棉花GhGA20ox1基因的克隆及表達(dá)研究
發(fā)布時(shí)間:2022-12-22 18:59
棉花是一種重要的經(jīng)濟(jì)作物,具有十分明顯的雜種優(yōu)勢(shì)。但目前我國(guó)棉花雜種優(yōu)勢(shì)的利用和基礎(chǔ)研究相對(duì)滯后。植物雄性不育是雜種優(yōu)勢(shì)利用的基礎(chǔ),其產(chǎn)生的機(jī)理極其復(fù)雜,至今尚未得到完全解析。本研究以棉花細(xì)胞質(zhì)雄性不育系晉A及其同核異質(zhì)保持系不同發(fā)育時(shí)期的花蕾為研究材料,克隆GA20-氧化酶1基因(GhGA20ox1),并對(duì)其進(jìn)行生物信息學(xué)分析,通過對(duì)赤霉素20氧化酶1基因在棉花不育系和保持系中的差異研究,探討棉花GA20ox1在植株生長(zhǎng)和發(fā)育過程中的生物學(xué)功能,為研究赤霉素20-氧化酶1基因與CMS的相關(guān)性及解析GA對(duì)棉花花藥發(fā)育調(diào)控機(jī)制提供基礎(chǔ)。研究結(jié)果如下:1.采用同源克隆的方法,克隆獲得棉花GhGA20ox1基因cDNA及基因組DNA全長(zhǎng)序列,并進(jìn)行生物信息學(xué)分析。棉花晉A不育系及其保持系GhGA20ox1基因cDNA均為1107 bp,編碼368 aa;基因組DNA全長(zhǎng)均為1707 bp,均由3個(gè)外顯子和2個(gè)內(nèi)含子組成。通過蛋白多序列比對(duì)分析發(fā)現(xiàn)GhGA20ox1蛋白的保守性一般,僅在保守結(jié)構(gòu)域內(nèi)相對(duì)保守。2.采用qRT-PCR對(duì)棉花晉A不育系及其保持系小孢子敗育前、敗育時(shí)期和敗育后時(shí)期的G...
【文章頁(yè)數(shù)】:46 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
英文縮略詞及中文對(duì)照
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 棉花概述
2 細(xì)胞質(zhì)雄性不育研究進(jìn)展
2.1 細(xì)胞質(zhì)雄性不育
2.2 棉花中細(xì)胞質(zhì)雄性不育的研究進(jìn)展
3 赤霉素的研究進(jìn)展
3.1 赤霉素簡(jiǎn)介
3.2 赤霉素的生物學(xué)功能
3.3 赤霉素合成關(guān)鍵酶
4 GA功能研究及與CMS的關(guān)系
5 本研究的目的意義
6 技術(shù)路線
第二章 GhGA20ox1基因的克隆與生物信息學(xué)分析
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 RNA提取材料
1.1.2 DNA提取材料
1.2 實(shí)驗(yàn)試劑與儀器
1.2.1 實(shí)驗(yàn)試劑
1.2.2 實(shí)驗(yàn)儀器
1.3 實(shí)驗(yàn)方法
1.3.1 引物設(shè)計(jì)
1.3.2 DNA的提取
1.3.3 RNA的提取
1.3.4 cDNA序列的合成
1.3.5 PCR擴(kuò)增反應(yīng)
1.3.6 瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)
1.3.7 切膠回收
1.3.8 連接與轉(zhuǎn)化
1.3.9 序列生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 棉花GhGA20ox1基因cDNA克隆
2.1.1 RNA質(zhì)量檢測(cè)
2.1.2 棉花GhGA20ox1基因cDNA克隆的電泳檢測(cè)
2.1.3 晉A不育系及其保持系中GhGA20ox1基因cDNA測(cè)序結(jié)果分析
2.2 棉花GhGA20ox1基因基因組DNA克隆
2.2.1 提取的DNA質(zhì)量檢測(cè)
2.2.2 棉花GhGA20ox1基因基因組DNA克隆的電泳檢測(cè)
2.2.3 棉花GhGA20ox1基因基因組DNA測(cè)序結(jié)果
2.3 棉花GhGA20ox1基因序列結(jié)構(gòu)分析
2.3.1 棉花GhGA20ox1基因結(jié)構(gòu)分析
2.3.2 棉花GhGA20ox1基因堿基組成分析
2.4 棉花GhGA20ox1基因生物信息學(xué)分析
2.4.1 GhGA20ox1基因編碼的蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)及蛋白質(zhì)保守結(jié)構(gòu)域分析
2.4.2 理化性質(zhì)預(yù)測(cè)
2.4.3 GhGA20ox1蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
2.4.4 GhGA20ox1基因編碼的蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
2.4.5 系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建
2.5 討論
第三章 GhGA20ox1基因表達(dá)分析
1 材料與方法
1.1 供試材料
1.1.1 花蕾的采集
1.1.2 花蕾發(fā)育時(shí)期的劃分
1.2 主要試劑和儀器
1.2.1 主要試劑
1.2.2 實(shí)驗(yàn)儀器
1.3 試驗(yàn)方法
1.3.1 總RNA提取
1.3.2 RNA條帶檢測(cè)與濃度測(cè)定
1.3.3 引物設(shè)計(jì)
1.3.4 qRT-PCR cDNA第一鏈合成
1.3.5 定量引物檢測(cè)
1.3.6 qRT-PCR體系配置
1.3.7 數(shù)據(jù)處理
2 結(jié)果與分析
3 討論
第四章 全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
