越來越多的證據(jù)表明,失調(diào)的腸道菌群是引發(fā)肥胖及其相關(guān)慢性代謝性疾病的一個重要病理原因。我們之前對Prader-Willi syndrome(PWS)遺傳性肥胖兒童膳食干預(yù)臨床試驗的結(jié)果指出,患者健康指數(shù)的改善與他們腸道菌群明顯的轉(zhuǎn)變相關(guān)。將其中一名PWS兒童膳食干預(yù)前和膳食干預(yù)后的腸道菌群分別移植給兩組無菌小鼠,分別被稱為pre組和post組。與post組相比,移植了同一PWS兒童膳食干預(yù)前失調(diào)的腸道菌群的pre組有著更強的炎癥反應(yīng)和更多的脂肪積累。本研究利用RNA-seq技術(shù)對這兩組小鼠在菌群移植后兩周和四周時結(jié)腸和肝臟miRNA和基因的表達(dá)情況進(jìn)行觀察,以post組作為對照,干預(yù)前失調(diào)的腸道菌群引起了pre組小鼠miRNA和基因不同的表達(dá),且差異表達(dá)的miRNA和基因集中在菌群移植后兩周時。對篩選出來的差異表達(dá)的miRNA的有效的靶基因進(jìn)行富集分析,大部分被顯著富集的GO生物學(xué)過程和KEGG通路是在肝臟兩周時找到的。我們篩選出了與小鼠表型差異相關(guān)的23個關(guān)鍵基因和調(diào)控它們的73個miRNA,并構(gòu)建了在失調(diào)的腸道菌群的壓力下miRNA-基因-生物學(xué)功能的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。該網(wǎng)絡(luò)中包含了92對...

【文章頁數(shù)】：85 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1.1 腸道菌群與肥胖及其相關(guān)代謝性疾病的關(guān)系
        1.1.1 肥胖的流行和危害
        1.1.2 腸道菌群概述
        1.1.3 失調(diào)的腸道菌群是肥胖及其相關(guān)代謝性疾病的重要誘因
    1.2 miRNA 概述
        1.2.1 miRNA簡介
        1.2.2 miRNA表達(dá)水平的檢測方法
        1.2.3 miRNA靶基因的預(yù)測方法
    1.3 腸道菌群與宿主miRNA之間關(guān)系的研究進(jìn)展
    1.4 本研究的背景和目的
第二章 來自同一遺傳性肥胖兒童不同健康狀態(tài)的腸道菌群能夠引起無菌小鼠結(jié)腸和肝臟miRNA和基因不同的表達(dá)
    引言
    2.1 材料和方法
        2.1.1 動物實驗
        2.1.2 miRNA測序
        2.1.3 轉(zhuǎn)錄組測序
        2.1.4 miRNA表達(dá)譜的獲取
        2.1.5 基因表達(dá)譜的獲取
        2.1.6 差異表達(dá)分析
    2.2 實驗結(jié)果
        2.2.1 miRNA測序數(shù)據(jù)質(zhì)控、預(yù)處理和比對結(jié)果
        2.2.2 轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)質(zhì)控、預(yù)處理和比對結(jié)果
        2.2.3 兩組小鼠之間差異表達(dá)的miRNA和基因
    2.3 討論
第三章 來自遺傳性肥胖兒童失調(diào)的腸道菌群在引發(fā)小鼠炎癥和脂質(zhì)積累過程中結(jié)腸和肝臟的miRNA-基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
    引言
    3.1 材料和方法
        3.1.1 材料
        3.1.2 靶基因預(yù)測
        3.1.3 GO和 KEGG富集分析
        3.1.4 關(guān)鍵基因的提取和功能注釋
        3.1.5 miRNA、基因和生物學(xué)功能調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建
        3.1.6 miRNA和基因與生化指標(biāo)的相關(guān)分析
    3.2 實驗結(jié)果
        3.2.1 受差異表達(dá)的miRNA調(diào)控的有效的靶基因
        3.2.2 有效的靶基因顯著富集的GO生物學(xué)過程和KEGG通路
        3.2.3 與宿主脂質(zhì)和膽固醇代謝、葡萄糖穩(wěn)態(tài)和炎癥有關(guān)的miRNA-靶基因-生物學(xué)功能調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
        3.2.4 miRNA和基因的表達(dá)與小鼠表型的相關(guān)性
    3.3 討論
總結(jié)
參考文獻(xiàn)
附表1 各樣本miRNA測序、預(yù)處理和比對的詳細(xì)情況
附表2 各樣本轉(zhuǎn)錄組測序、預(yù)處理和比對的詳細(xì)情況
附表3 差異表達(dá)的miRNA的有效的靶基因
附表4 網(wǎng)絡(luò)圖中92對miRNA和基因相關(guān)分析的詳細(xì)結(jié)果
附錄1 英文縮寫和全稱
致謝
研究生期間已發(fā)表或待發(fā)表的論文
學(xué)術(shù)會議論文



本文編號：3780081