肌動蛋白解聚因子(actin-depolymerizing factors, ADFs)通過剪切和解聚微絲來調(diào)控微絲組織和動態(tài),被認為是肌動蛋白變化的重要調(diào)控因子。通過RT-PCR方法擴增得到甜瓜ADF7(CmADF7)基因序列,進行生物信息學分析和組織表達分析。結(jié)果表明CmADF7基因的開放閱讀框(ORF)為414 bp,編碼137個氨基酸,蛋白質(zhì)理論分子量15.82102 kD,等電點5.32。生物信息學預測該蛋白是不具有跨膜結(jié)構(gòu)的疏水性蛋白,亞細胞定位于細胞質(zhì)中。基因結(jié)構(gòu)分析顯示CmADF7包含3個外顯子,2個內(nèi)含子,其中第1位外顯子僅包含起始密碼子ATG。結(jié)構(gòu)域分析表明CmADF7具有高度保守的ADF-H結(jié)構(gòu)域,其氨基酸序列為12～137位。同源性與系統(tǒng)進化分析證明CmADF7與同屬葫蘆科的西瓜的同源ADF親緣關系較近。利用qRT-PCR分析發(fā)現(xiàn)CmADF7基因主要在花中表達,其他組織中檢測雖有表達,但表達量都很低。序列分析表明,CmADF7啟動子上存在一些參與光響應、脅迫應答及激素調(diào)節(jié)等相關順式作用元件。新的甜瓜ADF蛋白結(jié)構(gòu)和組織表達研究,將為進一步探索CmADF7蛋白功能...

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 Cm ADF7基因的分離
        1.2.2 生物信息學分析
        1.2.3 q RT-PCR分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 Cm ADF7的克隆及基因結(jié)構(gòu)的分析
    2.2 推導的氨基酸序列比對與進化分析
    2.3 Cm ADF7基因編碼蛋白序列預測與結(jié)構(gòu)分析
        2.3.1 蛋白質(zhì)理化特性
        2.3.2 蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)預測
        2.3.3 蛋白質(zhì)的跨膜結(jié)構(gòu)及保守結(jié)構(gòu)域分析
    2.4 Cm ADF7基因組織表達分析
    2.5 Cm ADF7啟動子的生物信息學分析
3 討論與結(jié)論



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