Abstract
附錄
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]油菜細(xì)胞質(zhì)雄性不育與線粒體基因組研究進(jìn)展[J]. 衡雙平,魏超,張少恒,傅廷棟,沈金雄. 中國(guó)油料作物學(xué)報(bào). 2018(01)
[2]水稻細(xì)胞質(zhì)雄性不育及育性恢復(fù)研究進(jìn)展[J]. 劉石鋒,陳倩,洪廣成,胡駿,秦小健. 植物生理學(xué)報(bào). 2018(01)
[3]赤霉素與小麥生理型雄性不育的關(guān)系[J]. 巴青松,張改生,李桂萍,張根生,周麗娟,宋運(yùn)賢,陳楚,傅兆麟. 麥類作物學(xué)報(bào). 2017(03)
[4]西洋參赤霉素20-氧化酶基因的克隆與序列分析[J]. 孫同玉,祝娟,孫鵬,廖登群,李先恩,祁建軍. 中草藥. 2015(11)
[5]玉米CMS-C不育系及保持系vdac基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 王繼玥,汪生慶,曹墨菊. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2014(07)
[6]水稻雄配子不育突變體mga36的鑒定與初步分析[J]. 楊紹華,陳睿,劉華清,周淑芬,王鋒. 福建農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2012(10)
[7]油菜雄性不育系160S育性轉(zhuǎn)換中保護(hù)酶活性變化[J]. 沈亮余,李榮沖,王瑞雪,鄒燕,張濤,龔慧明. 重慶師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2012(01)
[8]水稻細(xì)胞質(zhì)雄性不育育性恢復(fù)研究進(jìn)展[J]. 張金偉,謝建坤,李霞,萬(wàn)勇,羅向東. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(31)
[9]棉花細(xì)胞質(zhì)雄性不育研究進(jìn)展[J]. 趙海燕,黃晉玲. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2010(07)
[10]小麥TaGA20ox2基因的克隆及分析[J]. 武晶,孔秀英,高麗峰,任正隆,賈繼增. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2009(10)
博士論文
[1]馬鈴薯赤霉素合成代謝途徑關(guān)鍵酶基因GA2ox1、GA20ox1的克隆與功能分析[D]. 石建斌.青海大學(xué) 2016
碩士論文
[1]三裂棉D(zhuǎn)8細(xì)胞質(zhì)雄性不育系Zhong41A敗育機(jī)理的研究[D]. 楊黎.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]赤霉素對(duì)蓮株型影響及其相關(guān)基因克隆與時(shí)空表達(dá)分析[D]. 李四游.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[3]谷子萌發(fā)過程中貯藏物質(zhì)變化及赤霉素代謝關(guān)鍵酶基因表達(dá)的分析[D]. 柯貞進(jìn).山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[4]棉花溫敏雄性不育系特棉S-1生長(zhǎng)發(fā)育及育性轉(zhuǎn)換規(guī)律研究[D]. 唐海明.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
本文編號(hào):3723857
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【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
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第一章 文獻(xiàn)綜述
1 棉花概述
2 細(xì)胞質(zhì)雄性不育研究進(jìn)展
2.1 細(xì)胞質(zhì)雄性不育
2.2 棉花中細(xì)胞質(zhì)雄性不育的研究進(jìn)展
3 赤霉素的研究進(jìn)展
3.1 赤霉素簡(jiǎn)介
3.2 赤霉素的生物學(xué)功能
3.3 赤霉素合成關(guān)鍵酶
4 GA功能研究及與CMS的關(guān)系
5 本研究的目的意義
6 技術(shù)路線
第二章 GhGA20ox1基因的克隆與生物信息學(xué)分析
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 RNA提取材料
1.1.2 DNA提取材料
1.2 實(shí)驗(yàn)試劑與儀器
1.2.1 實(shí)驗(yàn)試劑
1.2.2 實(shí)驗(yàn)儀器
1.3 實(shí)驗(yàn)方法
1.3.1 引物設(shè)計(jì)
1.3.2 DNA的提取
1.3.3 RNA的提取
1.3.4 cDNA序列的合成
1.3.5 PCR擴(kuò)增反應(yīng)
1.3.6 瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)
1.3.7 切膠回收
1.3.8 連接與轉(zhuǎn)化
1.3.9 序列生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 棉花GhGA20ox1基因cDNA克隆
2.1.1 RNA質(zhì)量檢測(cè)
2.1.2 棉花GhGA20ox1基因cDNA克隆的電泳檢測(cè)
2.1.3 晉A不育系及其保持系中GhGA20ox1基因cDNA測(cè)序結(jié)果分析
2.2 棉花GhGA20ox1基因基因組DNA克隆
