目的分析比較不同腫瘤基質(zhì)評(píng)分胃癌患者的基因表達(dá)特征,鑒定與評(píng)分相關(guān)的胃癌預(yù)后基因,以期為臨床胃癌診斷和預(yù)后提供更精準(zhǔn)的手段。方法從癌癥基因組圖譜數(shù)據(jù)庫(kù)（the cancer genome atals, TCGA）下載胃癌的臨床資料和組織轉(zhuǎn)錄組測(cè)序（ribonucleic acid sequencing, RNAseq）表達(dá)數(shù)據(jù)。從基質(zhì)免疫評(píng)估數(shù)據(jù)庫(kù)（estimation of stromal and immune cells in malignant tumor tissues using expression data, ESTIMATE）網(wǎng)站下載TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中胃癌患者基質(zhì)評(píng)分信息。獲取患者的臨床信息、RNAseq表達(dá)譜、基質(zhì)評(píng)分。按照基質(zhì)評(píng)分的高低分為高基質(zhì)評(píng)分組和低基質(zhì)評(píng)分組,分析基質(zhì)評(píng)分與胃癌預(yù)后的關(guān)系。用R語(yǔ)言DEseq2包進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化處理和差異分析;WGCNA（weight correlation network analysis, WGCNA）包篩選與基質(zhì)評(píng)分密切相關(guān)的差異基因;單因素COX風(fēng)險(xiǎn)比例回歸模型（COX proportional model, COX）初步篩選... 

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 數(shù)據(jù)提取
    1.2 觀察基質(zhì)評(píng)分與預(yù)后的關(guān)系
    1.3 差異表達(dá)和共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)
    1.4 基因功能和基因臨床模型的構(gòu)建
    1.5 外部數(shù)據(jù)庫(kù)驗(yàn)證
    1.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
2 結(jié) 果
    2.1 基質(zhì)評(píng)分和患者預(yù)后的相關(guān)性分析
    2.2 與胃癌患者基質(zhì)評(píng)分密切相關(guān)的基因篩查分析
    2.3 胃癌預(yù)后相關(guān)基因的篩選,及臨床預(yù)測(cè)模型的構(gòu)建
    2.4 臨床預(yù)測(cè)模型的大數(shù)據(jù)驗(yàn)證
3 討 論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]術(shù)前血清前白蛋白水平與直腸癌NOSES術(shù)后住院時(shí)間的相關(guān)性[J]. 李雪冬,傅傳剛,杜濤,韓俊毅,魯兵,周主青.  同濟(jì)大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2019(06)
[2]多變量回歸模型分析應(yīng)用概述[J]. 于石成,亓?xí)?胡躍華,鄭文靜,王琦琦,么鴻雁.  中華預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志. 2019 (03)



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