目的分析比較不同腫瘤基質(zhì)評分胃癌患者的基因表達特征,鑒定與評分相關的胃癌預后基因,以期為臨床胃癌診斷和預后提供更精準的手段。方法從癌癥基因組圖譜數(shù)據(jù)庫（the cancer genome atals, TCGA）下載胃癌的臨床資料和組織轉錄組測序（ribonucleic acid sequencing, RNAseq）表達數(shù)據(jù)。從基質(zhì)免疫評估數(shù)據(jù)庫（estimation of stromal and immune cells in malignant tumor tissues using expression data, ESTIMATE）網(wǎng)站下載TCGA數(shù)據(jù)庫中胃癌患者基質(zhì)評分信息。獲取患者的臨床信息、RNAseq表達譜、基質(zhì)評分。按照基質(zhì)評分的高低分為高基質(zhì)評分組和低基質(zhì)評分組,分析基質(zhì)評分與胃癌預后的關系。用R語言DEseq2包進行標準化處理和差異分析;WGCNA（weight correlation network analysis, WGCNA）包篩選與基質(zhì)評分密切相關的差異基因;單因素COX風險比例回歸模型（COX proportional model, COX）初步篩選... 

【文章頁數(shù)】：8 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 數(shù)據(jù)提取
    1.2 觀察基質(zhì)評分與預后的關系
    1.3 差異表達和共表達網(wǎng)絡
    1.4 基因功能和基因臨床模型的構建
    1.5 外部數(shù)據(jù)庫驗證
    1.6 統(tǒng)計學處理
2 結 果
    2.1 基質(zhì)評分和患者預后的相關性分析
    2.2 與胃癌患者基質(zhì)評分密切相關的基因篩查分析
    2.3 胃癌預后相關基因的篩選,及臨床預測模型的構建
    2.4 臨床預測模型的大數(shù)據(jù)驗證
3 討 論


【參考文獻】：
期刊論文
[1]術前血清前白蛋白水平與直腸癌NOSES術后住院時間的相關性[J]. 李雪冬,傅傳剛,杜濤,韓俊毅,魯兵,周主青.  同濟大學學報(醫(yī)學版). 2019(06)
[2]多變量回歸模型分析應用概述[J]. 于石成,亓曉,胡躍華,鄭文靜,王琦琦,么鴻雁.  中華預防醫(yī)學雜志. 2019 (03)



本文編號：3709846