2.2.1 提取的DNA質(zhì)量檢測(cè)
2.2.2 棉花GhGA20ox1基因基因組DNA克隆的電泳檢測(cè)
2.2.3 棉花GhGA20ox1基因基因組DNA測(cè)序結(jié)果
2.3 棉花GhGA20ox1基因序列結(jié)構(gòu)分析
2.3.1 棉花GhGA20ox1基因結(jié)構(gòu)分析
2.3.2 棉花GhGA20ox1基因堿基組成分析
2.4 棉花GhGA20ox1基因生物信息學(xué)分析
2.4.1 GhGA20ox1基因編碼的蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)及蛋白質(zhì)保守結(jié)構(gòu)域分析
2.4.2 理化性質(zhì)預(yù)測(cè)
2.4.3 GhGA20ox1蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
2.4.4 GhGA20ox1基因編碼的蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
2.4.5 系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建
2.5 討論
第三章 GhGA20ox1基因表達(dá)分析
1 材料與方法
1.1 供試材料
1.1.1 花蕾的采集
1.1.2 花蕾發(fā)育時(shí)期的劃分
1.2 主要試劑和儀器
1.2.1 主要試劑
1.2.2 實(shí)驗(yàn)儀器
1.3 試驗(yàn)方法
1.3.1 總RNA提取
1.3.2 RNA條帶檢測(cè)與濃度測(cè)定
1.3.3 引物設(shè)計(jì)
1.3.4 qRT-PCR cDNA第一鏈合成
1.3.5 定量引物檢測(cè)
1.3.6 qRT-PCR體系配置
1.3.7 數(shù)據(jù)處理
2 結(jié)果與分析
3 討論
第四章 全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
Abstract
附錄
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]油菜細(xì)胞質(zhì)雄性不育與線粒體基因組研究進(jìn)展[J]. 衡雙平,魏超,張少恒,傅廷棟,沈金雄. 中國(guó)油料作物學(xué)報(bào). 2018(01)
[2]水稻細(xì)胞質(zhì)雄性不育及育性恢復(fù)研究進(jìn)展[J]. 劉石鋒,陳倩,洪廣成,胡駿,秦小健. 植物生理學(xué)報(bào). 2018(01)
[3]赤霉素與小麥生理型雄性不育的關(guān)系[J]. 巴青松,張改生,李桂萍,張根生,周麗娟,宋運(yùn)賢,陳楚,傅兆麟. 麥類作物學(xué)報(bào). 2017(03)
[4]西洋參赤霉素20-氧化酶基因的克隆與序列分析[J]. 孫同玉,祝娟,孫鵬,廖登群,李先恩,祁建軍. 中草藥. 2015(11)
[5]玉米CMS-C不育系及保持系vdac基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 王繼玥,汪生慶,曹墨菊. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2014(07)
[6]水稻雄配子不育突變體mga36的鑒定與初步分析[J]. 楊紹華,陳睿,劉華清,周淑芬,王鋒. 福建農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2012(10)
[7]油菜雄性不育系160S育性轉(zhuǎn)換中保護(hù)酶活性變化[J]. 沈亮余,李榮沖,王瑞雪,鄒燕,張濤,龔慧明. 重慶師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2012(01)
[8]水稻細(xì)胞質(zhì)雄性不育育性恢復(fù)研究進(jìn)展[J]. 張金偉,謝建坤,李霞,萬(wàn)勇,羅向東. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(31)
[9]棉花細(xì)胞質(zhì)雄性不育研究進(jìn)展[J]. 趙海燕,黃晉玲. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2010(07)
[10]小麥TaGA20ox2基因的克隆及分析[J]. 武晶,孔秀英,高麗峰,任正隆,賈繼增. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2009(10)
博士論文
[1]馬鈴薯赤霉素合成代謝途徑關(guān)鍵酶基因GA2ox1、GA20ox1的克隆與功能分析[D]. 石建斌.青海大學(xué) 2016
碩士論文
[1]三裂棉D(zhuǎn)8細(xì)胞質(zhì)雄性不育系Zhong41A敗育機(jī)理的研究[D]. 楊黎.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]赤霉素對(duì)蓮株型影響及其相關(guān)基因克隆與時(shí)空表達(dá)分析[D]. 李四游.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[3]谷子萌發(fā)過程中貯藏物質(zhì)變化及赤霉素代謝關(guān)鍵酶基因表達(dá)的分析[D]. 柯貞進(jìn).山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[4]棉花溫敏雄性不育系特棉S-1生長(zhǎng)發(fā)育及育性轉(zhuǎn)換規(guī)律研究[D]. 唐海明.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
本文編號(hào):3723857
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