的qPCR分析
2.4.1 DlDRM1在‘四季蜜’龍眼不同組織部位中的表達(dá)情況
2.4.2 DlDRM1在龍眼非胚性和胚性培養(yǎng)物中轉(zhuǎn)錄水平的qPCR分析
2.4.3 DlDRM1在不同外源激素 (IAA、KT、2, 4-D) 處理下的表達(dá)模式
2.5 龍眼DlDRM1的亞細(xì)胞定位分析
3 討論
3.1 DlDRM1是一個(gè)定位于細(xì)胞膜和細(xì)胞核的含泛素結(jié)合域的蛋白
3.2 DlDRM1在龍眼體胚發(fā)生過程中發(fā)揮著重要調(diào)控作用
3.3 DlDRM1的表達(dá)受生長素和細(xì)胞分裂素調(diào)控
本文編號(hào):3851846
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